O presente estudo objetiva relatar a experiência na aplicação de um curso de extensão, o qual foi proposto como complemento de ensino na área da micologia médica para estudantes de cursos de graduação na área da saúde. Devido à pandemia do novo coronavírus, o curso foi oferecido na modalidade de ensino a distância. O curso abordou desde as características gerais dos fungos até a identificação de organismos clinicamente significativos nas infecções fúngicas, destacando as micoses superficiais, cutâneas, subcutâneas, sistêmicas, invasivas e as micotoxinas. As principais estratégias de aprendizagem foram as videoaulas gravadas, as atividades assíncronas disponibilizadas para complementar o aprendizado e o estudo de casos clínicos em grupos virtuais nas atividades síncronas. Com relação ao aprendizado dos estudantes, foi possível observar uma maior familiaridade dos participantes com relação aos organismos causadores das infecções fúngicas, principalmente, pela assertividade na resolução dos casos clínicos. Em relação às estratégias metodológicas, verificou-se que foram adequadas, com destaque à necessidade de aumentar o número de encontros síncronos e o tempo de estudo devido à densidade dos conteúdos. Este curso de extensão oferecido como um complemento para o ensino de micologia mostrou ser uma experiência positiva para aumentar a efetividade do aprendizado nesta área do conhecimento.