El avance de la tecnología digital ha permitido concebir Sistemas de Vigilancia Epidemiológicos (SVE) automatizados con un enfoque <em>holístico-sistémico</em> favoreciendo la planeación, operación, gestión y procesamiento de datos fitosanitarios de manera efectiva y oportuna para toma de decisiones en la prevención y manejo regional de plagas. Este tipo de sistemas se enfocan en la salud del cultivo superando la visión reduccionista de plaga en la vigilancia normativa convencional. Un SVE web implica la definición clara del marco regional, objetivos, plaga(s) en su amplia acepción, recursos humanos/financieros, contexto normativo, líneas de investigación de soporte, estructura operativa y modelos de innovación. Estos elementos determinan la precisión, frecuencia y tipo de muestreo y monitoreo, así como las variables de medición relativas a un novel<em> sistema epidemiológico</em>. A diferencia de la vigilancia normativa, un SVE web <em>holístico-sistémico</em> tiene capacidad descriptiva y de pronóstico de riesgos, incluyendo alertas tempranas a partir de análisis espaciales y temporales. La interfaz web SVE asegura la generación flexible y dinámica de reportes y/o análisis automatizados. Un SVE operado en plataformas web, con énfasis en lenguajes de programación y herramientas de uso libre puede ser alojado en servidores genéricos o dedicados para almacenamiento de metadatos configurados con tecnologías Linux/Apache y funcionalidad 24/7 (h día-1). Programas de uso libre incluyen MySQL/MariaDB y otros como gestores de bases de datos; PHP / Node.js, y JavaScript, Ajax, HTML5 y CSS, como tecnologías web de maquetado base ‘back-end’ y ‘front-end’, respectivamente. Esta revisión se enfoca en principios, atributos conceptuales, enfoques metodológicos generales y objetivos de SVE base web. Aplicaciones generales se ilustran con un SVE desarrollado en México para el cafeto (<em>Coffea</em> spp.), el cual permitió operar la vigilancia de 19 plagas, nueve con estatus cuarentenario, mediante la generación, gestión y análisis de 87.4 y 15.7 millones de registros climáticos y epidemiológicos, respectivamente, obtenidos entre 2013-2019.

Huanglongbing (HLB), a recent worldwide spreading disease on citrus, was detected in July 2009 in Yucatan State of Mexico. The objective of this study was to evaluate the fit of diffusion and classic disease gradient models to large-scale HLB spatial data originated from initial foci to improve sampling, monitoring, and control strategies for Diaphorina citri, vector of Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas), putative agent of HLB. Four transect routes were selected: Yuc-1, Yuc-2, QRoo-1, and QRoo-2, based on the directionality of the prevailing winds and foci location of HLB infected plants. In these routes, 35 sites, 5 to 20 km apart, were selected for monthly evaluation during a 12-month period. A 10-insect sample and disease incidence and severity of HLB, further confirmed by PCR, were assessed per site. Mexican lime was more vulnerable (67.5%) than sweet orange (14%). Also, leaf symptoms were mostly found with homogeneous distribution but rarely reaching 100% of the tree canopy during the 12-month period. The diffusion model provided the best fit among the family of time-gradient curves (r2 = 0.90 to 0.99) due to the flexibility of a three-parameter model. The gradients were well conformed to the model in a 25 to 82.6 km range, having the east-west direction the longest effect. Yuc-2 and QRoo-2 transects showed 82.6 and 43.9 km gradients with a diffusion coefficient (Do) of 0.15 and 0.09, respectively. This study constitutes the first quantitative evidence of the regional spread of CLas from a single focus and the application of a flexible model that improved the fit and allowed to better compare different gradients. These results are useful to determine the size of Regional Areas of Diaphorina citri Control (ARCO), a management program currently implemented in Mexico to combat HLB.

<em>Cercospora agavicola</em>, agente causal de la mancha gris del agave azul (<em>Agave tequilana</em>), es un hongo reglamentado bajo control oficial en estados bajo Denominación de Origen del Tequila (DOT). Este trabajo se desarrolló en Jalisco, México, principal región DOT, para determinar la inductividad epidémica espacio-temporal del hongo y desarrollar modelos estocásticos de pronóstico de la mancha gris con el fin de sustentar acciones preventivas regionales. De octubre 2016 a diciembre 2017 se evaluó mensualmente la severidad, incidencia y número de plantas enfermas en 41 parcelas establecidas en plantaciones comerciales de agave de 3-4 años de edad seleccionadas con criterios ponderados de riesgo en Los Altos (20), Valles (11) y Sur (10). La inductividad epidémica regional de<em> C. agavicola</em> fue heterogénea con mayor riesgo para al menos nueve municipios de Los Altos. Sin embargo, bajas tasas epidémicas (0.0008-0.006 unidades semana-1), fuerte restricción de contagio (1-4 plantas), reducido incremento anual de incidencia (0-32 plantas/0.5 ha) y nula captura de esporas evidenciaron la baja aptitud parasítica y epidémica del hongo. Consecuentemente, se encontró limitada capacidad predictiva aun con los mejores modelos generados (R2adj 0.51-0.60). Las horas favorables (HFav) de enero-abril, respecto a la infección, fue consistente entre modelos por lo que puede integrarse como algoritmo preventivo en SIVEA (www.sivea.org.mx). Las pérdidas regionales, bajo los parámetros epidémicos establecidos, se estimaron entre 98.01 MDD y 237 mil dólares americanos. La cercosporina, toxina asociada al género <em>Cercospora,</em> puede estar implicada en el progreso temporal lineal atípico y debe integrarse en futuras investigaciones.

<p>La marchitez y pudrición seca del cogollo del agave (<em>Agave tequilana</em> var. azul) son enfermedades de alto impacto económico para este cultivo. En este trabajo se planteó determinar la implicación de <em>Fusarium</em> spp. en ambas enfermedades bajo un enfoque regional. Se colectaron muestras de raíz y suelo en 40 plantaciones comerciales ubicadas en 13 municipios de Los Altos Jalisco, importante región de cultivo de agave azul en México. De cada plantación de colecta se estimó carga de inóculo mediante un índice de <em>Fusarium</em> obtenido de unidades formadoras de colonias (<em>Fusarium</em> vs hongos totales) y se analizó su relación con pH y materia orgánica. Se obtuvieron 109 aislados caracterizados morfológicamente como <em>Fusarium</em> spp. de los cuales se seleccionaron 25 para identificación molecular con ITS y EF-1a. La selección consideró sintomatología, caracteres macro y microscópicos y prevalencia de tipologías de colonia observadas <em>in vitro</em> en medios Komada, Sabouraud, SNA y CLA. Los caracteres culturales y morfológicos evaluados fueron: coloración micelial, tamaño, forma y septación de macro y microconidios, y longitud y número de fiálides. Se asociaron cinco especies con marchitez y/o pudrición seca ubicadas en tres complejos filogenéticos: <em>F. oxysporum</em> del complejo de especies <em>Fusarium oxysporum</em> (FOSC) con 56% (46.2% suelo y 66.7% raíz) de representatividad regional; <em>F. solani, F. falciforme</em> y <em>Fusarium</em> sp. del complejo <em>Fusarium solani</em> (FSSC) (40%); y <em>Fusarium</em> sp. del complejo <em>Fusarium fujikuroi</em> (FFSC) (4%). MO y pH tuvieron correlación inversamente proporcional con Índice de <em>Fusarium</em> (<em>r2</em> = 0.68-0.70). Se postula que la marchitez y pudrición seca del cogollo de agave azul constituyen un síndrome en el cual se asocian y especializan parasíticamente diversas especies de <em>Fusarium</em>. Se encontró un aislado de los tres complejos de <em>Fusarium</em> asociados específicamente a cada tipo de síntoma y la combinación de ellos. La mayoría se asociaron a marchitez con predominancia de<em> F. oxysporum. </em>  </p><p> </p>

<p>Esta investigación tuvo como objetivos identificar la especie(s) de <em>Fusarium</em> asociada(s) a hijuelos comerciales de <em>Agave tequilana</em> y desarrollar una metodología para cuantificar la carga de inóculo en hijuelos provenientes de plantaciones madre de Jalisco con inductividad epidémica diferencial al síndrome marchitez y pudrición seca del cogollo (SMAP). La finalidad fue proporcionar criterios para la certificación de plantaciones madre. La fase de campo se realizó entre marzo-mayo 2018 y 2019 en 21 plantaciones comerciales en 14 municipios de Los Altos, Sur y Valles de Jalisco. Se estimó el número de plantas enfermas (PE) y severidad SMAP (S) en 63 y 200 plantas/plantación mediante App-SIVEA para 2018 y 2019 respectivamente. Se desarrolló y aplicó el método CIFUSAG en 7055 hijuelos y 46 656 colonias fungosas obtenidas de 2364 siembras de lavado basal de la ‘piña’, secciones de tejido interno y macerado total de hijuelo. Unidades formadoras de colonia de <em>Fusarium</em> spp. (Fsp) y hongos totales (HT), purificación, monospóricos, caracterización morfológica y cultural se realizó con los medios Komada, agua-agar, Sabouraud, SNA y Sabouraud, respectivamente, diferenciando 557 aislados. La mayor inductividad epidémica en Los Altos significó moderado Índice de <em>Fusarium</em> [(IF) = (?Fsp) / (?HT)] (0.30 y 0.40) y Fsp (20 y 72UFC) respecto al Sur que tuvo valores más altos (0.69, 0.50; 23, 84UFC, respectivamente) (Tukey p=0.05). Calibre de hijuelo no tuvo influencia en IF y Fsp (p=0.183). IF y Fsp de lavado basal no estuvieron correlacionadas con S de plantas madres (r2 = 0.036 y 0.13), mientras que PE únicamente se correlacionó con Fsp (r2 =0.94). La carga de inóculo obtenida por lavado fue superior al de tejido interno con un total de 17,828 UFC (93%) e IF=0.42. Análisis molecular con el gen EF-1a evidenció asociación de 23 cepas con cuatro complejos filogenéticos: <em>Fusarium</em> <em>oxysporum</em>,<em> F. fujikuro</em>i, <em>F. solani</em> y <em>F. incarnatum-equiseti</em> con identidad superior al 98%. El hijuelo comercial de <em>Agave tequilana</em> constituye un factor de dipersión de al menos cuatro especies de <em>Fusarium</em> spp. en el rango de 3.3±3 y 6.83±4.2 UFC/hijuelo.</p>

No abstract

<p>Global retrospective human/plant epidemiology analysis exhibits a reactive cognitive development influenced by casuistic phenomena. Epidemic outbreaks of XXI century evidenced regression of the population-based approach to risk <em>prevention</em> and erosion of <em>Public Health</em> model, successful between 1950-1970. After 19 pandemics and 200 historical outbreaks, neither WHO nor public or private institutions, have not consolidated sustainable <em>preventive</em> models. Urban expansion and agricultural colonialism during the Industrial Revolution accelerated pandemic processes such as Black Death (<em>Yersinia pestis</em>), Cholera (<em>Vibrio cholerae</em>), Potato Blight (<em>Phythopthora infestans</em>) or Coffee Rust (<em>Hemileia</em> <em>vastatrix</em>). These factors contributed to the conception and application of the <em>contagion</em> and <em>prevention</em> principles by Snow/1854 or de Bary/1857, in the hygienism of Proust/1873, and the sanitation of Marshall/1882, before the <em>etiological</em> principle developed by Pasteur/1862 and Koch/1882. The contemporary scientific revolutions strengthened the reductionist hospital vision, with emphasis on cure as a principle, and on <em>health</em> privatization as a business strategy. The central epidemiology paradigm’s <em>population</em> is limited to the <em>individual-patient</em> or <em>plant-damage</em>. The COVID-19 cases <em>curve</em> (‘<em>epidemic wave</em>’) is not inherent to <em>preventive</em> epidemiology, ‘<em>flattening’</em> lacks infectious basis, ‘<em>healthy distance</em>’ or ‘<em>confinement’</em> are not sustainable mitigation strategies. The immunological emphasis did not generate the expected individual protection and ‘<em>herd immunity</em>’. Instead, it exacerbated the pharmaceutical-mercantilized vaccine ‘race’ to new variants; geopolitical protectionism; and unequal distribution of immunologicals. The SARS-CoV-2/COVID-19 pandemic evidenced the rational epidemiological framework deterioration; the absence of <em>Surveillance Systems</em> that articulate clinical detection and viral variants with community risks follow-up, enhanced with genomic and digital technology; the systematic failure of <em>Public Health Systems</em>; and the absence of a <em>pansystemic model</em> to integrate <em>regional preventive models</em>. Maximum case-fatality reduction from 15.2% in 2020 to 2.5 world average 2021, suggests an endemic transitional process. Worldwide reproduction rates Rt &gt; 1 are consistent with more transmissible variants, such as Delta and Omicron, as sublethal survival ability of the virus. The pandemic has not been successfully intervened and its <em>momentum</em> is determined by biological attributes inherent to SARS-CoV-2.</p>

<p>The emergence of COVID-19, a disease caused by SARS-CoV-2, was first reported in December 2019. It then spread in pandemic proportions, creating a human health emergency that was declared a pandemic by the World Health Organization. The airborne transmission of the SARS-CoV-2 virus, mainly through droplets of saliva, has been highly effective, depending on the viral variant. The present study provides clinical-epidemiological information on the general population without discriminating by socioeconomic and occupational factors. A total of 8507 positive cases, with 408384 official metadata, were analyzed. These cases correspond to the exponential phase of the first epidemic wave (March-June 2020) in Mexico. The cohort consisted of children and young people up to 20 years of age. The putative risk factors for SARS-CoV-2 infection due to chronic diseases were also analyzed. In this cohort, the frequency of SARS-CoV-2 infection was 3%, with a 9% rate of active infections and a mortality rate of 1%. The greatest association was between COVID-19 and metabolic diseases, with 31%. This is the first study that analyzed the health conditions associated with COVID-19 infection in children and young people in Mexico during the first SARS-CoV-2 epidemic wave, in the absence of acquired or induced immunity factors. The results, although preliminary, may contribute to the management of COVID-19 patients during the prevention and hospitalization stages. Given the sustained expansion of the epidemic and the greater availability of data, it would be useful to make an integrative analysis of the rural population, which has remained active in the labor market given that agriculture is considered an essential activity.</p>