O presente trabalho tem como objetivo mapear nos projetos de extensão da Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB), do Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas (CCAAB) e do Centro de Ciência e Tecnologia em Energia e Sustentabilidade (CETENS) com potencialidade de aplicação do conhecimento e desenvolvimento de técnicas, métodos, produtos, processos e serviços inovadores em biotecnologia sustentável e empreendedorismo social. O presente artigo tem como mérito apresentar a relação entre extensão universitária, biotecnologia e empreendedorismo social para o fortalecimento da bioeconomia dos territórios baianos, visto que a UFRB tem por missão formar cidadãos criativos, empreendedores e inovadores, promovendo a inclusão e valorizando as culturas locais. A pesquisa realizada selecionou 31 projetos de extensão aprovados pelo CCAAB e CETENS implementados nos anos de 2022 e 2023 que tratam das temáticas da biotecnologia com potencial em desenvolver produtos e processos com foco no empreendedorismo social. A biotecnologia apresenta-se como propulsora para a inovação em diferentes áreas do conhecimento, o que demonstra o potencial para criação de negócios sociais que edifique as oportunidades e fomente a conexão entre as cadeias produtivas sustentáveis e regenerativas dos territórios de identidade para o estímulo da bioeconomia local.