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The immune system is constantly challenged, being required to protect the organism against a wide variety of infectious pathogens and, at the same time, to avoid autoimmune disorders. One of the most important molecules involved in these events is the Major Histocompatibility Complex class I (MHC-I), responsible for binding and presenting small peptides from the intracellular environment to CD8+ T cells. The study of peptide:MHC-I (pMHC-I) molecules at a structural level is crucial to understand the molecular mechanisms underlying immunologic responses. Unfortunately, there are few pMHC-I structures in the Protein Data Bank (PDB) (especially considering the total number of complexes that could be formed combining different peptides), and pMHC-I modelling tools are scarce. Here, we present DockTope, a free and reliable web-based tool for pMHC-I modelling, based on crystal structures from the PDB. DockTope is fully automated and allows any researcher to construct a pMHC-I complex in an efficient way. We have reproduced a dataset of 135 non-redundant pMHC-I structures from the PDB (Cα RMSD below 1 Å). Modelling of pMHC-I complexes is remarkably important, contributing to the knowledge of important events such as cross-reactivity, autoimmunity, cancer therapy, transplantation and rational vaccine design.

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This paper presents experimental data on particulate matter (PM 10 and PM 2.5 ) in the atmosphere of Candiota-South Brazil. Samples were collected using stacked filter units equipped with polycarbonate filters, which separate particles into two fractions: coarse 10-2.5 μm and fine <2.5 μm.

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Este trabalho estabelece uma comparação básica entre dois cenários distintos de simulação da formação de ozônio superficial sobre o Estado do Rio Grande do Sul. No primeiro cenário usa-se um modelo digital de elevação com resolução de 9 km com a interface de simulação "Models-3". No segundo cenário, um modelo com resolução de 3 km é usado. Em cada cenário, implementa-se um único domínio de simulação, com resoluções correspondentes as do respectivo modelo. Dados do Centro Nacional Estadunidense de Previsão Ambiental foram usados na simulação meteorológica, e dados do Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística e do Departamento de Trânsito do Rio Grande do Sul foram usados na estimativa das emissões devidas à frota veicular da Região Metropolitana de Porto Alegre (única fonte emissora aqui considerada). Os resultados apresentaram diferenças marcantes entre um cenário e outro. As concentrações constantemente elevadas de ozônio observadas à resolução de 9 km, tiveram seus níveis reduzidos à metade a 3 km. Também os padrões de dispersão tiveram características bem distintas, espalhando-se amplamente sobre a parte sul do domínio de simulação no primeiro cenário e, no segundo, espalhando-se de forma mais limitada sobre a parte sudoeste, com um jato observado em direção noroeste. Elevados níveis de concentração de ozônio foram observados a cerca de 500 km das fontes emissoras.