Sago palm (
Metroxylon sagu
Rottb.) is one of the most productive carbohydrate-producing crops. Unfortunately, only limited information regarding sago palm genetics is available. This study aimed to develop simple sequence repeat (SSR) markers using sago palm NGS genomic data and use these markers to evaluate the genetic diversity of sago palm from Indonesia.
De novo
assembly of partial sago palm genomic data and subsequent SSR mining identified 29,953 contigs containing 31,659 perfect SSR loci and 31,578 contigs with 33,576 imperfect SSR loci. The perfect SSR loci density was 132.57/Mb, and AG, AAG and AAAT were the most frequent SSR motifs. Five hundred perfect SSR loci were randomly selected and used for designing SSR primers; 93 SSR primer pairs were identified. After synteny analysis using rice genome sequences, 20 primer pairs were validated using 11 sago palm accessions, and seven primers generated polymorphic alleles. Genetic diversity analysis of 41 sago palm accessions from across Indonesia using polymorphic SSR loci indicated the presence of three clusters. These results demonstrated the success of SSR identification and marker development for sago palm based on NGS genome data, which can be further used for assisting sago palm breeding in the future.
Prosiding Use Cases Artificial Intelligence Indonesia adalah buku yang mengumpulkan hasil-hasil kajian dan liputan 26 use cases inovasi dan 4 inisiatif pemanfaatan kecerdasan artifisial yang kemudian dipetakan menjadi lima klaster bidang kecerdasan artifisial, yakni: riset industri dan hankam, layanan publik dan kesehatan, kota cerdas dan kebencanaan, ketahanan pangan dan maritim, serta klaster inisiatif pemanfaatan kecerdasan artifisial. Materi buku diperoleh dari para kontributor seluruh anggota quadhelix dan para narasumber pegiat kecerdasan artifisial di Indonesia. Buku ini akan membantu masyarakat dalam mendapatkan pengetahuan dan pencerahan tentang seluruh teknologi kecerdasan artifisial yang membantu sektor-sektor terkait dalam hal otomatisasi, alat bantu untuk menganalisis, membuat rekomendasi serta keputusan, memprediksi dan sebagainya.
Dalam rangka mengetahui potensi keragaman mikroba Indonesia sebagai sumber senyawa alami, Balai Bioteknologi-BRIN mengoleksikan mikroba dari berbagai lokasi di Indonesia. Selanjutnya, BRIN bekerja sama dengan mitra riset dari Indonesia dan Jepang dalam proyek Science and Technology Research Partnership for Sustainable Development Program (SATREPS) dalam fase I dari tahun 2015 sampai 2020 dan dalam fase II dari tahun 2021 hingga 2026 untuk penemuan senyawa obat dari mikroba. Alur pencarian senyawa obat dari mikroba dimulai dari kegiatan eksplorasi mikroba (isolasi dan identifikasi mikroba) dari berbagai jenis sampel alami (tanah, tumbuhan, serasah, hewan laut, dan lain-lain) melalui waktu yang cukup panjang, yakni antara 10–20 tahun. Salah satu tahap kritis dalam proses penemuan senyawa obat (drug discovery) dari mikroba adalah tahap identifikasi mikroba. Secara umum, proses identifikasi mikroba dilakukan secara molekuler. Namun, proses ini membutuhkan waktu dan biaya yang besar, terlebih bila menangani mikroba dalam jumlah yang banyak dan khususnya mikroba dari golongan fungi yang memiliki bentuk morfologi mikroba tertentu. Proses identifikasi berbasis morfologi dilakukan melalui pengamatan dengan mikroskop. Namun, identifikasi mikroba ini sangat tergantung dari pengalaman yang dimiliki personel pelaksana dan akan menyulitkan apabila mengidentifikasi mikroba yang baru. Kecerdasan artifisial (KA) dapat membantu mengidentifikasi mikroba berbasis morfologi. Dalam hal ini, KA membantu personel dalam menganalisis gambar morfologi suatu mikroba, sehingga proses ini dapat dilakukan secara cepat dan akurat. TKA juga diharapkan dapat membantu personel dalam menemukan mikroba baru yang belum pernah ditemukan sebelumnya, sehingga dapat meningkatkan nilai dari mikroba asli Indonesia tersebut.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.