Simultaneous detection and identification of four sugarcane viruses by one-step RT-PCR

Xie, Yujia; Wang, Mingqiang; Xu, Donglin; Li, Ruhui; Zhou, Guohui

doi:10.1016/j.jviromet.2009.07.015

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“…Los síntomas de esta enfermedad también pueden ser causados por otros virus y pueden confundirse con el mosaico estriado (SCSMV) o el mosaico del sorgo (SrMV), los cuales también infectan a caña de azúcar (Viswanathan et al, 2008;Xie et al, 2009). Además, las plantas asintomáticas también pueden resultar positivas al SCMV (Xu et al, 2008).…”

Section: Introductionunclassified

“…The symptoms of this disease may also be caused by other viruses and may be confused with the Sugarcane streak mosaic virus (SCSMV) or the Sorghum mosaic virus (SrMV), which also affect sugarcane plants (Viswanathan et al, 2008;Xie et al, 2009). Asymptomatic plants can also be positive for SCMV (Xu et al, 2008).…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

“…In Mexico, reports on the detection of SCMV by molecular methods are scarce, and have mainly been based on symptoms (CONADESUCA 2015), so there is no certainty that the visual damage of the mosaic truly corresponds to SCMV or any other virus that presents similar symptoms. Several reports have standardized protocols to detect SCMV using RT-PCR (Smith and Van de Velde, 1994;Xie et al, 2009;Filippone et al, 2010). Smith and Van de Velde (1994) developed primers S400-551 and S400-910, which amplified a 359 bp fragment, which correspond to a partial region that codifies for the capsid protein (CP) of SCMV.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

“…In another study, Yang and Mirkov (1997) developed the primers SCMV-F3/SCMV-R3, which amplify a roughly 900 bp band, which corresponds to a region that codifies for the CP protein of SCMV. Xie et al (2009) designed the set of oligonucleotides SCMV-F1/SCMV-R1 based on sequences deposited in the NCBI database; these primers amplified a 720 bp fragment, which corresponds to a partial region of the HC-Pro protein of SCMV. Recently, (CONADESU-CA 2015), por lo que no hay certeza de que el daño visual de mosaico corresponda realmente al SCMV o algún otro virus que manifiesta síntomas similares.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

“…Recently, (CONADESU-CA 2015), por lo que no hay certeza de que el daño visual de mosaico corresponda realmente al SCMV o algún otro virus que manifiesta síntomas similares. Existen varios reportes que han estandarizado protocolos para la detección del SCMV mediante RT-PCR (Smith y Van de Velde, 1994;Xie et al, 2009;Filippone et al, 2010). Smith y Van de Velde (1994) desarrollaron los iniciadores S400-551 y S400-910, los cuales amplifican un fragmento de 359 pb, correspondiente a una región parcial que codifica para la proteína de la cápside (CP) del SCMV.…”

Section: Introductionunclassified

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Detección del Virus del mosaico de la caña de azúcar (SCMV) en Saccharum spp. en México y origen filogenético de un aislado de Jalisco

Bermúdez-Guzmán

Delgado-Virgen

Cervantes-Preciado

et al. 2017

RMF

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Resumen. El virus de mosaico de la caña deazúcar (SCMV) es uno de los principales agentes virales que infectan a caña de azúcar (Saccharum spp.). En México la detección del SCMV se ha basado en sintomatología típica de la enfermedad, por lo que la información no es concluyente, además hay poca información sobre su origen filogenético. El análisis filogenético con la secuencia parcial HC-Pro del SCMV aislado de Jalisco (JalMex-126) sugiere una estrecha relación con aislados de la India, Australia, China y Argentina, por lo que probablemente compartan un origen genético común y se hayan dispersado a través de germoplasma de caña de azúcar infectado. Detection ofPalabras clave: caña de azúcar, virus, RNA, filogenia. INTRODUCCIÓNLas enfermedades causadas por fitopatógenos constituyen un factor importante para la producción de caña de azúcar. En México, aproximadamente el 80% de las enfermedades que afectan este cultivo son de origen fúngico, el 20% restante es causado por bacterias, virus y fitoplasmas (CONADESU-CA, 2015). Entre las primeras epidemiologías sobre el cultivo de la caña de azúcar reportadas en el mundo a comienzos del siglo XX están las ocasionadas por virus, causando grandes pérdidas econó-micas (Grisham, 2000). El Virus del mosaico de la caña de azúcar (SCMV), agente causal de la enfermedad del mosaico, es uno de los patógenos virales de mayor importancia económica a nivel mundial (Gonçalves et al., 2012). La enfermedad fue responsable de drásticas epidemias en Argentina, with isolates from India, Australia, China and Argentina, and thus likely share a common genetic origin and have been dispersed to through infected sugarcane germplasm.

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Section: Introductionunclassified

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Detección del Virus del mosaico de la caña de azúcar (SCMV) en Saccharum spp. en México y origen filogenético de un aislado de Jalisco

Bermúdez-Guzmán

Delgado-Virgen

Cervantes-Preciado

et al. 2017

RMF

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Detection and Identification of Viruses and Viroids

Narayanasamy

2017

Microbial Plant Pathogens

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Increasing risk of aphids spreading plant viruses in maize fields on both sides of China's Heihe‐Tengchong line under climate change

Wang

et al. 2022

Pest Management Science

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BACKGROUND: In the coming decades, geographical distribution patterns of farmland organisms may undergo drastic changes due to climate change, with significant implications for global food security. In China, Rhopalosiphum maidis and its spread of sugarcane mosaic virus (ScMV) can become an increasingly serious threat to maize (Zea mays) production. We conducted ecological niche modeling for Z. mays, R. maidis, and ScMV under current and future (2041-2060 and 2081-2100) climate scenarios by using MaxEnt software to explore changes in this system. RESULTS: The Heihe-Tengchong line (an imaginary separation line of human population density) can divide China into main (east of the line) and secondary (west of the line) habitats for the three species. With climate change, rapid expansion in suitable areas is projected for ScMV and the aphid vector R. maidis. Taking species interactions into consideration, our overlaying analyses show that most areas east of the Heihe-Tengchong line (optimal for maize and suitable for R. maidis) will become increasingly highly suitable for ScMV, suggesting that the prevention and control of this plant virus and its aphid vector in China's main maize-growing areas (e.g. northeast) will become an increasing challenge in the future.CONCLUSION: Climate change will profoundly affect ScMV-vector-maize interactions, which may contribute favorably to invasion of this virus into new areas. Our comprehensive and in-depth analyses on shifts in this multi-species system under climate change provide useful and insightful information for devising strategies for the prevention and control of plant viruses and aphid vectors on maize in the future.

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Simultaneous detection and identification of four sugarcane viruses by one-step RT-PCR

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Detección del Virus del mosaico de la caña de azúcar (SCMV) en Saccharum spp. en México y origen filogenético de un aislado de Jalisco

Detección del Virus del mosaico de la caña de azúcar (SCMV) en Saccharum spp. en México y origen filogenético de un aislado de Jalisco

Detection and Identification of Viruses and Viroids

Increasing risk of aphids spreading plant viruses in maize fields on both sides of China's Heihe‐Tengchong line under climate change

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