The aim was to analyze variation in 12 Brazilian and Moroccan goat populations, and, through principal component analysis (PCA), check the importance of body measures and their indices as a means of distinguishing among individuals and populations. The biometric measurements were wither height (WH), brisket height (BH) and ear length (EL). Thorax depth (WH-BH) and the three indices, TD/WH, EL/TD and EL/WH, were also calculated. Of the seven components extracted, the first three principal components were sufficient to explain 99.5% of the total variance of the data. Graphical dispersion by genetic groups revealed that European dairy breeds clustered together. The Moroccan breeds were separated into two groups, one comprising the Drâa and the other the Zagora and Rhâali breeds. Whereas, on the one side, the Anglo-Nubian and undefined breeds were the closest to one another the goats of the Azul were observed to have the highest variation of all the breeds. The Anglo-Nubian and Boer breeds were similar to each other. The Nambi-type goats remained distinct from all the other populations. In general, the use of graphical representation of PCA values allowed to distinguish genetic groups.
-The objective of this study was to characterize the genetic variability of Anglo-Nubian goats using microsatellite markers. The study was conducted using herds from four municipalities of Central-Northern Piauí (Teresina, José de Freitas, Campo Maior, and Angical), where technical information is scarce. Seven markers suggested by FAO were used (ILSTS11, McM527, INRA23, ETH10, OarfCB304, OarfCB48, and MAF209). The samples were genotyped using a 7% polyacrylamide gel. The average number of alleles per locus was 4.0, with observed and expected heterozygosity of 0.38 and 0.55, respectively. Few deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium were observed for each population. Only two loci deviated significantly in two localities. The coefficient of gene differentiation (G ST' ) indicated that 11.9% of the genetic variation was distributed among populations, and according to the coefficient of inbreeding (G IS = 0.23 and F IS = 0.23), there is a deficiency of heterozygotes within populations. These findings corroborate the Bayesian analyses performed with the STRUCTURE software, which revealed three distinct and moderately structured groups. The graphic analysis showed that Teresina and José de Freitas are isolated groups, while Angical and Campo Maior share most of their alleles. Despite this, the level of diversity among herds was low. Based on this genetic structure, exchange of reproducers among municipalities is recommended for the maintenance of the breed.
-The aim of this study was to compare the genetic diversity of 12 populations of goats in Brazil and Morocco (n = 796) through the use of physical measurements and different multivariate techniques. Traits measured included wither height (WH), distance from the brisket to the ground (BH) and ear length (EL). The standardized Euclidean distance (D) was adopted. The D values were submitted to clustering analysis using hierarchical methods (from nearest neighbor and UPGMAUnweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) and the numbers of clusters were analyzed using the Tocher optimization method. The population clustering was different depending on the method of analysis used. Among the hierarchical methods, UPGMA showed the best fit (CCC = 0.82). The Tocher method enabled the formation of four different clusters. Although the hierarchical and Tocher methods resulted in different cluster formations, both contributed to the interpretation of the genetic cluster divergence. The results obtained through UPGMA and Tocher optimization enable their use for future studies that may include a larger number of biometric variables on greater numbers of individuals and additional populations.
The application of modern methods using the animal model is essential for the efficient conduct of any breeding program. The procedures to characteristics in which continuous variation is assumed are not suitable for those with non-continuous variation. In threshold model assumes that the answering process is associated with an underlying continuous variable which has continuous normal distribution. The probabilistic representation of all knowledge uncertain is the essence of Bayesian inference, such knowledge is related to future observable quantities or unknown parameters. The priori and posteriori concepts are always relative to the observation at the time considered. Thus, we aimed at with this revision presenting and discussing some trends and applications of threshold model with a focus on Bayesian inference, applied to animal breeding.
ObjectiveThe aim of this study was to estimate (co) variance components and genetic parameters for categorical carcass traits using Bayesian inference via mixed linear and threshold animal models in Anglonubian goats.MethodsData were obtained from Anglonubian goats reared in the Brazilian Mid-North region. The traits in study were body condition score, marbling in the rib eye, ribeye area, fat thickness of the sternum, hip height, leg perimeter, and body weight. The numerator relationship matrix contained information from 793 animals. The single- and two-trait analyses were performed to estimate (co) variance components and genetic parameters via linear and threshold animal models. For estimation of genetic parameters, chains with 2 and 4 million cycles were tested. An 1,000,000-cycle initial burn-in was considered with values taken every 250 cycles, in a total of 4,000 samples. Convergence was monitored by Geweke criteria and Monte Carlo error chain.ResultsThreshold model best fits categorical data since it is more efficient to detect genetic variability. In two-trait analysis the contribution of the increase in information and the correlations between traits contributed to increase the estimated values for (co) variance components and heritability, in comparison to single-trait analysis. Heritability estimates for the study traits were from low to moderate magnitude.ConclusionDirect selection of the continuous distribution of traits such as thickness sternal fat and hip height allows obtaining the indirect selection for marbling of ribeye.
RESUMO Objetivou-se com este trabalho realizar o inventário do ecótipo Gurgueia no Estado do Piauí, na região Nordeste do Brasil. O inventário compreendeu o levantamento histórico, com busca em literaturas, e o populacional feito a partir de visitas in loco nos rebanhos. Foi tomado em cada rebanho a localização geográfica por meio o por GPS e contagem dos animais com padrão fenotípico Gurgueia para classifica-la quanto ao risco de extinção. Observou-se a presença dos caracteres barba, chifres, brincos, os padrões de cor ruão, agouti e chocolate, e a presença de orelha reduzida que foram submetidos à análise descritivas simples. A literatura regional consultada não apresentou consistência sobre a origem do caprino Gurgueia no Piauí, mas indicaram que rebanhos instalados no vale do rio Gurgueia no Sul do Piauí, deram origem aos hoje classificados como Gurgueia. No estudo, houve a confirmação de poucos exemplares, apenas 119, dispersos em três microrregiões revelando que grupo genético Gurgueia está em situação crítica de desaparecimento. Nestes animais, observa-se alta frequência da ausência de brincos e do caráter presença de chifre (0,95). A frequência de barba foi de 0,52 e não houve ocorrência de pelos longos, indicando ausência da relação entre esses caracteres. O caráter ruão (0,96), a pelagem chocolate e padrão não-agouti (cor única) não estiveram presentes assim como a presença de orelha reduzida. O estudo pode apontar também que os caprinos Gurgueia apresentam-se em situação instável, já que a sua presença nos rebanhos está associada a outros tipos raciais.
ResumoObjetivou-se avaliar a divergência nutricional de cascas de vagens de 25 genótipos de feijão-fava para alimentação de ruminantes, considerando-se a composição química, características de fermentação e cinética de degradaçãoin situ no rúmen. Os constituintes químicos foram considerados variáveis discriminatórias em uma primeira análise, enquanto os parâmetros de cinética de degradação ruminal e a degradação efetiva (DE 2%h-1) da matéria seca foram considerados na segunda análise. Utilizou-se o método de otimização de Tocher, adotando-se a matriz de “distâncias euclidiana” média dos caracteres para avaliar a dissimilaridade entre os genótipos. Constatou-se a formação de sete grupos heterogêneos, destacando-se a fibra em detergente ácido e proteína bruta como as variáveis mais impactantes para agrupamento na primeira análise, contribuindo com 41,7 e 29,3%, respectivamente, enquanto, na segunda análise, a fração solúvel (fração a) e a taxa de degradação da fração b participaram em 38,7 e 28,0%, respectivamente. Os constituintes químicos PB e FDA e os parâmetros de cinética de degradação ruminal fração solúvel (fração a), taxa de degradação (c) e fração potencialmente degradável (fração b)da MS, mostram-se eficientes para conhecimento da divergência nutricional de cascas de vagens de genótipos de feijão-fava, com base em análise multivariada. Considerando-se os parâmetros adotados para a formação de agrupamentos pelo método de Tocher, o genótipo de feijão-fava 123 apresenta boa degradação efetiva e taxa de degradação compatível com a de forragens tropicais além de melhor valor nutritivo e potencial forrageiro que a casca dos demais genótipos de feijão-fava.
Atualmente, poucos estudos se dedicam a pesquisas mais aprofundadas de aspectos elementares da pelvimetria, sendo estes, ainda mais escassos com a espécie caprina e neste sentido, o presente estudo tem como objetivo caracterizar as medidas externas corpóreas de matrizes caprinas e de sua pelve. Foram utilizadas 30 matrizes caprinas da raça Anglonubiana em idade reprodutiva, manejadas em sistema intensivo, pertencentes ao setor de caprinocultura da Universidade Federal do Piauí (UFPI), Campus Professora Cinobelina Elvas (CPCE), Bom Jesus, Piauí, Brasil. Durante todo o ciclo produtivo, foram realizadas mensurações pélvicas das matrizes durante a gestação e no pós-parto, suas medidas corporais e peso vivo. A análises estatísticas foram realizadas pelo Statistical Analysis Software abrangendo análise discriminante, correlação, regressão e comparação de médias. Os resultados obtidos para as características de AC (altura de cernelha), CC (comprimento corporal), PT (perímetro toraxico), BII (biilíaca externa), BISQ (biisquiática externa) e ILIOQ (ilioisquiática externa) apresentaram um baixo coeficiente de variação (C.V), o que demonstra uma estabilidade do rebanho com relação essas características, ocorrendo poucas variações entre os animais. Não foram verificada diferenças significativas para as medidas de Biilíaca e a Ilioisquiática externas com relação ao estágio fisiológico. Já a Biisquiática, foi observado um aumento durante a gestação. De acordo com os dados observados, não ocorreram diferenças significativas entre as características avaliadas entre cabras primíparas e multíparas. A incorporação de bancos de dados com as medidas corporais e pélvicas de cabras auxiliam no desenvolvimento de programas de melhoramento genético de diferentes raças caprinas, reduzindo a ocorrência de eventos de distocia e /ou dificuldade ao parto de modo geral. As amostragens foram incorporadas em um banco de dados, que está sendo construído para controle e análise genética dos animais Colégio Técnico de Bom Jesus, Piauí. As informações de produção e reprodução do rebanho também estarão disponíveis nesse banco de dados.
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