Objetivo: Descrever quais habilidades preditoras da leitura e escrita são mais efetivas para identificar escolares com dificuldade de aprendizagem no primeiro e segundo ano do Ensino Fundamental I. Métodos: Participaram 68 escolares, divididos em dois grupos pareados: escolares com dificuldade de aprendizagem de 1º e 2º ano do Ensino Fundamental I (G1) e escolares sem queixas de dificuldade de aprendizagem (G2). Os escolares foram avaliados em nível de escrita e habilidades preditoras linguísticas, auditivas e de processamento fonológico. Resultados: Escolares do G1 apresentaram desempenho inferior no nível de escrita e as habilidades de vocabulário expressivo, fluência verbal fonológica, memória de sons verbais, memória de ordens simples, discriminação auditiva verbal, consciência fonológica, memória de trabalho fonológica e acesso fonológico ao léxico mental em comparação ao G2. Quanto às habilidades do sistema fonológico, fluência verbal semântica, percepção auditiva, localização sonora, memória de sons não verbais e memória de ordens complexas, não houve diferença entre os grupos. Conclusão: Escolares em fase inicial de alfabetização com dificuldade de aprendizagem apresentaram desempenho inferior no nível de escrita e na maioria das habilidades preditoras, quando comparados aos escolares sem queixa de dificuldade de aprendizagem, evidenciando sinais de risco para essa alteração. Esse trabalho pode contribuir com profissionais da saúde e educação que buscam reduzir o impacto do baixo desempenho acadêmico na qualidade de vida da criança, pois traz subsídios para desenvolver programas de identificação, promoção e intervenção precoce, baseados nas habilidades preditoras da leitura e escrita nos anos iniciais da alfabetização.