SSR fingerprinting of a German Rubus collection and pedigree based evaluation on trueness-to-type

Girichev, Vadim; Hanke, Magda‐Viola; Peil, Andreas; Flachowsky, Henryk

doi:10.1007/s10722-015-0345-0

Cited by 18 publications

(29 citation statements)

References 21 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Future work could focus on further evaluation since many other raspberry cultivars (Girichev et al, 2018) have not been evaluated yet. Considering genetic diversity of Rubus genetic resources, the results obtained by Girichev et al (2017) indicate that genetic diversity in German raspberry germplasm is narrow. It is therefore questionable if other cultivars exist with lower preference to SWD.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Insights into the susceptibility of raspberries to Drosophila suzukii oviposition

Wöhner

Pinggera

Fritzsche

et al. 2020

J Applied Entomology

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Insights into the susceptibility of raspberries to Drosophila suzukii oviposition

Wöhner

Pinggera

Fritzsche

et al. 2020

J Applied Entomology

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…The genus Rubus contains several crops with a significant place in fruit production: diploid raspberries, polyploid blackberries, and numerous interspecific hybrids. The genetic base and its use in breeding were addressed by genotyping the German Rubus collection with 16 SSR loci [ 73 ]. Problems with a restricted gene pool have been pointed out based on data from various molecular markers [ 74 ].…”

Section: Genetic Diversitymentioning

confidence: 99%

“…SSR genotyping data and available pedigree information was used to check trueness-to-type of 39 cultivars in the German Rubus collection [ 73 ]. SSR fingerprinting data confirmed female parents of 22 cultivars, male parents of 12 cultivars, and both parents were confirmed for 9 cultivars.…”

Section: Genetic Diversitymentioning

confidence: 99%

Recent Large-Scale Genotyping and Phenotyping of Plant Genetic Resources of Vegetatively Propagated Crops

Nybom

Lācis

2021

Plants

View full text Add to dashboard Cite

Several recent national and international projects have focused on large-scale genotyping of plant genetic resources in vegetatively propagated crops like fruit and berries, potatoes and woody ornamentals. The primary goal is usually to identify true-to-type plant material, detect possible synonyms, and investigate genetic diversity and relatedness among accessions. A secondary goal may be to create sustainable databases that can be utilized in research and breeding for several years ahead. Commonly applied DNA markers (like microsatellite DNA and SNPs) and next-generation sequencing each have their pros and cons for these purposes. Methods for large-scale phenotyping have lagged behind, which is unfortunate since many commercially important traits (yield, growth habit, storability, and disease resistance) are difficult to score. Nevertheless, the analysis of gene action and development of robust DNA markers depends on environmentally controlled screening of very large sets of plant material. Although more time-consuming, co-operative projects with broad-scale data collection are likely to produce more reliable results. In this review, we will describe some of the approaches taken in genotyping and/or phenotyping projects concerning a wide variety of vegetatively propagated crops.

show abstract

“…Созданные наборы SSR-маркеров широко использовались для изучения генетического разнообразия и генотипирования селекционных сортов ежевики и малины (Castillo et al, 2010a;Лебедев и др., 2018), малины обыкновенной (Badjakov et al, 2009;Lamoureux et al, 2011;Girichev et al, 2015;Lacis et al, 2017) и малины западной (Dossett et al, 2012а, b).…”

Section: Aflp (Amplified Fragment Length Polymorphism -по лиморфизм длины амплифицированных фрагментов)unclassified

Molecular markers in the genetic diversity studies of representatives of the genus <i>Rubus</i> L. and prospects of their application in breeding

et al. 2020

View full text Add to dashboard Cite

Род Rubus L. (семейство Rosaceae Juss.), по оценкам разных систематиков, состоит из 12–16 подродов, объединяющих ~750 видов. Самые крупные по числу видов подроды – Idaeobatus (Focke) Focke, к которому относятся малины, и типовой подрод Rubus (=Eubatus Focke), включающий виды ежевик. Представители рода Rubus обладают высокой пищевой и хозяйственной ценностью, а также лекарственными свойствами. Селекционные исследования направлены на расширение генетического разнообразия и создание новых сортов малин и ежевик, устойчивых к биотическим и абиотическим стрессорам и отличающихся высоким качеством плодов. Современные селекционно-генетические программы все шире включают достижения молекулярной генетики и геномики. В данной статье представлен обзор фундаментальных и прикладных исследований генетического разнообразия культивируемых и дикорастущих видов рода Rubus, выполненных на основе методов молекулярного маркирования. Рассмотрены основные типы молекулярных маркеров (RFLP, RAPD, SSR, ISSR, AFLP, SCAR, SSCP, ретротранспозонные маркеры и т. д.) и области их применения в изучении представителей рода Rubus. Приведены результаты работ по использованию методов ДНК-маркирования для решения самых разных задач, включая: исследование межвидового и внутривидового генетического разнообразия, филогенетических связей видов и надвидовых таксонов, выяснение спорных вопросов систематики, генотипирование и уточнение родословных сортов малин и ежевик, изучение сомаклональной изменчивости и др. Наиболее важным результатом в практическом плане является создание насыщенных молекулярно-генетических карт для разных видов малин и ежевик, на которых локализованы многочисленные гены и QTL, детерминирующие различные хозяйственно ценные признаки. В то же время необходимо отметить, что число маркеров, перспективных для проведения эффективного молекулярного скрининга, пока еще недостаточно.

show abstract

SSR fingerprinting of a German Rubus collection and pedigree based evaluation on trueness-to-type

Cited by 18 publications

References 21 publications

Insights into the susceptibility of raspberries to Drosophila suzukii oviposition

Insights into the susceptibility of raspberries to Drosophila suzukii oviposition

Recent Large-Scale Genotyping and Phenotyping of Plant Genetic Resources of Vegetatively Propagated Crops

Molecular markers in the genetic diversity studies of representatives of the genus <i>Rubus</i> L. and prospects of their application in breeding

Contact Info

Product

Resources

About