Three pigmented strains of halophilic archaea (RS75, RS77, RS79) were isolated from the monoliths of mottled sylvinite from the Verkhnekamsk salt deposit (Solikamsk, Russia). The cells were nonmotile, gram-negative, pleomorphic, disk-shaped or ovoid, 0.8-1.0 × 1.5-2.5 μm. The organism was a chemoorganotrophic obligate aerobe producing catalase and oxidase. A number of carbohydrates and carboxylic acids were used as growth substrates. Growth occurred in the presence of 7-27% NaCl (with the optimum at 15-18%), 0.02-20% KCl (0.2-1%), 0.2-16% MgCl2 (2-3%), in the temperature range from 23 to 51 °C (40-45 °C), and pH 5.5-8.0 (6.8-7.0). The membranes contained carotenoids of the bacterioruberin series. Phosphatidylglyceromethylphosphate (PGP-Me), phosphatidylglycerol (PG), sulfated diglycosyl diether (S-DGD-1) predominated among the polar lipids. The DNA G + C content was 64.0-65.0 mol %. Phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene sequences showed high similarity of the new strains to Haloferax species: H. denitrificans (99.2%) and H. volcanii (99.1%), H. larsenii (96.9%) and H. elongans (96.6%). DNA-DNA hybridization revealed 93-95% similarity between strain RS75 and strains RS77 and RS79; the similarity levels between strain RS75 and the type strains of Haloferax denitrificans VKM B-1754(T) and Halobacterium salinarum VKM B-1769(T) were 50 and 10%, respectively. According to its phenotypic and genotypic characteristics, the organism was classified as a member of the genus Haloferax, forming a new species with the proposed name Haloferax chudinovii sp. nov. type strain is RS75(T) (=VKPM B-11279(T)).
Для объяснения происхождения универсального генетического кода выдвинут ряд взаимодополняющих гипотез от «замерзшей случайности» до представлений о коэволюции кодонов с путями синтеза аминокислот. Слабее изучены факторы отбора необходимых компонентов для создания прообраза генетического кода от абиогенеза до начальных биогенных стадий. Первичный отбор минимального числа биомономеров (достаточных для поэтапной самоорганизации генетического кода) из хаотичного многообразия органических соединений мог происходить в зависимости от их молекулярной массы (М), температуры плавления (t пл), растворимости в воде, структуры и элементного состава-основы любого соединения. На диаграммах в координатах M и t пл протеиногенные аминокислоты вместе с кодирующими их кодонами располагаются согласованно относительно четко обособленных семейств пуриновых и пиримидиновых оснований. Подтверждены коэволюционные связи кодонов с путями синтеза аминокислот и с хронологией их появления в коде. Эволюционный отбор термостойких протобиомономеров сопровождался замещением атомов кислорода атомами азота от простых питательных веществ к аминокислотам и азотистым основаниям. Показано, что элементному составу M и t пл при первичном дифференцированном отборе протобиомономеров и их пространственных изомеров принадлежала исключительно важная роль. Причем в данной работе впервые рассмотрена t пл протобиомономеров в качестве детерминирующего фактора отбора специфических компонентов при возникновении генетического кода.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.