La extracción de ARN genómico de alta calidad para la amplificación por PCR, a partir de Prosopis spp., es complicada debido a la presencia de un alto porcentaje de metabolitos secundarios que se unen o coprecipitan con los ácidos nucleicos. En el presente estudio reportamos un protocolo modificado de sodio dodecil sulfato/fenol que incluye la eliminación de nitrógeno líquido en el proceso de maceración, β-mercaptoetanol en la extracción de tampón y paso de precipitación de etanol. Las proporciones de absorbancia A260/A280 del ARN aislado estaban en torno a 2 a 1.9, lo que sugiere que la fracción de ADN era pura y se puede usar para un análisis de PCR posterior. El ARN aislado por este protocolo es de calidad suficiente para aplicaciones moleculares; Esta técnica podría aplicarse a otros organismos que tienen sustancias similares que dificultan la extracción del ARN. Por último, esta propuesta representa una alternativa rápida, barata y eficaz para el aislamiento del ARN genómico de las hojas frescas de Prosopis spp., incluso en los laboratorios de baja tecnología.

La extracción de DNA libre de polisacáridos, polifenoles, proteínas y RNA de plantas constituye el paso inicial para diversos estudios en Biología molecular. Existen diversos métodos de extracción de DNA específicos para caña de azúcar (Saccharum officinarum), sin embargo, consumen mucho tiempo y utilizan reactivos y equipos costosos. El objetivo del presente estudio fue optimizar un protocolo rápido, eficiente y de bajo costo para extraer DNA de hojas de S. officinarum. Las variables evaluadas fueron rendimiento, pureza, integridad y funcionalidad del DNA purificado de hojas de caña de azúcar de 6 meses de edad. Se utilizaron técnicas de espectrofotometría, electroforesis en geles de agarosa y marcadores moleculares para evaluar las variables anteriores. Las variables rendimiento (mg/g) y pureza (A260:280 y A260:230) del DNA extraído mostraron diferencias altamente significativas (p˃ 0.05) con el protocolo I. Los mejores resultados se obtuvieron con la interacción del protocolo I +N2, con un rendimiento de DNA de 1.17 mg/g y purezas de 1.95 y 1.91 (A260:280 y A260:230). La funcionalidad del DNA por amplificación por PCR con los marcadores RAPD y TRAP generaron perfiles de bandas nítidas de buena calidad y de fácil interpretación. Se recomienda el uso del protocolo I +N2 para la extracción de DNA de S. officinarum para obtener elevados rendimientos de DNA con calidad y pureza óptima para aplicaciones de marcadores moleculares.

<p><em>Papaya ringspot virus</em> (PRSV) es un <em>Potyvirus</em> de importancia económica para el cultivo de papayo (Carica papaya L.) produciendo síntomas de mosaico, clorosis y deformación en las hojas, así como manchas características en forma de anillo en el fruto. En México no existen reportes de especies de arvenses asociadas a este cultivo que actúen como reservorio del <em>Potyvirus</em>. En el presente trabajo, se identificó la presencia de PRSV en arvenses de plantaciones comerciales de papayo del estado de Colima, México. En un muestreo de 139 plantas de papayo y 70 arvenses con sintomatología de virosis, se detectó a PRSV en un 40 y 50% para <em>Carica papaya</em> y <em>Cucurbita pepo</em> respectivamente mediante DAS-ELISA (Ensayo por inmunoabsorción ligado a enzimas con doble anticuerpo en sándwich), mientras que el análisis de la secuencia de 350 pares de bases de la región NIb de PRSV generados por RT-PCR (reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa reversa) permitió identificar al <em>Potyvirus </em>en un 40 a 90% del total de muestras de <em>Abutilon abutilastrum</em> y <em>Anoda cristata</em> (Malvaceae), así como <em>Solanum rostratum</em> (Solanaceaea), lo que representa un nuevo reporte de arvenses reservorio de PRSV asociadas a plantaciones de papayo en México.</p>

No abstract

Centruroides possanii is a recently discovered species of “striped scorpion” found in Mexico. Certain species of Centruroides are known to be toxic to mammals, leading to numerous cases of human intoxications in the country. Venom components are thought to possess therapeutic potential and/or biotechnological applications. Hence, obtaining and analyzing the secretory gland transcriptome and venom proteome of C. possanii is relevant, and that is what is described in this communication. Since this is a newly described species, first, its LD50 to mice was determined and estimated to be 659 ng/g mouse weight. Using RNA extracted from this species and preparing their corresponding cDNA fragments, a transcriptome analysis was obtained on a Genome Analyzer (Illumina) using the 76-base pair-end sequencing protocol. Via high-throughput sequencing, 19,158,736 reads were obtained and ensembled in 835,204 sequences. Of them, 28,399 transcripts were annotated with Pfam. A total of 244 complete transcripts were identified in the transcriptome of C. possanii. Of these, 109 sequences showed identity to toxins that act on ion channels, 47 enzymes, 17 protease inhibitors (PINs), 11 defense peptides (HDPs), and 60 in other components. In addition, a sample of the soluble venom obtained from this scorpion was analyzed using an Orbitrap Velos apparatus, which allowed for identification by liquid chromatography followed by mass spectrometry (LC-MS/MS) of 70 peptides and proteins: 23 toxins, 27 enzymes, 6 PINs, 3 HDPs, and 11 other components. Until now, this work has the highest number of scorpion venom components identified through omics technologies. The main novel findings described here were analyzed in comparison with the known data from the literature, and this process permitted some new insights in this field.

Resumen. El virus de mosaico de la caña deazúcar (SCMV) es uno de los principales agentes virales que infectan a caña de azúcar (Saccharum spp.). En México la detección del SCMV se ha basado en sintomatología típica de la enfermedad, por lo que la información no es concluyente, además hay poca información sobre su origen filogenético. El análisis filogenético con la secuencia parcial HC-Pro del SCMV aislado de Jalisco (JalMex-126) sugiere una estrecha relación con aislados de la India, Australia, China y Argentina, por lo que probablemente compartan un origen genético común y se hayan dispersado a través de germoplasma de caña de azúcar infectado. Detection ofPalabras clave: caña de azúcar, virus, RNA, filogenia. INTRODUCCIÓNLas enfermedades causadas por fitopatógenos constituyen un factor importante para la producción de caña de azúcar. En México, aproximadamente el 80% de las enfermedades que afectan este cultivo son de origen fúngico, el 20% restante es causado por bacterias, virus y fitoplasmas (CONADESU-CA, 2015). Entre las primeras epidemiologías sobre el cultivo de la caña de azúcar reportadas en el mundo a comienzos del siglo XX están las ocasionadas por virus, causando grandes pérdidas econó-micas (Grisham, 2000). El Virus del mosaico de la caña de azúcar (SCMV), agente causal de la enfermedad del mosaico, es uno de los patógenos virales de mayor importancia económica a nivel mundial (Gonçalves et al., 2012). La enfermedad fue responsable de drásticas epidemias en Argentina, with isolates from India, Australia, China and Argentina, and thus likely share a common genetic origin and have been dispersed to through infected sugarcane germplasm.