цель исследования-поиск белков вакцинного штамма Yersinia pestis EV нииэг с потенциальными свойствами аллергенов. материалы и методы. проанализировано 3256 геномных белков штамма Yersinia pestis EV нииэг, взятых из базы данных GenBank. определение аллергенности белков проводилось с использованием информационных компьютерных программ. программа Allpred, интегрированная в систему Protein Structure Discovery для предсказания белков, как аллергенов, использует не только первичную последовательность аминокислот, но и их пространственную структуру, а также физико-химические свойства аминокислот. для всех найденных потенциальных аллергенов дополнительно определялась их внутриклеточная локализации с помощью программы CELLO v.2.5: subCELlular LOcalization predictor и сходство с известными аллергенами человека в программе AllergenOnline. результаты и обсуждение. компьютерный анализ 3256 белков позволил выявить 170 (5,22 %) потенциальных аллергенных белка вакцинного штамма Y. pestis EV нииэг. из них 53 (31,18 %) относятся к белкам с неизвестной функцией (hypothetical protein), а 16 (9,41 %) к мембранным белкам (membrane protein). наибольший показатель отнесения белка к аллергену составил 0,824568569477881 и отмечен у протеина EXU71465.1 (autotransporter). сходство с известными аллергенами выявлено у 12 (7,06 %) предсказанных аллергенных протеинов. из них 4 (2,35 %) протеина имеют аналоги с аллергенами растений, 5 (2,94 %)-с аллергенами представителей царства животных, 3 (1,76 %)-с аллергенами дрожжей и плесневых грибов. наиболее перспективными при создании новых гипоаллергенных вакцин и препаратов для диагностики напряженности иммунитета у вакцинированных лиц определены белки-аллергены, относящиеся к группе экстрацеллюлярных, и белки наружной мембраны. таких у вакцинного штамма Yersinia pestis EV нииэг обнаружено 38 или 22,35 %.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.