A pesquisa em biodiversidade requer correlacionar dados sobre seres vivos e seus habitats. Essas correlações podem ser de vários tipos, integrando desde relacionamentos espaciais a especificações ambientais (descrições do habitat ou ecossistema). Sistemas de Biodiversidade são sistemas de software complexos que permitem aos pesquisadores realizar tais análises. A complexidade desses sistemas varia com os dados manipulados, os usuários visados e o ambiente em que são executados. Um problema que deve ser enfrentado, especialmente no ambiente Web, é a heterogeneidade dos dados, agravado pela diversidade dos vocabulários dos usuários.Esta dissertação contribui para resolver tal problema, apresentando um modelo de banco de dados que permite organizar informações de biodiversidade a partir de padrões mundiais de dados. O modelo proposto combina informações coletadas em campo com dados de catálogos de museus. Para a especificação do modelo, contamos com a participação de ecólogos e biólogos. Para permitir o acesso e recuperação de informação de forma transparente, o banco de dados foi encapsulado em um serviço Web, que é invocado por aplicações cliente. A validação do banco de dados e do serviço utiliza dados reais fornecidos pelos parceiros do projeto BIO-CORE, um projeto de pesquisa que envolve pesquisadores em Computação e Biologia da UNICAMP e USP.