Uso de marcadores moleculares na análise da variabilidade genética em acerola (Malpighia emarginata D.C.)

Abstract

RESUMO -A acerola (Malpighia emarginata) é uma frutífera tropical encontrada nativa na América Central e no Norte da América do Sul, sendo de grande importância econômica e social devido ao seu alto conteúdo de vitamina C (ácido ascórbico). Pomares de acerola têm sido preferencialmente estabelecidos por métodos de propagação vegetiva. No entanto, a propagação sexuada por sementes é igualmente utilizada e permite revelar um alto grau de polimorfismo na cultura, possibilitando a identificação de genótipos portadores de características de interesse agronômico. Vinte e quatro acessos de acerola, pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma da Universidade Estadual de Londrina, foram analisados, usando marcadores RAPD (Random amplified Polymorphic DNA) e obtidos com iniciadores (primers) de seqüência simples repetidas (SSRs). Um total de 164 e 73 marcadores foram obtidos com primers de RAPD e SSR, respectivamente. Os marcadores obtidos foram analisados, usando o método de agrupamentos UPGMA. A análise comparativa dos dendrogramas gerados com os primers de RAPD e com os primers SSR mostrou que, enquanto alguns acessos se associaram em grupos diferentes, outros apresentaram a mesma associação. Entretanto, maior polimorfismo entre acessos foi detectado com os primers de RAPD. A análise dos resultados revelou a alta variabilidade contida na coleção, permitindo associar o grau de similaridade genética, obtido por marcadores de DNA, com caracteres morfológicos compartilhados entre os acessos.Termos para indexação: Acerola, Malpighia emarginata, marcadores RAPD e SSR, variabilidade genética. THE USE OF MOLECULAR MARKERS IN THE GENETIC VARIABILITY ANALYSIS OF ACEROLA (Malphighia emarginata)ABSTRACT -Acerola (Malpighia emarginata) is a tropical fruit native from Central America and north of South America. It has shown an increasing economic and social importance due to its high vitamin C (ascorbic acid) content. Vegetative propagation is the preferable method used to establish acerola plantations. However, propagation by seeds has also been used allowing the identification and selection of genotypes that carry characteristics of agronomic interest. Twenty-four acerola accesses, of the Active Germplasm Bank of the Universidade Estadual de Londrina, were analyzed using molecular markers obtained with random amplified polymorphic DNA (RAPD) and simple sequence repeated (SSRs) primers. A total of 164 and 73 markers were obtained with RAPD and SSR primers, respectively. Polymorfic markers were scored as present or absent and analyzed using the UPGMA cluster analysis. The results presented reveal high levels of polymorphism in the studied collection. Comparative analysis of the phenograms, generated with both RAPD and SSR primers, revealed that while some accesses clustered in different groups other accesses presented the same association. However, there was large RAPD variation among the accesses. The associations observed with molecular markers were, for many accesses, the same of those determined on the basis of morphological char...

Genetic Variability and Differentiation Among Populations of the Azorean Endemic Gymnosperm Juniperus brevifolia: Baseline Information for a Conservation and Restoration Perspective

“…We were able to generate a similar number of scorable bands using both methods. Both the percentage of primers originating readable and polymorphic bands and the number of bands per primer were similar to those obtained in related studies (Machado et al 1996;Nagaoka and Orihara 1997;Filho et al 1998;Salla et al 2002;Adams et al 2003), although to some extent higher than those obtained by Meloni et al (2006) for J. phoenicea. ISSR and RAPD analyses indicate for Juniperus a similar amount of genetic variation in populations and islands and a generally comparable pattern of inter-island relationships among populations.…”

Diversidade genética de aceroleiras (Malphigia emarginata D.C.), utilizando marcadores moleculares RAPD e características morfoagronômicas

“…O número de marcas polimórficas variou de uma a oito por iniciador, totalizando 85,18% de polimorfismo. Segundo Salla et al (2002), este percentual de fragmentos polimórficos amplificados pode ser considerado suficiente para a avaliação da diversidade genética em aceroleiras. Os iniciadores OPAX 09, OPAX 14, OPAX 16 e OPAB 11 destacaramse entre os demais, apresentando entre seis e oito marcas polimórficas, mostrando potencial para uso em estudos de diversidade desta espécie.…”

“…Lopes et al (2002), estudando o polimorfismo isoenzimático de aceroleira, sugerem que o alto grau de polimorfismo observado nesta cultura seja um indicativo de considerável taxa de cruzamento, confirmando a predominância de alogamia da aceroleira. Entretanto, Salla et al (2002), avaliando a variabilidade genética entre 24 acessos de aceroleiras, por meio de marcadores RAPD, relataram que a variabilidade genética obtida pelos marcadores pode estar relacionada à intensa utilização de sementes na produção de mudas.…”

“…Têm sido empregados para estudos de diversidade genética de algumas frutíferas como aceroleira (Salla et al, 2002), bananeira (Souza, 2006), açaizeiro (Oliveira et al, 2007) e maracujazeiro (Viana et al, 2003).…”

Advances in the propagation of acerola

“…is a fruit native to the Caribbean, Central America and North of South America, which found in Brazil conditions favorable to its commercial cultivation. It has great economic and social importance due to its high content of vitamin C, as well as the early initiation of fruit production, short fruit development period (21 days) and high number of annual crops (ranging from three to four without irrigation and six to seven under irrigation) (GONZAGA NETO et al, 1995;SALLA et al, 2002). Brazil stands out as the largest producer, consumer and exporter of acerola in the world (CARVALHO, 2000).…”