Use of molecular markers to accelerate the breeding of common bean lines resistant to rust and anthracnose

Faleiro, Fábio Gelape; Ragagnin, Vilmar Antônio; Moreira, Maurílio Alves; Barros, Everaldo Gonçalves de

doi:10.1023/b:euph.0000047080.80405.72

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“…Similar results were reported by Faleiro et al (2004), in common bean, with distances ranging from 0.07 to 0.33 for backcross 2 (BC2).The genetic distances between SIC 19 and CEPEC 42 were 0.102 and 0.091 for groups 1 and 2, respectively. Although no molecular marker was used to select CEPEC 42, this clone was very close to SIC 19, which can be a coincidence.…”

Section: Resultssupporting

confidence: 86%

“…Here, it is expected that one more backcross will be enough to reach levels of genetic distance close to zero, as obtained by Faleiro et al ( 2004) in common beans, when genetic distances in relation to the recurrent parent ranged from zero to 7% for BC3. Table 2.…”

Section: Resultsmentioning

confidence: 86%

“…The use of molecular markers and the concept of graphical genotypes (Young and Tanksley, 1989) can considerably accelerate this process, reducing to three or four backcross generations (Faleiro et al, 2004).…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

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Genetic divergence in cocoa progenies for backcrossing program to witches' broom disease resistance

et al. 2010

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Divergência genética nas progênies de cacau no programa de retrocruzamento visando resistência à vassoura-de-bruxaO retrocruzamento tem sido pouco usado no melhoramento do cacaueiro, particularmente devido ao longo tempo requerido para transferir genes e recuperar o genoma do pai recorrente. O objetivo deste estudo foi selecionar indiví-duos resultantes do retrocruzamento de CEPEC-42 x SIC-19, geneticamente relacionado ao pai recorrente SIC 19 por meio do uso de marcador molecular RAPD, dentre aqueles com resistência à vassoura-de-bruxa. Das 31 plantas que agruparam com SIC-19, 18 das replantadas permanecem sem a vassoura-de-bruxa no campo, com bom aspecto vegetativo. Essas 18 plantas podem ser usadas em retrocruzamento para alcançar o objetivo desejado. Palavras-chave:Retrocruzamento, melhoramento, marcador molecular, seleção assistida por marcadores, genótipo gráfico. Genetic divergence in cocoa progenies for backcrossing program to witches' broom disease resistanceBackcrossing has been little used in cacao breeding, particularly due to the long time required to transfer genes and recover the genetic background of the recurrent parent. The objective of this study was to select individuals, resulting from the backcross CEPEC-42 x SIC-19, genetically related to the recurrent parent SIC-19 by using RAPD molecular markers, among those with resistance to witches' broom. Of the 31 plants that clustered with SIC-19, 18 from the replanted material remained free of the disease in the field, with good vegetative aspect and, therefore can be used for backcross to reach the desired objective.

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Section: Resultssupporting

confidence: 86%

Section: Resultsmentioning

confidence: 86%

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Genetic divergence in cocoa progenies for backcrossing program to witches' broom disease resistance

et al. 2010

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“…Na Embrapa Cerrados, a transferência de genes de resistência de espécies silvestres para as comerciais tem sido feita, por meio de hibridações interespecíficas seguidas de um programa de retrocruzamentos auxiliados por marcadores moleculares (Faleiro et al, 2004a;Faleiro et al, 2004b).…”

Section: Introductionunclassified

Análise da recuperação do genitor recorrente em maracujazeiro-azedo por meio de marcadores RAPD

et al. 2009

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RESUMO -O Brasil é o maior produtor mundial de maracujá, entretanto tem-se observado redução na produtividade do maracujazeiro nos últimos anos, devido, principalmente, a fatores fitossanitários. Na Embrapa Cerrados, a transferência de genes de resistência de espécies silvestres para as comerciais de maracujazeiro tem sido feita por meio de hibridações interespecíficas seguidas de um programa de retrocruzamentos auxiliados por marcadores moleculares. Este trabalho teve por objetivo verificar a recuperação do genoma recorrente nas plantas RC4 e RC5 [(Passiflora edulis x Passiflora setacea) x Passiflora edulis ] com base em marcadores RAPD. O estudo foi desenvolvido no Laboratório de Genética e Biologia Molecular da Embrapa Cerrados. Amostras de DNA de cada material genético (17 plantas RC4, 16 plantas RC5, Passiflora edulis e Passiflora setacea) foram amplificadas para obtenção de marcadores RAPD. Foram utilizados 12 primers decâmeros para as plantas RC4 e 14 primers decâmeros para as plantas RC5. Os marcadores RAPD gerados foram convertidos em matriz de dados binários. Verificou-se alta porcentagem de marcadores polimórficos em consequência do cruzamento-base interespecífico. A menor similaridade genética foi observada entre as espécies P. edulis e P. setacea, evidenciando a grande distância genética dessas espécies. Termos para indexação: introgressão, marcadores moleculares, similaridade genética, Passiflora edulis e Passiflora setacea. RECOVERY ANALYSIS OF RECURRENT GENITOR IN SOUR PASSION FRUIT THROUGH RAPD MARKERSABSTRACT -Brazil is the largest world producer of passion fruit, however, it has been observed a reduction in the productivity in recent years due, mainly, to phytosanitary factors. At Embrapa Cerrados, the transfer of resistance genes from wild to commercial species of passion fruit has been made through interspecific hybridations, followed by a backcrossing molecular marker-assisted program. The objective this work was to verify the recovery of recurrent genome at the plants RC4 and RC5 [(Passiflora edulis x Passiflora setacea) x Passiflora edulis] based on RAPD markers. The study was developed at Embrapa Cerrados Laboratory of Genetics and Molecular Biology. DNA samples of each genetic material (17 RC4 plants, 16 RC5 plants, Passiflora edulis and Passiflora setacea) were amplified to obtain RAPD markers. There were used 12 decamer primers for plants RC4 and 14 decamer primers for plants RC5. The RAPD markers generated were converted into a matrix of binary data. There were a high percentage of polymorphic markers as a result of interspecific base crossing. The smallest genetic similarity was observed between species P. edulis and P. setacea, highlighting the large genetic distance of these commercial and wild varieties, respectively.

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“…Os marcadores moleculares podem ser empregados para auxiliar programas de melhoramento, e inúmeros trabalhos vêm sendo realizados com esse propósito (Yousef & Juvick, 2001;Mendonça et al, 2002;Faleiro et al, 2004).…”

Section: Introductionunclassified

Seleção fenotípica e assistida por marcadores moleculares de famílias de feijoeiro-comum com alta produtividade

Pereira

Santos

Souza

et al. 2008

Pesq. agropec. bras.

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seleção fenotípica e de seleção assistida por marcadores moleculares (SAM). Foram avaliadas 394 famílias, de quatro populações, e seus seis genitores, no Município de Lavras, em dois experimentos: um na geração F 3:4 , na safra das águas de 2005/2006, em látice simples 20x20; e outro na geração F 3:5 , na safra da seca de 2006, em látice triplo 20x20. Foram estimados parâmetros genéticos e fenotípicos, e foi realizada a genotipagem das famílias, com marcadores microssatélites associados a QTL controladores da produção de grãos, previamente identifi cados. Também foram realizadas análises de associação por marcas simples, entre os marcadores e a produção de grãos, e foi obtido um índice para a SAM. A ampla variabilidade entre famílias e as altas estimativas de herdabilidade possibilitaram obter elevados ganhos com a seleção fenotípica. Os marcadores explicaram pequena percentagem da variação fenotípica e apresentaram alta interação QTL x ambiente e QTL x população. A SAM gerou baixos ganhos e a coincidência de famílias selecionadas pelas duas metodologias foi baixa, o que evidencia, neste caso, a inefi ciência da SAM, principalmente pela pouca disponibilidade de marcadores ligados a QTL.Termos para indexação: Phaseolus vulgaris, QTL, locos de características quantitativas, associação por marcas simples, ganho genético, herdabilidade, microssatélites. Phenotypic and marker-assisted selection of common bean families with high grain yieldAbstract -The objective of this work was to select common bean families with high grain yield, using phenotypic and marker-assisted selections (MAS). Evaluations were made for 394 families of four populations and their six parents, in Lavras county, Minas Gerais, Brazil. Two fi eld experiments were conducted: one in the F 3:4 generation, in the rainy season of 2005/2006, using a 20x20 simple lattice design; and other in the F 3:5 generation, in the dry season of 2006, using a 20x20 triple lattice design. Genetic and phenotypic parameters were estimated, and the families were genotyped with microsatellite markers for grain yield quantitative trait loci (QTL), that had been identifi ed previously. Simple marker association analysis was performed between markers and grain yield, and an index was estimated for MAS. The high variability between families and the heritability estimates made high genetic gains possible through phenotypic selection. The markers explained a small percentage of phenotypic variation, and presented high QTL x environment and QTL x population interactions. The MAS achieved small gains, with low coincidence of families selected by both methodologies, showing, in this case, that the MAS ineffi ciency was mainly due to the low number of available markers.Index terms: Phaseolus vulgaris, QTL, quantitative trait loci, simple marker association analysis, genetic gain, heritability, microsatellites. IntroduçãoEm programas de melhoramento de feijoeirocomum, grande atenção deve ser dada à seleção de famílias segregantes promissoras, que darão origem a novas linhagens e cu...

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Use of molecular markers to accelerate the breeding of common bean lines resistant to rust and anthracnose

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Genetic divergence in cocoa progenies for backcrossing program to witches' broom disease resistance

Genetic divergence in cocoa progenies for backcrossing program to witches' broom disease resistance

Análise da recuperação do genitor recorrente em maracujazeiro-azedo por meio de marcadores RAPD

Seleção fenotípica e assistida por marcadores moleculares de famílias de feijoeiro-comum com alta produtividade

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