Marsupials and rodents (Didelphimorphia and Rodentia) of upper Rio Acre, with new data on Oxymycterus inca Thomas, 1900 from Brazil

Abreu-Júnior, Edson Fiedler de; Freitas, Marco Antônio de; Lapenta, Marina Janzantti; Venâncio, Nathocley Mendes; França, Daniella Pereira Fagundes de; Percequillo, Alexandre Reis

doi:10.15560/15.5.1956

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“…Two of the three recently specimens of R. longilingua reported by Medina et al (2017) were captured with pitfall traps, as well as the recently reported specimens of genus Neusticomys ( Percequillo, Carmignotto & Silva, 2005 ; Leite, Silva & Da Gardner, 2007 ; Miranda et al, 2012 ; Braga & Duda, 2017 ). Therefore, we emphasize that surveys using pitfall traps are essential for the capture of these rodents, once again reinforcing the importance of this methodology on the study of Neotropical rodents (see Voss & Emmons, 1996 ; Abreu-Júnior et al, 2016 ; Abreu-Júnior, Brennand & Percequillo, 2017 ).…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 57%

“…In the last two decades, several mammalian short and long-term inventories (sensu Voss & Emmons, 1996 ) had been conducted in Brazil (e.g., Abreu-Júnior et al, 2016 ; Abreu-Júnior, Brennand & Percequillo, 2017 ; see Bovendorp et al, 2017 , for a review of inventories at the Brazilian Atlantic Forest). These include sampling performed through environmental impact assessments resultant of the Accelerated Growth Program of the Ministry of Planning from the Brazilian Government (since 2007; http://www.pac.gov.br ) that fostered the national economic growth, through development of several infrastructure enterprises throughout Brazil.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

“…Reports of environmental impacts studies and environmental monitoring programs before, during, and after the construction as well as during the operation of these enterprises produced short and long-term mammal surveys (sensu Voss & Emmons, 1996 ), and hundreds of specimens were assembled and deposited at large and traditional, as well as small and new, Brazilian scientific collections. As a consequence of these efforts, new species (e.g., Bonvicino, Casado & Weksler, 2014 ; Moratelli & Dias, 2015 ; Pavan, 2015 ; Christoff et al, 2016 ; Pardiñas et al, 2016 ), and new distributional records throughout Brazilian states (e.g., Louzada et al, 2015 ; Abreu-Júnior et al, 2016 ; Rossi, Miranda & Semedo, 2016 ; Braga & Duda, 2017 ; Percequillo et al, 2017 ) have been produced, on a yearly basis. It is noteworthy, but not unexpected, that several of these novelties are from representatives of the Order Rodentia, mainly on the cricetid subfamily Sigmodontinae, one of the most speciose lineage of mammals in the world ( D’Elía & Pardiñas, 2015 ).…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

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How many species of mammals are there in Brazil? New records of rare rodents (Rodentia: Cricetidae: Sigmodontinae) from Amazonia raise the current known diversity

Percequillo

Dalapicolla

Abreu-Júnior

et al. 2017

PeerJ

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BackgroundSince 1996, when Vivo questioned how many species of mammals occur in Brazil, there has been a huge effort to assess this biodiversity. In this contribution, we present new records for rare species of the sigmodontine rodent genera Rhagomys and Neusticomys previously unknown to Brazilian Amazon. We provided detailed information on the morphologic variation to allow the proper identification of these species. We also furnished updated information on their collection, aiming to establish hypothesis of their geographic distribution, based on SDM’s, aiming to hypothesize potential occurrence areas for these species.MethodsRodent specimens were sampled in separate inventories in two sites of Rondônia State (Hydroelectric Dam Jirau and Parque Nacional de Pacaás Novos) and one site in Pará State (Pacajá), Brazil, and were compared to specimens from museum collections to apply appropriate names. The SDM were conducted using two algorithms for rare species, MaxEnt and randomForest (RF), and were based on seven localities for Rhagomys, and 10 for Neusticomys.ResultsAll specimens were collected with pitfall traps. One specimen of genus Rhagomys was trapped in the Hydroelectric Dam Jirau. We identified this specimen as R. longilingua, and the SDM species indicates suitable areas for its occurrence at high elevations near on the Andes and lowlands of Amazon Basin to the South of the Rio Amazonas. Two specimens of Neusticomys were recorded, and we identified the specimen from Pacaás Novos as N. peruviensis, with SDM suggesting main areas of occurrence on Western Amazon. We applied the name N. ferreirai to the specimen from Pacajá, with SDM recovering suitable areas in Eastern Amazon.DiscussionWe reinforced the importance of pitfall traps on the study of Neotropical rodents. We described morphologic variation within and among all species that do not invalidate their specific status, but in the near future a re-evaluation will be mandatory. The new records extended the species distribution considerably. SDM was successful to predict their distributions, as the two algorithms presented important differences in range size recovered by the models that can be explained by differences in the thresholds used for the construction of the models. Most suitable areas coincide with the areas facing most of the deforestation in Amazon. We added two rare species of sigmodontine rodents to the list of Brazilian Mammals, which now comprises 722 species (or 775 valid nominal taxa). Although more information is available than in 1996, it is essential that mammal experts maintain inventory and revisionary programs to update and revise this information. This is even more important, as changes in Brazilian environmental legislation are being discussed, suggesting reduced need for environmental impact reports prior to beginning commercial enterprises, resulting in the loss of information about native biodiversity in the affected areas.

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Section: Discussionmentioning

confidence: 57%

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

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How many species of mammals are there in Brazil? New records of rare rodents (Rodentia: Cricetidae: Sigmodontinae) from Amazonia raise the current known diversity

Percequillo

Dalapicolla

Abreu-Júnior

et al. 2017

PeerJ

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“…The Amazonian red-sided opossum, Monodelphis glirina (Wagner, 1842) is a didelphid marsupial endemic to the Amazon region, ranging from eastern Peru and northern Bolivia to northern Brazil, where it is recorded in areas of four states: southern Acre, eastern Rondônia, northern Mato Grosso, and southeastern to northern Pará (Pavan et al 2012;Abreu-Júnior et al 2016;Bezerra et al 2018). Notably, M. glirina was captured both with livetraps (Santos-Filho et al 2015;Bezerra et al 2018) and pitfall traps (Santos-Filho et al 2015;Abreu-Júnior et al 2016;Bezerra et al 2018). The only available data on feeding habits of M. glirina comes from stomach contents, showing an insectivorous diet (Castilheiro and Santos-Filho 2013).…”

Section: Palavras-chave: Amazônia Biologia Mato Grosso Cuíca-do-ramentioning

confidence: 99%

Notes on natural history and behavior of Monodelphis glirina (Didelphimorphia, Didelphidae) and sympatry with congeners

Brandão

Sebastião²,

Kuniy³

et al. 2020

Acta Amaz.

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Monodelphis glirina is endemic to the Amazon and its life habits and natural history are poorly known. Data on the species were collected in northern Mato Grosso, Brazil, including observations on its behavior and simpatry with congeners. During 10 expeditions and with an effort of 3,680 buckets-day, 29 M. glirina, three M. saci and one M. emiliae individuals were captured. Adults accounted for 82.8% of M. glirina captures, with a sex ratio of three males for each female. Capture of young and lactating females was seasonal, as both were captured only in the rainy season. We observed three events of M. glirina preying on rodents in pitfall traps, all with the same feeding behavior. We also report an individual climbing a tree at night, including a video recording. Our report contributes to a better understanding of the ecology of this highly diversified and still poorly known genus.

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“…Previo a su aparición y por un lapso de tiempo de aproximadamente un millón de años, solo estaban presentes los linajes de Akodontini s.s. y Scapteromyini. El registro fósil asociado a estos grupos así lo respalda (e.g., Reig 1978, Pardiñas 1996, Pardiñas et al 2009a (e.g., d' Hiriart et al 2015, Jayat et al 2016, Abreu-Junior et al 2016, así como la revisión del registro fósil asociado (e.g., Pardiñas 2013, Teta et al 2014, Barbière et al 2016, Neves et al 2017, Stutz et al 2018, Barbière 2019, Boroni et al 2020) han reformulado al grupo, generando nuevos datos para evaluar su biogeografía.…”

Section: Biogeografía Históricaunclassified

Sistemática de los roedores de la tribu Akodontini (Cricetidae: Sigmodontinae) en base a caracteres morfológicos y moleculares

Valenzuela¹

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La tribu Akodontini es el segundo grupo más numeroso (en cantidad de géneros y especies) de los roedores Sigmodontinae, la subfamilia viviente más diversa de los Cricetidae. Distribuidos en buena parte de América del Sur, aunque con escasa representación en Amazonía y virtual ausencia en la mayor parte del territorio chileno y altas latitudes de Argentina, actualmente es el único clado de sigmodontinos que carece de una evaluación sistemática integral que combine datos morfológicos y moleculares e incluya a todos sus géneros. Sobre la base de 183 caracteres morfológicos (39 descriptos por primera vez en esta contribución), de los cuales 45 corresponden a morfología externa (13 novedosos), 10 a sistema digestivo (7 novedosos), 7 a sistema reproductor masculino, 73 a morfología del cráneo (12 novedosos), 34 a morfología dentaria (6 novedosos) y 14 a morfología del esqueleto axial y apendicular (1 novedoso) y cinco marcadores moleculares (i.e., citocromo b, exón 6 del gen codificante para la matriz de la dentina, exón 10 del receptor de la hormona del crecimiento, primer exón de la proteína de unión del interfotoreceptor del retinoide y exón único del gen activador de la recombinación), se evaluaron las relaciones filogenéticas de los akodontinos. A la par se abordaron aspectos de su registro fósil, posibles eventos de codivergencia parásito-hospedador y su empleo como marcadores taxonómicos, tiempos de divergencia y biogeografía histórica. El análisis de los caracteres morfológicos permitió el reconocimiento de nuevos rasgos con potencial valor filogenético (e.g., morfología del rinario y estructuras asociadas), así como otros escasamente utilizados en análisis de este tipo (e.g., arrugas palatinas, lengua, vesícula biliar). Para resolver la sistemática de la tribu, cada conjunto de caracteres fue analizado de forma independiente para luego ser combinados en una única matriz (evidencia total) que incluyó a todos los géneros del grupo (n=16). El análisis cladístico de los Akodontini vivientes (47 taxones, 183 caracteres) resolvió pobremente las relaciones internas; sin embargo, se recuperaron asociaciones previamente discutidas en la literatura, como el grupo compuesto por i) Akodon mimus, Blarinomys, Lenoxus, Oxymycterus spp., Podoxymys y ii) Gyldenstolpia, Kunsia y Scapteromys, así como la monofilia de algunos de los géneros (i.e., Bibimys, Brucepattersonius, Juscelinomys, Oxymycterus, Scapteromys). La incorporación en los análisis filogenéticos del registro paleontológico asociado a la tribu no fue concluyente acerca de sus relaciones y asignación tribal. Contra esto, la exploración morfológica realizada apoyó la evidencia previa descartando a Dankomys simpsoni, D. vorohuensis (= Chukimys vorohuensis) y Necromys bonapartei como integrantes de la tribu Akodontini. Esto último no es menor si se tiene en cuenta que N. bonapartei ha sido recurrentemente considerado no solo el akodontino más antiguo (Plioceno Inferior), sino también utilizado para calibrar filogenias de Sigmodontinae. Por otra parte, se confirmó la inclusión de Akodon kermacki y Akodon magnus al registro paleontológico de los akodontinos, constituyendo las formas más antiguas del grupo. El análisis molecular concatenado de los cinco genes independientes recobró tres clados bien sustentados que resultan concordantes con agrupaciones informales previamente mencionadas en la literatura. Las relaciones filogenéticas-genealógicas de algunos géneros y especies pusieron en evidencia diversidad subestimada (e.g., revalidación del género Microxus para contener a Akodon mimus, valores de divergencia intraespecífica altos, que sugieren más de una especie en el género monotípico Blarinomys) y sobrestimada (e.g., Brucepattersonius guarani, B. misionensis, B. paradisus, evaluados sobre material topotípico, sinónimos junior de B. iheringi). El análisis integral de la evidencia morfológica y molecular apoyó la distinción de tres clados principales fuertemente sustentados, permitiendo resolver parte de las relaciones supragenéricas previamente reconocidas. En concordancia, aquí propuse un nuevo esquema clasificatorio mediante la redefinición de grupos genéricos: 1) Akodontini sensu stricto (~54 spp.) restringida a los géneros Akodon, Castoria, Deltamys, Microxus, Necromys, Podoxymys, Thalpomys y Thaptomys; 2) Oxymycterini (~18 spp.) conformada por Juscelinomys y Oxymycterus y 3) Scapteromyini (~15 spp.) representada por Bibimys, Blarinomys, Brucepattersonius, Gyldenstolpia, Kunsia, Lenoxus y Scapteromys. La evidencia conjunta permitió resolver problemáticas de menor nivel taxonómico como la validez de Microxus y justificar la permanencia de Chalcomys e Hypsimys en la sinonimia de Akodon. En relación a la asociación parásito-hospedador, la revisión realizada mostró mayor diversidad de parasitofauna en especies hospedadoras con rangos de distribución más amplios (ocupando diversos ambientes), hábitos y dietas más generalistas, aunque se detectaron algunas excepciones (e.g., Akodon azarae, A. montensis, Necromys lasiurus, Oxymycterus rufus, Scapteromys aquaticus). De los helmintos registrados, solo Caroloxyurys boliviensis, Shypachia alata y S. carlitosi (Oxyuridae) se identificaron como marcadores taxonómicos (alta especificidad hospedatoria), mostrando asociación específica con los clados recuperados en el esquema clasificatorio propuesto. C. boliviensis se asocia al clado conformado por Oxymycterus spp., S. alata al clado que incluye a Necromys spp. y Thaptomys sp., mientras que S. carlitosi se restringe al clado conformado por Akodon spp. La distribución de las especies parásitas consideradas marcadores de sus hospedadores podría explicarse fundamentalmente por procesos de “host switching” para C. boliviensis-Oxymycterus spp. y de codivergencia en Shypacia. La exploración parcial de procesos de codivergencia de Trichuris y roedores akodontinos reveló la asociación de T. navonae con Akodon montensis y Thaptomys nigrita; sin embargo, no se observó monofilia recíproca entre los individuos parásitos de ambas especies hospedadoras. La estimación de tiempos de divergencia permitió establecer que, aunque Akodontini sensu lato (es decir, el clado conformado por las tres tribus propuestas) surgió durante el Plioceno Inferior, la mayor parte de los eventos de diversificación responsables de la diversidad actual tuvieron lugar durante el Plioceno Superior-Pleistoceno. Cada una de las tribus se originó en el lado oriental de América del Sur, correspondiente a las actuales provincias biogeográficas de Chaco y Paraná y, con menor probabilidad, en la provincia Atlántica ubicada al sureste de Brasil (Bosque Atlántico). Se recuperaron dos áreas de endemismo: altas elevaciones de los Andes centrales de Argentina, Bolivia y Perú y sureste de América del Sur, específicamente en la región de Bosque Atlántico. Estas áreas fueron fundamentalmente definidas por taxones con altas tasas de diversificación, como Akodon y Oxymycterus. La combinación de distintos conjuntos de caracteres enriquecidos y la inclusión del registro paleontológico, asociación parásito-hospedador e historia biogeográfica de los Akodontini permitió generar una nueva hipótesis filogenética para este grupo de roedores morfológica y ecológicamente diversos, así como también divergentes a nivel molecular. Esta nueva propuesta taxonómica es un primer paso hacia la reconciliación de la variación morfológica, genética y geográfica de los taxones, resultando en el reconocimiento de tres grupos genéricos altamente cohesionados (i.e., Akodontini s.s., Oxymycterini, Scapteromyini). Además de favorecer un nuevo esquema clasificatorio, la información generada en esta tesis expuso una serie de aspectos relevantes que merecen ser considerados en futuras investigaciones. En primer lugar, invita a indagar en nuevos sistemas de la anatomía externa e interna (e.g., genitalia femenina, oído medio, rinario, turbinales), así como en otras fuentes de información útiles y poco exploradas en abordajes sistemáticos de roedores (e.g., parásitos como marcadores taxonómicos). Al mismo tiempo promueve a enfrentar diversas problemáticas taxonómicas a un nivel jerárquico menor que permitirían comprender la diversidad real del grupo (taxonomía alfa). Finalmente, de la integración de todos los aspectos antes señalados podrán ser resueltas preguntas clave acerca de la historia evolutiva de estas tribus y de la subfamilia, considerada una de las radiaciones adaptativas más exitosa de pequeños mamíferos.

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Marsupials and rodents (Didelphimorphia and Rodentia) of upper Rio Acre, with new data on Oxymycterus inca Thomas, 1900 from Brazil

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How many species of mammals are there in Brazil? New records of rare rodents (Rodentia: Cricetidae: Sigmodontinae) from Amazonia raise the current known diversity

How many species of mammals are there in Brazil? New records of rare rodents (Rodentia: Cricetidae: Sigmodontinae) from Amazonia raise the current known diversity

Notes on natural history and behavior of Monodelphis glirina (Didelphimorphia, Didelphidae) and sympatry with congeners

Sistemática de los roedores de la tribu Akodontini (Cricetidae: Sigmodontinae) en base a caracteres morfológicos y moleculares

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