Грозовые разряды излучают пакеты электромагнитных волн, проникающие на ионосферные и магнитосферные высоты. В результате электростатические и электромагнитные возмущения в неустойчивой плазме вызывают стимулированное высыпание заряженных частиц. Показано, что при образовании волноводных каналов в геомагнитных силовых трубках электромагнитные волны, захваченные в плазменные волноводы, провоцируют высыпание в атмосферу потоков энергичных заряженных частиц из радиационных поясов Земли. В каскадах высыпающихся частиц ионизуются атмосферные частицы, в частности аэрозоли. На градиентах давления плазмы, ортогональных геомагнитному полю, в атмосфере возбуждаются плазменные вихри, а при взаимодействии последних с высотными волнами Россби на роторном генетическом уровне формируются мощные атмосферные вихревые структуры. Электромагнитные волны, отражаясь от слоёв ионосферной плазмы в магнитосопряжённых районах, стимулируют высыпание частиц на двух противоположных границах геомагнитной силовой трубки. Волновые пакеты, излучаемые при разрядах молний, влияют на атмосферную вихревую структуру, генерирующую разряды, как напрямую, так и через возникающую положительную обратную связь. Если в определённом районе над вихревой структурой образовались волноводные каналы, то стимулированное высыпание частиц влияет на атмосферные процессы также и в магнитосопряжённом к нему районе.