Patterns of genetic diversity of local pig populations in the State of Pernambuco, Brazil

Abstract

-This study estimated the genetic diversity and structure of 12 genetic groups (GG) of locally adapted and specialized pigs in the state of Pernambuco using 22 microsatellite markers. Nine locally adapted breeds (Baé, Caruncho, Canastra, Canastrão, Mamelado, Moura, Nilo, Piau and UDB (Undefined Breed)) and 3 specialized breeds (Duroc, Landrace and Large White), totaling 190 animals, were analyzed. The Analysis of Molecular Variance (AMOVA) showed that 3.2% of the total variation was due to differences between genetic groups, and 3.6% to differences between local and commercial pigs. One hundred and ninety eight alleles were identified and apart from the Large White breed, all GG presented HardyWeinberg Equilibrium deviations for some loci. The total and effective allele means were lower for Duroc (3.65 and 3.01) and higher for UDB (8.89 and 4.53) and Canastra (8.61 and 4.58). Using Nei's standard genetic distance and the UPGMA method, it was possible to observe that the Landrace breed was grouped with the local genetic groups Canastra, Moura, Canastrão, Baé and Caruncho. Due to the complex admixture pattern, the genetic variability of the 12 genetic groups can be analyzed by distributing the individuals into two populations as demonstrated by a Bayesian analysis, corroborating the results from AMOVA, which revealed a low level of genetic differentiation between the inferred populations.

Levantamento Preliminar Da Análise Parasitária De Suínos Adaptados Localmente Na Região Centro-Sul Do Estado Do Paraná-Brasil

“…De acordo com MARIANTE et al (2003), os suínos locais também são capazes de sobreviver em diferentes ecossistemas das regiões brasileiras mesmo em condições desfavoráveis de criação. Em geral, como acontece na maioria dos países, as raças suínas locais são encontradas apenas em pequenos criatórios que estão distribuídos nas diferentes regiões do País (SILVA et al, 2011).…”

Genética da conservação de suínos localmente adaptados no Brasil : uso de ferramentas genômicas e geográficas

“…Os suínos localmente adaptados no Brasil apresentam um patrimônio genético com uma diversidade muitas vezes superior às raças comerciais (Sollero et al, 2009;Silva et al, 2011). Animais adaptados às condições tropicais são mais resistentes a várias doenças e parasitas do que raças de origem européia (Oliveira et al 2009, Abelli et al 2010.…”

“…Em geral, como acontece na maioria dos países, as raças suínas locais são encontradas apenas em pequenos criatórios que estão distribuídos nas diferentes regiões do País (Castro, 2002;Silva Filha et al, 2005;Silva et al, 2011). Estudos realizados com essas raças focaram na caracterização fenotípica (Castro, 2002;Silva Filha, 2005e McManus et al, 2010, caracterização genética baseada em marcadores moleculares (Sollero et al, 2009;Souza et al, 2009;Cavalcante Neto, 2010;Silva et al, 2011) e prospecção de QTLs (Pires et al, 2006Pinto et al, 2010). Contudo, não existem ou são escassas informações de como ocorre a distribuição da variabilidade genética nas regiões em que as raças suínas locais foram adaptadas.…”

“…Estas raças ou grupos genéticos têm sido encontrados nas propriedades de base familiar e se tornaram um meio de vida para o homem do campo (Castro et al 2002;Silva et al, 2011).…”

“…A grande disponibilidade de técnicas moleculares proporcionou a realização de vários estudos em raças ameaçadas de extinção utilizando as informações dos marcadores baseados em polimorfismos do DNA (Maudet et al, 2002;Tadano et al, 2007). Os microssatélites e mtDNA são os marcadores mais utilizados para estudar a diversidade e estrutura genética e a origem de raças suínas brasileiras (Sollero et al, 2009;Souza et al, 2009;Cavalcante Neto, 2010, Silva et al, 2011 e também de outros países (Ramirez et al 2009;Luetkemeier et al 2010;.…”