национальный исследовательский университет имени академика С.П. Королева», Самара В статье представлены современные подходы к диагностике пролиферативной и непролиферативной диабетической ретинопатии. На основе патогенеза выделены изменения в генах, которые могут лежать в основе наследственной предрасположенности к данному заболеванию. В настоящее время принято считать, что патогенез диабета является многофакторным, но генетические факторы риска играют в нем фундаментальную роль. Недавние исследования в области генома выявили несколько генетических локусов, участвующих в патогенезе диабета 1-го типа и 2-го типа. Установлено, что механизмы патогенеза диабетической ретинопатии разнообразны и достаточно сложны, однако немаловажную роль в них играют генетические факторы, которые, вероятно, определяют восприимчивость пациента к этой болезни, а также различия в частоте возникновения диабетической ретинопатии между индивидуумами с диабетом 1-го и 2-го типа. В ходе нашего исследования установлено, что полиморфные локусы генов VEGF rs2010963, AKR1B1 rs759853, ITGA2 rs2910964, ADRB3 rs4994, APOE rs7412, APOE 429358, рассматриваемые независимо друг от друга, не связаны с развитием диабетической ретинопатии в изученной группе больных сахарным диабетом 2-го типа. На наш взгляд, отрицательный результат данного исследования обусловлен гетерогенностью изученной группы по возрасту и стажу сахарного диабета, а также его различной компенсацией. Эти известные факторы риска диабетической ретинопатии могли помешать выявлению более слабых наследственных предрасположенностей.
Breast cancer (BC) is the most common malignant neoplasm in women in the Russian Federation. Today, biological markers that characterize the individual characteristics of the tumor, such as the tendency to metastasize, hormonal sensitivity, are of great importance for the diagnosis and treatment of patients with breast cancer. Among the genes associated with hereditary breast cancer, there are genes with high penetrance (BRCA1, BRCA2, MLH1, MSH2, STK11, PTEN, TP53 and APC) and genes with moderate penetrance (CHEK2, ATM and PALB2). All of the listed above genes are responsible for DNA repair by homologous recombination, and they represent a group of HRR genes (homologous recombination-related genes). Mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes can also initiate cancer of the ovaries, pancreas, and prostate. Understanding of the molecular and genetic nature of an oncological disease allows applying targeted drugs to therapy of a disease.
1 Федеральный научно-клинический центр специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий ФМБА России, г. Москва, 2 ГАУЗ «Республиканский клинический онкологический диспансер МЗ РТ», г. Казань «Золотым стандартом» диагностики колоректального рака (КРР) является колоноскопия. Несмотря на высокие показатели достоверности, данный метод не применим в масштабных скрининговых проверках населения или для оценки динамики заболевания у конкретного паци-ента.В настоящей работе было проведено исследование аберрантного метилирования в генах APC, RASSF1A и ITGA4. Исследование включало 150 парных образцов опухолевой ткани с известным статусом мутации генов семейства RAS и окружающей гистологически неизмененной ткани пациентов с аденокарциномой прямой кишки. Изучение профилей метилирования производи-лось с помощью метода MethyLight PCR.Наибольшая разница в метилировании между опухолевой и здоровой тканью наблюдалась для гена ITGA4 (чувствительность 78%, специфичность 92,7%). Для гена APC чувствительность составила 32%, специфичность -93,3%, для гена RASSF1 чувствительность была 85,3%, специ-фичность -56,7%.Раннее полученные данные по аберрантному метилированию генов SEPT9 и VIM и новые данные по генам APC, RASSF1A и ITGA4 мы сравнили со статусом мутации в генах KRAS и NRAS. Было обнаружено, что в группе пациентов, имеющих мутации в генах KRAS или NRAS, ДНК опухолевых образцов достоверно чаще метилировано в генах SEPT9 (p = 0.0018) и ITGA4 (p = 0.0044), в отличие от ДНК опухолевых образцов пациентов, не имеющих мутации генов семейства RAS.При статистическом анализе эффективности диагностической тест-системы было показано, что наша модель, включающая в себя пять маркеров метилирования (APC, RASSF1A, ITGA4, SEPT9 и VIM) обладает наилучшими показателями чувствительности и специфичности (82,7% и 97,3% соответственно). Полученную модель диагностической тест-системы предлагается использовать для задач диагностики КРР.Ключевые слова: колоректальный рак, колоноскопия, аберрантное метилирование, гены THE ROLE OF ABERRANT METHYLATED IN GENES APC, RASSF1A and ITGA4 FOR DIAGNOSIS OF COLORECTAL CANCERBrovkina O.I., Gordiev M.G., Toropovskiy A.N., Khodyrev D.S., Nikitin А.G., Averyanov A.V., Troitsky A.V.The "gold standard" of diagnosis of colorectal cancer (CRC) is a colonoscopy. Despite the high reliability, this method is not applicable in large-scale population screening or in estimation of the disease dynamics in a particular patient.In this study, we conducted an investigation of aberrant methylation in the APC, RASSF1A and ITGA4 genes. The study included 150 pairs of tumor tissue samples with known mutation status of the RAS family genes and the surrounding histologically unchanged tissue of patients with rectal adenocarcinoma treated at the Republican Clinical Oncology Dispensary of the Ministry of Health of the Republic of Tatarstan. The methylation profiles were studied using MethyLight PCR.
As subjects of the clinical trial, 44 samples of paraffin-fixed tissue were used from patients diagnosed with “colorectal cancer.” In the course of clinical trials, 44 samples of paraffin-fixed tissue were analyzed in two series of experiments, that is, 88 clinical-laboratory experiments were carried out, of which 48 experiments with genomic DNA samples with the established negative status of the presence of KRAS gene mutations and 40 experiments with genomic DNA samples with the established positive status of the presence of KRAS gene mutations. Analysis and evaluation of the results of clinical laboratory tests of the medical product “Kit of Reagents for Determination of the Status of KRAS Gene Mutations by PCR-RV Method in a Sample of Human Genomic DNA from Samples of Paraffin-Fixed Tissue (Test-KRAS-tissue) according to TU 21.20.23-006-97638376-2016 “confirmed that it allows to carry out qualitative determination of the status of six mutations of the twelfth codon (Gly12Asp, Gly12Ala, Gly12Arg, Gly12Val, Gly12Ser, Gly12Cys) and one mutation of the thirteenth codon (Gly13Asp) the KRAS gene by real-time allele-specific PCR in human genomic DNA sample from paraffin-fixed tissue samples, with high diagnostic sensitivity rates of 90.9% and diagnostic specificity of 95.0% with a confidence probability of 90%. Reproducibility of results is 100%, which confirms the high reliability of the set.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.