Analysis of the Genome Wide Sequence of Yersinia pestis strains Based on the Consecutive 680-SNP Algorithm

Analysis of the nucleotide sequence of a cryptic plasmid from Yersinia pestis strains in the Central-Caucasian high-mountain plague focus

“…This has not been previously described, in either Rus sian or foreign works, and is not present on the world genetic diversity tree of Y. pestis [11]. The C 627 strain genome comprises (along with the chromosomal DNA and pFra, pPst, and pCad plasmids) a cryptic plasmid with a size of 5.4 kb.…”

“…We have recently performed whole genome sequencing of the proline dependent Y. pestis strain C 627, which was obtained in the Central Caucasian high mountain plague focus. This showed that these strains are the most ancient of all of the known strains of medieval biovar [11]. Their ancient origin is an argument in favor of the previously generally held and presently challenged opinion that a second plague pandemic-the Black Death, which ravaged Europe in 13-14 centuries and was caused by Y. pestis strains of medieval biovar-has broken out in the Caucasus and the Caspian Sea region.…”

Proteins of the plague microbe vaccine strain (<i>Yersinia pestis</i> EV NIIEG) with potential allergen properties

“…ранее с применением методов предсказания уровня экспрессии генов микроорганизмов на основе анализа последовательностей днк установлена статистически значимая зависимость между уровнем экспрессии и предсказанной аллергенностью белков [7], а повышенная аллергенность микроорганизмов коррелировала с их патогенностью [9]. секвенирование генома Y. pestis EV нииэг [16] второй момент -выявление у бактерий протеинов, сходных по своей биохимической структуре с компонентами клеток растительного и животного происхождения [18], и, хотя в литературе недостаточно аргументирована способность бактериальных антигенов стимулировать антибактериальный IgE-ответ, среди белков чумного микроба поиск схожести с известными аллергенами интересен. нами установлено, что из 158 (92,94 %) предполагаемых аллергенных белков чумного микроба у 4 (2,35 %) обнаружена аналогия с аллергенами растений, у 5 (2,94 %) -с аллергенами представителей царства животных и у 3 (1,76 %) -с аллергенами дрожжей и плесневых грибов.…”

Current State of the Problem of Vaccine Development for Specific Prophylaxis of Plague

“…по морфологическим, культуральным и серологическим признакам штамм Y. pestis EV нииэг -типичный штамм возбудителя чумы восточного биовара. полногеномный SNP анализ подтвердил наличие хромосомной делеции и принадлежность к филогенетической группе 1.ORI.3.k, предшествующей более современному кластеру мадагаскарских штаммов -1.ORI.3.d [3,7]. по результатам секвенирования, помимо протяженной делеции в области пигментации, полностью исключающей возможность спонтанной реверсии к вирулентному фенотипу, других значимых изменения в структурных и регуляторных генах вирулентности штамма Y. pestis EV нииэг обнаружить не удалось.…”