Nested Cladistic Analysis of Brazilian Populations of Drosophila serido

Brito, Reinaldo Alves de; Manfrin, Maura Helena; Sene, Fábio de Melo

doi:10.1006/mpev.2001.1042

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“…3-Eventos demográficos de expansão populacional e os processos de diferenciação dentro do cluster podem estar relacionados a eventos não sincrônicos de expansão e retração da vegetação xerófita na América do Sul, durante alterações climáticas causadas por eventos paleoclimáticos (Ab' Saber, 1977;Sene et al 1988;de Brito et al 2002a;Moraes et al 2009). …”

Section: Buzzatiiunclassified

“…A morfologia do edeago é considerada a principal característica diagnóstica para a identificação das espécies do grupo D. repleta (Vilela, 1983 (Silva & Sene, 1991;Tidon-Sklorz & Sene, 1995a;Tidon-Sklorz & Sene, 2001;Franco et al 2006a (Manfrin et al 2001;de Brito et al 2002a). Pelo fato dessas populações estarem localizadas próximas ao limite norte da distribuição de D.…”

Section: Buzzatiiunclassified

“…antonietae, foi levantada a hipótese de um evento de introgressão unidirecional de genes citoplasmáticos de D. antonietae nestas populações de D. gouveai, após um contato secundário entre essas espécies, que atualmente estão em alopatria (Manfrin et al 2001;de Brito et al 2002a).…”

Section: Buzzatiiunclassified

“…Além da utilização dos genes mitocondriais para a elaboração de hipóteses filogenéticas para o compelexo D. buzzatii (Spicer, 1995, Durando et al 2000 e para o cluster D. buzzatii (Manfrin et al 2001), tais genes têm sido utilizados para o estabelecimento de hipóteses filogeográficas para as espécies desse cluster (de Brito et al 2002a;de Brito et al 2002b;Morales, 2005;Franco, 2009). …”

Section: 1 Citocromo Oxidase I E Iiunclassified

“…Manfrin et al (2001) (Baimai et al 1983), inversões polimórficas (Ruiz & Wasserman, 1993;Ruiz et al 2000), morfologia do edeago (Franco et al 2008a) e haplótipos de DNA mitocondrial (de Brito et al 2002a;Morales, 2005 borborema, baseada em dados de inversões cromossômicas (Ruiz & Wasserman, 1993), do gene mitocondrial COI (Manfrin et al 2001; presente trabalho) e sequências de DNA satélite (Kuhn & Sene, 2005) (Rodriguez-Trelles et al 2000), e contrastando com a hipótese de monofilia do cluster D. stalkeri e posicionameto da espécie D. stalkeri como mais basal do cluster, baseada em dados de inversões cromossômicas (Ruiz & Wasserman, 1993). Portanto, novas análises com os genes transformer, period, ou com outros marcadores nucleares, utilizando ambas as espécies do cluster D. stalkeri, serão necessárias para o esclarecimento dessa aparente incongruência entre os dados de marcadores moleculares e citogenéticos.…”

Section: Análises Individuaisunclassified

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Filogenia do Complexo Drosophila Buzzatii (Grupo Repleta): Inferências de Análises Multilocus Mitocondriais e Nucleares.

Ferreira¹

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Filogenia do complexoOrientador: Prof a . Dr a . Maura Helena Manfrin RIBEIRÃO PRETO 2011Autorizo a reprodução total ou parcial deste trabalho para fins de estudo, desde que citada a fonte. Dedico à minha companheira Caroline, com amor. FICHA CATALOGRÁFICA AGRADECIMENTOSEm especial à Prof a . Dr a . Maura Helena Manfrin (FFCLRP/USP), por ter confiado em meu potencial e me orientado de forma tão prestativa e paciente. Obrigado por todos os ensinamentos, pela motivação e, principalmente, pela amizade.Ao Prof. Dr. Fábio de Melo Sene (FMRP/USP), por todos os ensinamentos, idéias, discussões e, principalmente, pelas histórias compartilhadas nos cafés do laboratório.Ao Prof. Dr. Reinaldo O. A. A. de Brito (UFSCar), pela ajuda com o alinhamento das sequências e sugestões.Ao Prof. Dr. Iderval da Silva Junior Sobrinho (UFSCar), pelas discussões sobre estatística e seleção.Aos professores da banca examinadora, pela disponibilidade em analisar este trabalho.Às amigas Carla Bruniera e Dr a . Érica Cristina de Carvalho, pela fundamental ajuda nas análises filogenéticas.Aos amigos do laboratório, Paulo Epifânio, Mateus Henrique, Luís Bizzo, Camila Kokudai, Cintia Graziela, Gislaine Rodrigues e Taís Lavagnini, por estarem sempre dispostos a me ajudar e por tornarem a convivência no laboratório tão agradável. Ao Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), pela bolsa de mestrado. À CAPES, FINEP, FAPESP, CNPq e USP que fornecem verbas para a manutenção do Laboratório de Genética Evolutiva.Ao Departamento de Genética da FMRP/USP, pela disponibilização de recursos.À toda a minha família, em especial aos meus pais, Manoel Ferreira Dionísio Jr.e Rosimeiry Ap. Fransak Davanso, ao meu padrasto, Carlos Roberto Davanso, e aos meus avós, Narciso Fransak, Olga Alves Fransak e Elza Peroni, por toda dedicação e por terem sempre me incentivado e investido em minha formação.À minha querida companheira Caroline dos Santos Rodrigues, pela paciência, carinho, apoio e dedicação. et al. 1996). Tal abordagem é essencial para o entendimento das relações filogenéticas, especialmente entre espécies de divergência recente, nas quais existe pouca divergência morfológica e genética, possibilitando a análise dos processos microevolutivos pelos quais a diversidade biológica é gerada em eventos de especiação (Machado & Hey, 2003). O complexo Drosophila buzzatiiO gênero Drosophila é dividido hierarquicamente em "subgêneros", "grupos", "subgrupos", "complexos" e "clusters" de espécies. Embora não reconhecida pelo Código Internacional de Nomenclatura Zoológica, essa classificação é amplamente utilizada em estudos envolvendo espécies desse gênero (Bächli, 2010 Marcadores molecularesAnálises usando múltiplas fontes de informação têm se multiplicado em estudos de evolução. Uma das razões para este fato é que quanto mais aprendemos sobre o processo evolutivo, torna-se evidente que diferentes conjuntos de dados não são equivalentes (Huelsenbeck et al. 1996;Avise, 2009 .1. Citocromo oxidase I e IIO DNA mitocondrial apresenta muitas carac...

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Section: Buzzatiiunclassified

Section: 1 Citocromo Oxidase I E Iiunclassified

Section: Análises Individuaisunclassified

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Filogenia do Complexo Drosophila Buzzatii (Grupo Repleta): Inferências de Análises Multilocus Mitocondriais e Nucleares.

Ferreira¹

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Population Differentiation with Introgression

dos Santos,

de Brito

2023

Conservation Genetics in the Neotropics

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Low rates of homogenization of the DBC-150 satellite DNA family restricted to a single pair of microchromosomes in species from the Drosophila buzzatii cluster

et al. 2007

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A satellite DNA family, termed DBC-150, comprises slightly GC-rich repeat units of approximately 150 bp that were isolated (by DNA digestions or PCR) from the genome of all seven Drosophila species from the buzzatii cluster (repleta group). The presence of subrepeats suggests that part of the extant DBC-150 monomer originated by the duplication of small sequence motifs. The DBC-150 family is compared to the previously described pBuM satDNA family, an abundant component of the genome of five species of the cluster. The two families are different in several aspects, including primary structure, A + T content, intraspecific and interspecific variability and rates of homogenization (or nucleotide spread). The data indicate a lower rate of homogenization (and absence of complete concerted evolution) of the DBC-150 compared to the pBuM family. FISH on metaphase chromosomes revealed that the DBC-150 family is located exclusively in the microchromosomes. To our knowledge this is the first record of a complex Drosophila satDNA restricted to a single pair of microchromosomes. The observed low rates of homogenization of the DBC-150 family might be related to a presumed reduction or suppression of meiotic recombination in the microchromosomes.

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Nested Cladistic Analysis of Brazilian Populations of Drosophila serido

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Filogenia do Complexo Drosophila Buzzatii (Grupo Repleta): Inferências de Análises Multilocus Mitocondriais e Nucleares.

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Population Differentiation with Introgression

Low rates of homogenization of the DBC-150 satellite DNA family restricted to a single pair of microchromosomes in species from the Drosophila buzzatii cluster

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