L'objet de cet article est de comprendre comment se noue la relation entre santé et éducation physique scolaire (EPS) dans les travaux scientifiques et pédagogiques. En analysant les publications récentes au regard des travaux sur la santé et l'éducation qui se développement depuis les années 90, l'étude montre que ce lien se construit différemment, donnant à la santé comme à l'EPS un rôle particulier, d'instrument politique, de lieu d'observation ou de communauté de valeurs. Si certains travaux les considèrent comme des entités séparées qu'il s'agit d'articuler pour produire des effets, d'autres abordent la question par la complexité d'une réalité diversifiée de chacune. Enfin, l'une (la santé) peut être prétexte à questionner les valeurs de l'autre (l'EPS) et réciproquement.