Diversity and genetic structure of mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), a fruit species from Cerrado

Abstract

Hancornia speciosa Gomes, popularly known as mangabeira, is a fruit tree belonging to the Apocynaceae family, native to the Brazilian Cerrado. The fruit is widely used by the local population as an alternative source of income. Limited information is available about this species, which increases the difficulty of conserving its genetic resources and exploiting mangabeira as an economic resource. The objective of this research was to evaluate the genetic diversity and genetic structure of H. speciosa from Chapada dos Guimarães. Twenty-four trees and ten inter simple sequence repeats (ISSR) primers were evaluated. Of the 57 bands obtained, 33 (57.89%) presented polymorphism. The analysis using Structure defined two different clusters (K = 2), which were consistent with the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) clustering analysis. The number of observed alleles (Na = 1.58), number of effective alleles (Ne = 1.29), Nei's genetic distance (He = 0.18) and Shannon index (I = 0.27) were considered low among the population. The analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the variability within the cluster (83.39%) was higher than among clusters (16.61%). ISSR primers proved effective for detection of genetic polymorphism in H. speciosa, and could be utilized for strategies that aim at conservation, plant breeding programs, and commercial use. Key words: Mangaba. Molecular analysis. ISSR. ResumoHancornia speciosa Gomes, conhecida popularmente como mangabeira, é uma fruteira pertencente à família Apocynaceae que ocorre espontaneamente no Cerrado brasileiro. O fruto da mangabeira é bastante utilizado pela população local como fonte alternativa de renda e sua exploração é feita de forma extrativista. As informações sobre esta espécie são escassas, o que dificulta a conservação dos recursos genéticos e sua exploração econômica. Neste trabalho foi estudada a diversidade e estrutura genética de uma população de mangabeira, tendo sido avaliada um total de 24 árvores matrizes localizadas em Chapada dos Guimarães-MT por meio de 10 primers ISSR (inter repetições de sequências simples) que revelaram 57 bandas. Destas, 33 (57,89%) de agrupamento UPGMA. O número de alelos observados (Na = 1,58), número de alelos efetivos (Ne = 1,29), índice de diversidade de Nei (He = 0,18) e o índice de Shannon (I = 0,27) foram relativamente baixos dentro da população. A AMOVA revelou que a variabilidade dentro dos grupos (83,39%) foi mais alta do que entre os grupos (16,61%). A utilização de iniciadores ISSR mostrou-se eficaz para detecção de polimorfismo genético em mangabeira, servindo de aporte para estratégias que visem à conservação, melhoramento genético e exploração econômica da espécie. Palavras-chave: Análise molecular. Mangaba. ISSR.