Systematics and Evolution of the &lt;I&gt;Drosophila buzzatii&lt;/I&gt; (Diptera: Drosophilidae) Cluster Using mtDNA

Manfrin, Maura Helena; Brito, Reinaldo Alves de; Sene, Fábio de Melo

doi:10.1603/0013-8746(2001)094[0333:saeotd]2.0.co;2

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“…A morfologia do edeago é considerada a principal característica diagnóstica para a identificação das espécies do grupo D. repleta (Vilela, 1983 (Silva & Sene, 1991;Tidon-Sklorz & Sene, 1995a;Tidon-Sklorz & Sene, 2001;Franco et al 2006a (Manfrin et al 2001;de Brito et al 2002a). Pelo fato dessas populações estarem localizadas próximas ao limite norte da distribuição de D.…”

Section: Buzzatiiunclassified

“…antonietae, foi levantada a hipótese de um evento de introgressão unidirecional de genes citoplasmáticos de D. antonietae nestas populações de D. gouveai, após um contato secundário entre essas espécies, que atualmente estão em alopatria (Manfrin et al 2001;de Brito et al 2002a).…”

Section: Buzzatiiunclassified

“…Hipóteses de relações filogenéticas entre as espécies do cluster D. buzzatii foram estabelecidas a partir de dados de inversões cromossômicas fixas (Ruiz & Wasserman 1993), do gene nuclear Xhantine dehidrogenase (Rodriguez-Trelles et al 2000), ambas já abordadas anteriormente, do gene mitocondrial Citrocromo Oxidase I (Manfrin et al 2001) e do gene nuclear period (Franco et al 2010) gouveai, respectivamente (Silva & Sene, 1991 Tosi & Sene, 1989;Ruiz & Wasserman, 1993).…”

Section: Buzzatiiunclassified

“…Além da utilização dos genes mitocondriais para a elaboração de hipóteses filogenéticas para o compelexo D. buzzatii (Spicer, 1995, Durando et al 2000 e para o cluster D. buzzatii (Manfrin et al 2001), tais genes têm sido utilizados para o estabelecimento de hipóteses filogeográficas para as espécies desse cluster (de Brito et al 2002a;de Brito et al 2002b;Morales, 2005;Franco, 2009). …”

Section: 1 Citocromo Oxidase I E Iiunclassified

“…buzzatii, com suportes estatísticos e probabilísticos robustos, em concordância com estudos moleculares anteriores com o grupo (Manfrin et al 2001, Franco et al 2010). …”

Section: Análises Individuaisunclassified

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Filogenia do Complexo Drosophila Buzzatii (Grupo Repleta): Inferências de Análises Multilocus Mitocondriais e Nucleares.

Ferreira¹

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Filogenia do complexoOrientador: Prof a . Dr a . Maura Helena Manfrin RIBEIRÃO PRETO 2011Autorizo a reprodução total ou parcial deste trabalho para fins de estudo, desde que citada a fonte. Dedico à minha companheira Caroline, com amor. FICHA CATALOGRÁFICA AGRADECIMENTOSEm especial à Prof a . Dr a . Maura Helena Manfrin (FFCLRP/USP), por ter confiado em meu potencial e me orientado de forma tão prestativa e paciente. Obrigado por todos os ensinamentos, pela motivação e, principalmente, pela amizade.Ao Prof. Dr. Fábio de Melo Sene (FMRP/USP), por todos os ensinamentos, idéias, discussões e, principalmente, pelas histórias compartilhadas nos cafés do laboratório.Ao Prof. Dr. Reinaldo O. A. A. de Brito (UFSCar), pela ajuda com o alinhamento das sequências e sugestões.Ao Prof. Dr. Iderval da Silva Junior Sobrinho (UFSCar), pelas discussões sobre estatística e seleção.Aos professores da banca examinadora, pela disponibilidade em analisar este trabalho.Às amigas Carla Bruniera e Dr a . Érica Cristina de Carvalho, pela fundamental ajuda nas análises filogenéticas.Aos amigos do laboratório, Paulo Epifânio, Mateus Henrique, Luís Bizzo, Camila Kokudai, Cintia Graziela, Gislaine Rodrigues e Taís Lavagnini, por estarem sempre dispostos a me ajudar e por tornarem a convivência no laboratório tão agradável. Ao Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), pela bolsa de mestrado. À CAPES, FINEP, FAPESP, CNPq e USP que fornecem verbas para a manutenção do Laboratório de Genética Evolutiva.Ao Departamento de Genética da FMRP/USP, pela disponibilização de recursos.À toda a minha família, em especial aos meus pais, Manoel Ferreira Dionísio Jr.e Rosimeiry Ap. Fransak Davanso, ao meu padrasto, Carlos Roberto Davanso, e aos meus avós, Narciso Fransak, Olga Alves Fransak e Elza Peroni, por toda dedicação e por terem sempre me incentivado e investido em minha formação.À minha querida companheira Caroline dos Santos Rodrigues, pela paciência, carinho, apoio e dedicação. et al. 1996). Tal abordagem é essencial para o entendimento das relações filogenéticas, especialmente entre espécies de divergência recente, nas quais existe pouca divergência morfológica e genética, possibilitando a análise dos processos microevolutivos pelos quais a diversidade biológica é gerada em eventos de especiação (Machado & Hey, 2003). O complexo Drosophila buzzatiiO gênero Drosophila é dividido hierarquicamente em "subgêneros", "grupos", "subgrupos", "complexos" e "clusters" de espécies. Embora não reconhecida pelo Código Internacional de Nomenclatura Zoológica, essa classificação é amplamente utilizada em estudos envolvendo espécies desse gênero (Bächli, 2010 Marcadores molecularesAnálises usando múltiplas fontes de informação têm se multiplicado em estudos de evolução. Uma das razões para este fato é que quanto mais aprendemos sobre o processo evolutivo, torna-se evidente que diferentes conjuntos de dados não são equivalentes (Huelsenbeck et al. 1996;Avise, 2009 .1. Citocromo oxidase I e IIO DNA mitocondrial apresenta muitas carac...

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Section: Buzzatiiunclassified

Section: 1 Citocromo Oxidase I E Iiunclassified

“…buzzatii, com suportes estatísticos e probabilísticos robustos, em concordância com estudos moleculares anteriores com o grupo (Manfrin et al 2001, Franco et al 2010). …”

Section: Análises Individuaisunclassified

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Filogenia do Complexo Drosophila Buzzatii (Grupo Repleta): Inferências de Análises Multilocus Mitocondriais e Nucleares.

Ferreira¹

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Nested Cladistic Analysis of Brazilian Populations of Drosophila serido

Brito

Manfrin

Sene

2002

Molecular Phylogenetics and Evolution

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Molecular Population Genetics of the α-Esterase5 Gene Locus in Original and Colonized Populations of Drosophila buzzatii and Its Sibling Drosophila koepferae

et al. 2006

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Several studies have suggested that esterase-2 (EST-2) may be the target of natural selection in the cactophilic fly Drosophila buzzatii. In this work, we analyzed nucleotide variation in a fragment of alpha-esterase5 (alphaE5), the gene encoding EST-2, in original (Argentinian) and colonized (Australian) populations of D. buzzatii and in its sibling D. koepferae. Estimates of nucleotide heterozygosity in D. buzzatii were similar in Australia and Argentina, although we detected a loss of singletons in colonized populations, suggesting a moderate founder effect. Interspecific comparisons revealed that D. buzzatii was more polymorphic for nonsynonymous variation, whereas D. koepferae was more variable for synonymous and noncoding sites. The two major chromosomal arrangements (2st and 2j) in D. buzzatii displayed similar levels of nucleotide variation, whereas 2jz3 was monomorphic. The sequenced region allowed the discrimination of a greater number of EST-2 protein variants in the Australian sample than in the Argentinean sample. In D. koepferae, nucleotide variation in alphaE5 does not depart from neutral expectations, although tests of population structure were significant for silent variation. In contrast, D. buzzatii has probably undergone a recent population expansion in its South American range. In addition, the McDonald and Kreitman test revealed an excess of nonsynonymous polymorphism in both original and colonized populations of this species.

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Systematics and Evolution of the <I>Drosophila buzzatii</I> (Diptera: Drosophilidae) Cluster Using mtDNA

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Filogenia do Complexo Drosophila Buzzatii (Grupo Repleta): Inferências de Análises Multilocus Mitocondriais e Nucleares.

Filogenia do Complexo Drosophila Buzzatii (Grupo Repleta): Inferências de Análises Multilocus Mitocondriais e Nucleares.

Nested Cladistic Analysis of Brazilian Populations of Drosophila serido

Molecular Population Genetics of the α-Esterase5 Gene Locus in Original and Colonized Populations of Drosophila buzzatii and Its Sibling Drosophila koepferae

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