This study was performed for comparison of meristem culture technique with shoot tip culture technique for obtaining virus-free plant, comparison of micropropagation success of two different nutrient media, and determination of effectiveness of real-time PCR assay for the detection of viruses. Two different garlic species (Allium sativum and Allium tuncelianum) and two different nutrient media were used in this experiment. Results showed that Medium 2 was more successful compared to Medium 1 for both A. tuncelianum and A. sativum (Kastamonu garlic clone). In vitro plants obtained via meristem and shoot tip cultures were tested for determination of onion yellow dwarf virus (OYDV) and leek yellow stripe virus (LYSV) through real-time PCR assay. In garlic plants propagated via meristem culture, we could not detect any virus. OYDV and LYSV viruses were detected in plants obtained via shoot tip culture. OYDV virus was observed in amount of 80% and 73% of tested plants for A. tuncelianum and A. sativum, respectively. LYSV virus was found in amount of 67% of tested plants of A. tuncelianum and in amount of 87% of tested plants of A. sativum in this study.

A positive relationship between the symptoms of HG and Hp positivity was determined using PCR.

Köpeklerde canine distemper virüs enfeksiyonunun klinik, patolojik ve real-time RT-PCR ile teşhisiClinical, pathological and real-time RT-PCR diagnosis of canine distemper virus infection in dogs ÖZET Klinik olarak canine distemper virüs (CDV) teşhisi konulan köpeklerde enfeksiyonun hem sürüntü örneklerinde ve hem de postmortem alınan doku örneklerinde hızlı teşhisine yönelik real-time RT-PCR metodu çalışılarak, viral nükleik asit tespitine dayalı real-time RT-PCR metodu ile histopatolojik yöntemin karşılaştırması amaçlanmıştır. Çalışmanın materyalini, ateş, gözyaşı akıntısı ile solunum, sindirim ve sinir sistemi enfeksiyonlarına ait klinik bulgulara sahip, CDV enfeksiyonu klinik tanısı ile tedaviye başlanmış, ancak tedaviye yanıt vermeden ölen köpeklerden histopatolojik bulgulara göre CDV teşhisi konulmuş köpeklere ait beyin, beyincik, karaciğer, akciğer, dalak, böbrek, taban yastığı ve kan ile tonsil, burun ve gözden alınan sürüntü örnekleri oluşturdu. Histopatolojik incelemelerde CDV enfeksiyonu için karakteristik sayılan intrasitoplazmik ve intranükleer inklüzyon cisimciği belirlenen köpeklerden nekropsi sırasında alınmış sürüntü örneklerinde viral nükleik asit varlığı incelendiğinde tonsillerden alınan sürüntülerin tamamında, burun ve konjunktivadan alınan örneklerin iki tanesinde CDV nükleik asit kopyalarının belirlendiği, kan örneklerinde ise viral nükleik asit belirlenemediği görüldü. Köpeklerde görülen klinik bulgular hastalığı düşündürse de kesin teşhis için kullanılan virolojik ve histopatolojik incelemeler uzun zaman almaktadır. Bu durum viral nükleik asitlerin çoğaltılması esasına dayalı PCR yöntemlerini ön plana çıkarmakta, PCR yöntemleri içerisinde de uygulayıcı hatasını minimize eden, hızlı sonuç veren ve virüs sayısının tahmin edilebildiği real-time RT-PCR uygulamalarının önemini artırmaktadır.