Identitas genetik Bemisia tabaci (Gennadius) (Hemiptera: Aleyrodidae) dari daerah endemik penyakit kuning cabai di Indonesia bagian barat berdasarkan fragmen mitokondria sitokrom oksidase I (mtCOI)

Abstract

ABSTRAKBemisia tabaci (Gennadius) dikenal mempunyai variasi genetik tinggi dan merupakan hama penting pada tanaman hortikultura sekaligus sebagai vektor Geminivirus. Penyakit kuning pada cabai yang disebabkan oleh Geminivirus dan ditularkan oleh B. tabaci menjadi masalah penting di Indonesia mengingat kerugian yang ditimbulkan dapat mencapai 100%. Informasi mengenai genetik B. tabaci yang berasosiasi dengan penyakit kuning cabai di Indonesia masih sedikit. Untuk itu, perlu dilakukan penelitian untuk mengetahui identitas genetik B. tabaci. Penelitian bertujuan mengetahui identitas genetik B. tabaci yang diperoleh dari daerah endemik penyakit kuning cabai di Indonesia bagian barat. Kegiatan penelitian yang dilakukan meliputi 1) pengambilan sampel B. tabaci dari daerah endemik penyakit kuning cabai di Indonesia bagian barat; 2) ekstraksi DNA total satu individu B. tabaci dari hasil pengambilan sampel; 3) amplifikasi fragmen gen mitokondria sitokrom oksidase I (mtCOI) dengan metode polymerase chain reaction (PCR); 4) perunutan DNA fragmen gen mtCOI; 5) analisis filogenetika fragmen gen mtCOI hasil ekstraksi, dibandingkan dengan fragmen gen mtCOI yang sudah didepositkan di gen bank National Center for Biotechnology Information (NCBI). Hasil analisis filogenetika menggunakan fragmen gen mtCOI diperoleh hasil bahwa sampel B. tabaci yang berasal dari daerah endemik penyakit kuning cabai di Indonesia Bagian Barat berada dalam satu golongan, yaitu kelompok wilayah Asia I. Identitas genetik B. tabaci dari daerah endemik cabai di Indonesia bagian barat tidak bervariasi dengan ditandai kladogram yang politomi.Kata kunci: Bemisia tabaci, biotipe non B, kelompok Asia I, mtCOI, vektor Geminivirus ABSTRACTBemisia tabaci (Gennadius) is an important horticulture pest and is know to be a vector of Geminivirus. Pepper yellow leaf curl Indonesia virus (PYLCIV) is caused by Geminivirus, know to be transmitted by B. tabaci. It became an important disease in pepper and could cause 100% yield loss. Currently there is limited information concerning the genetic of B. tabaci associated with Geminivirus in Indonesia. It is therefore important to investigate the genetic identity of B.

Variasi morfologi puparium Bemisa tabaci (Gennadius) (Hemiptera: Aleyrodidae) pada berbagai inang dan ketinggian tempat dari daerah endemik penyakit kuning cabai di Wilayah Sundaland

“…Kutukebul B. tabaci biotipe B dan Q merupakan biotipe yang tersebar luas di seluruh dunia dan merupakan vektor virus yang efektif (Yao et al 2017). Biotipe B dilaporkan ditemukan di Jawa Barat (Hidayat et al 2008), akan tetapi survei yang lebih luas meliputi Kalimantan Selatan, Bali, Jawa Timur, Jawa Tengah, Yogyakarta, Jawa Barat, dan Sumatra Barat hanya ditemukan biotipe nonB yang termasuk dalam kelompok filogeografi Asia I (Rahayuwati et al 2016). Lebih jauh Rahayuwati et al (2016) memastikan bahwa identitas genetik B. tabaci dari lokasi-lokasi tersebut merupakan populasi yang tidak bervariasi dengan ditandainya hasil kladogram yang politomi.…”

“…Biotipe B dilaporkan ditemukan di Jawa Barat (Hidayat et al 2008), akan tetapi survei yang lebih luas meliputi Kalimantan Selatan, Bali, Jawa Timur, Jawa Tengah, Yogyakarta, Jawa Barat, dan Sumatra Barat hanya ditemukan biotipe nonB yang termasuk dalam kelompok filogeografi Asia I (Rahayuwati et al 2016). Lebih jauh Rahayuwati et al (2016) memastikan bahwa identitas genetik B. tabaci dari lokasi-lokasi tersebut merupakan populasi yang tidak bervariasi dengan ditandainya hasil kladogram yang politomi. Hal yang sama, B. tabaci kelompok filogeografi Asia I juga West Sumatra, West Java, Central Java, East Java, Bali, South Kalimantan.…”

“…Diduga alel B. tabaci asal Thailand terintegrasi dengan alel B. tabaci asli Indonesia (De Barro et al 2008) sehingga menjadi individu yang efektif menularkan penyakit Begomovirus pada cabai (De Barro 2005). Tidak ditemukannya populasi Biotipe B, seperti yang telah dilaporkan oleh Hidayat et al (2008) sebelumnya, diduga karena populasi tersebut tidak berkembang (Rahayuwati et al 2016).…”

“…Lokasi pengambilan sampel dikelompokkan ke dalam 5 ketinggian, yaitu A: 0-100 m dpl, meliputi Pesisir Selatan, Brebes, Rembang, Kediri, dan Hulu Sungai Selatan; B: 100-500 m dpl, meliputi Bogor, Malang, dan Badung; C: 500-700 m dpl, meliputi Malang; D: 700-1000 m dpl, meliputi Tabanan; E: 1000-1200 m dpl, meliputi Agam, Tanah Datar, Cianjur, Malang, dan Tabanan. (Rahayuwati et al 2016). Identifikasi morfologi untuk memisahkan B. tabaci dengan spesies kutukebul lain menggunakan kunci identifikasi Martin (1987).…”

Molecular Analysis of Cytochrome Oxidase I in Bemisia tabaci (Gennadius) Populations Collected from Four Districts in the Special Region of Yogyakarta

“…Another study analyzed COI sequence and found different native genotypes in Indonesia, including Asia I, Asia II 5, Asia II 6, Asia II 7, Asia II 12, and Australia/Indonesia. Asia I is the dominant B. tabaci genotype found across Indonesia (Srinivasan et al, 2013;Rahayuwati et al, 2016), while Asia II 5 was detected in Bandung and Bogor, Asia II 7 in Bogor, West Java (Lestari et al, 2021), Asia II 6 in Cirebon, West Java (Shadmany et al, 2019), Asia II 7 in west areas of Kalimantan, and Asia II 12 in the western areas of Java (Firdaus et al, 2013). Australia/ Indonesia genetic group have been identified in Indonesia (Dinsdale et al, 2010).…”