Molecular modeling of the steric structure of the envelope F1 antigen of Yersinia pestis

Specific high affinity binding of human interleukin 1β by Caf1A usher protein of Yersinia pestis

“…It can be seen from It has been reported that some Gram-negative bacteria produce a protein with IL-l-like activities [16]. We found that in a search of the PIR protein sequence library, Cafl shared the highest level of homology with hIL-lra (28% identity between aa 62 89 of Cafl and aa 57-85 of hIL-lra) [15]. Subsequent alignment with other members of the IL-l-like superfamily of proteins revealed further significant homologies [15].…”

“…A similar dramatic effect was induced by replacement of Lys-93 with methionine in hlL-lfl; whereas substitution with arginine did not reduce the receptor binding activity of hlL-lfl [23]. Arg-94 of the Call sequence corresponds to Lys-93 in the primary structure of hlL-lfl [15]. These data are in accord with the competition studies and support the hypothesis that the Cafl protein and hlL-lfl are competing for the identical or overlapping binding sites of p90 (CaflA) molecule.…”

“…We found that in a search of the PIR protein sequence library, Cafl shared the highest level of homology with hIL-lra (28% identity between aa 62 89 of Cafl and aa 57-85 of hIL-lra) [15]. Subsequent alignment with other members of the IL-l-like superfamily of proteins revealed further significant homologies [15]. Thus, of 18 hydrophobic positions forming a hydrophobic core in all the previously studied proteins with the IL-l-like conformation [22] Importance of some of these conservative residues to the function of hlL-1/~ has been demonstrated by site-directed mutagenesis [23].…”

Сapsular Antigen of Yersinia Pestis

“…Высказано предпо-ложение, что эта гидрофильная петля располо-жена на поверхности субъединицы напротив C-концевой последовательности, которая, воз-можно, отвечает за агрегацию субъединиц бел-ка, не препятствуя экспозиции B-клеточных эпитопов на поверхности образующихся агре-гатов. Два T-клеточных эпитопа расположены в C-концевых областях доменов (аминокислот-ные остатки 51-71 и 129-149) [96].…”

“…Кроме того, формирование более выраженного по силе и протективности тимусзависимого иммунного ответа происходит, вероятно, в организме тепло-кровного животного или человека в случае попа-дания в него F1, агрегированной с тимусзависи-мыми детерминантами других белков чумного микроба или при введении очищенного препа-рата F1 в организм, ранее контактировавший с возбудителем чумы. В то же время T-клеточные эпитопы, индуцирующие клеточное звено им-мунного ответа, присутствуют и в собственной структуре субъединицы капсульного антигена [73,96]. Следует отметить, что основное значение в формировании иммунитета к чуме принадле-жит именно клеточным иммунным процессам и главным образом T-системе лимфоцитов [24].…”