ABSTRAKTujuan dari penelitian ini adalah mengkaji secara molekuler Tursiops sp. asal laut Jawa berdasar urutan gen Cytochrome C Oxidase sub-unit II (COX II). Sampel yang digunakan berasal dari darah lima ekor lumba-lumba hidung botol dari penangkaran PT. Wersut Seguni Indonesia. Deoxyribonucleic acid (DNA) total diisolasi dari sampel darah, selanjutnya diamplifikasi dengan teknik polymerase chain reaction (PCR), dilakukan pengurutan, kemudian data dianalisis menggunakan program MEGA versi 5.1. Hasil amplifikasi diperoleh produk PCR sebesar 824 pasang basa (pb), dan hasil pengurutan DNA didapatkan 684 nukleotida penyusun gen COX II yang menyandi 228 asam amino penyusun COX II. Urutan nukleotida dan asam amino COXII lumba-lumba hidung botol asal laut Jawa memiliki homologi yang sangat tinggi terhadap Tursiops aduncus masing-masing sebesar 99,13 dan 100%. Filogram menggunakan metode neighbour joining berdasarkan urutan nukleotida gen COX II, lumba-lumba hidung botol asal laut Jawa berada dalam kelompok Tursiops aduncus. ____________________________________________________________________________________________________________________ Kata kunci: lumba-lumba hidung botol, gen COX II, nukleotida, laut Jawa
ABSTRACT
The purpose of this study was to examine the molecular basis of Tursiops sp. originated from Java sea based on gene sequences of Cytochrome C Oxidase sub-unit II. Samples of blood were collected from five male bottlenose dolphins from PT. Wersut Seguni Indonesia captivity. Total deoxyribonucleic acid (DNA) was isolated from blood samples, then amplified by polymerase chain reaction (PCR),