HUBUNGAN ANTARA PERTUMBUHAN DENGAN KEBERADAAN GEN TAHAN PENYAKIT MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX (MHC) PADA IKAN MAS (Cyprinus carpio)

Hayuningtyas, Erma Primanita; Ariyanto, Didik; Syahputra, Khairul

doi:10.15578/jra.8.3.2013.383-391

Cited by 3 publications

(5 citation statements)

References 2 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Menurut Hayuningtyas et al (2013) hubungan antara pertumbuhan dengan gen MHC II memiliki korelasi yang negatif. Oleh karena itu, populasi ikan yang pertumbuhannya lambat memiliki tingkat persentase positif MHC II lebih dibandingkan populasi ikan yang pertumbuhannya cepat.…”

Section: Pendahuluanunclassified

“…Pita amplikon yang dihasilkan merupakan fragmen yang diharapkan, karena menurut Hayuningtyas et al (2013) Produk PCR 400 pb diperoleh setelah melalui proses optimasi suhu, waktu, dan kombinasi reagen yang tepat. Gen MHC Kelas II B diamplifikasi dari 12 individu, namun produk amplifikasi hanya diproleh dari 7 individu.…”

Section: Amplifikasi Gen Mhc Kelas II Bunclassified

“…Hal ini diduga karena semua benih ikan yang mati pascainfeksi bakteri A. hydrophila memiliki alel gen MHC kelas II B yang sama dan waktu kematian tidak terkait dengan variasi komponen genetik. Hal tersebut berbeda dengan penelitian Jakaria & Noor (2011) Hayuningtyas et al (2013), Aryanto et al (2015), dan Supriyanto & Dharmawantho (2015) yang memperoleh amplikon gen MHC II yang berbeda dari spesies ikan berbeda.…”

Section: Profil Marka Pcr-rflp Benih Ikan Mati Pada Rentang Waktu Berunclassified

See 2 more Smart Citations

Karakterisasi Molekuler Ikan Gurami Soang (Osphronemus gouramy Lac.) yang Mati pada Rentang Waktu Berbeda Menggunakan PCR-RFLP Gen Major Histocompatibility Complex Kelas II B

et al. 2017

View full text Add to dashboard Cite

Gurami (Osphronemus gouramy Lac.) is a popular fish species among Indonesian people. Several Gurami strains have been cultivated by fish farmer, one of which is Gurami Soang. This strain is belived to have a faster growth rate compared to other strains. However, like other strains, the fingerling of Soang strain have also a low survival and suceptible to disease, especially that caused by Aeromonas hydrophila infection. It has been proved that seeds from a single spawning event show varibale disease resistance. The difference in resistance among individuals is suggested related to the difference in their genetic component. One of the genes responsible for resistance is Major Histocompatibility Complex (MHC) class II B gene. Variability in resistance can be analyzed by using PCR -RFLP technique. PCR-RFLP is a technique that can produce a specific DNA fragments by PCR, followed by cutting the PCR product using restriction enzymes to describe the presence or absence of restriction sites in DNA fragments. This research aims to determine genetic marker to differiantiate between resitant and irresistant individual of Gurami Soang infected by A. hydrophila which die at a different time priod based on PCR-RFLP MHC class IIB gene. The study used survey method with purposive random sampling. This study was done from November 2015 up to April 2016. The Data of PCR-RFLP band patterns were analyzed descriptively. The result indicated that cutting of the MHC class II B gene using HinfI produce two RFLP bands with 300 bp and 100 bp length in all samples. Meanwhile, the MHC IIB gene was not cuted by PstI, HindIII, BamHI and EcoRI enzymes forall samples. These mean that MHC II gene in all individuals were monomorphic. Therefore,it can be concluded that there is no specific genetic marker to differentiate gurami soang individulas which was dying in different time periods. Keywords: Gourami Soang, PCR-RFLP, genetic diversity, MHC class II B gene AbstrakIkan Gurami (Osphronemus gouramy Lac.) merupakan jenis ikan yang populer di masyarakat Indonesia. Gurami soang merupakan strain ikan gurami yang memiliki laju pertumbuhan yang lebih cepat dibanding dengan strain yang lain. Namun, strain soang juga memiliki kelangsungan hidup yang rendah dan rentan terhadap penyakit. Penyakit ikan yang sangat berbahaya adalah yang disebabkan oleh bakteri Aeromonas hydrophila. Benih yang berasal dari satu pemijahan memiliki ketahanan terhadap penyakit yang bervariasi sehingga jika diinfeksi oleh bakteri A. hydrophila akan memiliki ketahanan berbeda-beda. Perbedaan daya hidup tersebut dapat terjadi karena perbedaan komponen genetik yang dimiliki pada setiap individu dalam satu pemijahan. Salah satu gen yang bertanggungjawab terhadap resistensi adalah gen Major Histocompatibility Complex (MHC) kelas II B. Variasi resistensi dapat dianalisa secara molekuler menggunakan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction) -RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism). PCR-RFLP merupakan suatu teknik yang dapat memperbanyak fragmen DNA tertentu melalui PCR, d...

show abstract

Section: Pendahuluanunclassified

Section: Amplifikasi Gen Mhc Kelas II Bunclassified

Section: Profil Marka Pcr-rflp Benih Ikan Mati Pada Rentang Waktu Berunclassified

See 1 more Smart Citation

Karakterisasi Molekuler Ikan Gurami Soang (Osphronemus gouramy Lac.) yang Mati pada Rentang Waktu Berbeda Menggunakan PCR-RFLP Gen Major Histocompatibility Complex Kelas II B

et al. 2017

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Schematic procedure of KHV challenge test, preparation for tested fish, and KHV-infected fish (Carp Selective Breeding Protocol, 2010) Ikan tokol Pemuliaan Ikan Mas pada Direktorat Jenderal Perikanan Budidaya, dengan menggunakan lokus Cyca-DAB 1*05 (Rakus et al, 2008); yang sudah dimodifikasi suhu annealing-nya menjadi 49,1°C (Hayuningtyas et al, 2013).…”

Section: Deteksi Gen Dan Analisis Ekspresi Gen Dengan Marka Mhc-iiunclassified

Evaluasi Daya Tahan Ikan Mas Hasil Seleksi Berdasarkan Marka Molekuler MHC-Ii Terhadap Infeksi Koi Herpes Virus

Hayuningtyas

Syahputra

Ariyanto

2015

Jurnal Riset Akuakultur

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Balai Penelitian Pemuliaan Ikan telah menghasilkan populasi ikan mas tahan Koi Herpes Virus (KHV) generasi pertama (F-1) melalui program selective breeding. Seleksi dilakukan dengan metode walk-back selection menggunakan marka gen MHC-II spesifik pada lokus Cyca-Cyca-DAB 1*05. Penelitian ini bertujuan untukmengevaluasi daya tahan benih ikan mas F-1 terseleksi terhadap infeksi KHV melalui uji tantang. Sebagai pembanding, digunakan ikan mas populasi benih F-1 non-seleksi dan populasi benih ikan mas dari unit pembenihan rakyat (UPR). Ikan uji berupa benih ikan mas Rajadanu berumur dua bulan dengan bobot ratarata 5,5±0,5 g. Jumlah benih pada masing-masing wadah perlakuan sebanyak 30 ekor dengan tiga kali pengulangan. Wadah pengujian berupa akuarium berukuran 40 cm x 60 cm x 40 cm dengan kepadatan 1 ekor/L. Parameter yang diamati adalah sintasan, deteksi KHV, analisis ekspresi gen MHC-II, dan gambaran darah ikan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa populasi benih F-1 terseleksi memiliki daya tahan lebih baik dengan sintasan 93,33% dibandingkan populasi benih F-1 non-seleksi sebesar 85,55% dan populasi benih dari UPR sebesar 81,11%. Daya tahan yang tinggi pada populasi benih F-1 terseleksi didukung oleh hasil deteksi KHV yang negatif dan ersentase jumlah limfosit yang lebih tinggi sebesar 91,67%; serta rendahnya persentase monosit dan heterofil, selain itu, tidak adanya eosinofil dan basofil. Ekspresi gen MHC-II terdeteksi pada berbagai organ, ekspresi tertinggi ditemukan pada organ limpa.

show abstract

“…Hasil evaluasi secara laboratorium menunjukkan bahwa plasma nutfah ikan mas dari Kabupaten Kuningan, Jawa Barat yaitu ikan mas strain Rajadanu mempunyai daya tahan relatif lebih baik dibandingkan strain lainnya (Ariyanto et al, 2011b). Namun demikian, Hayuningtyas et al (2013) melaporkan bahwa populasi ikan mas strain Rajadanu mempunyai daya tahan terhadap penyakit lebih tinggi, diindikasikan dengan marka molekuler major histocompatibility complex (MHC) II tekait ketahanan terhadap penyakit, mempunyai laju pertumbuhan lebih lambat dibandingkan populasi yang tidak mempunyai marka tersebut. Dalam rangka mengatasi permasalahan tersebut, telah dilakukan kegiatan seleksi individu karakter pertumbuhan pada populasi F-0 ikan mas Rajadanu yang mempunyai marka MHC (Ariyanto et al, 2011a).…”

Section: Pendahuluanunclassified

Respons Seleksi Individu Karakter Pertumbuhan Populasi F-0 Ikan Mas Strain Rajadanu

Ariyanto

Hayuningtyas

Syahputra

2014

Jurnal Riset Akuakultur

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Program pembentukan varietas unggul ikan mas tahan penyakit khususnya koi herpesvirus (KHV) dilakukan untuk mengatasi penyakit yang mewabah sejak tahun 2002. Hasil evaluasi awal program tersebut menunjukkan bahwa ikan mas strain Rajadanu dari Kabupaten Kuningan, Jawa Barat mempunyai daya tahan terhadap penyakit KHV lebih baik dibandingkan strain lainnya. Namun demikian, hasil evaluasi pada populasi F-0 ikan mas tahan penyakit, yang diindikasikan dengan marka molekuler major histocompatibility complex (MHC) II terkait daya tahan terhadap penyakit, mempunyai laju pertumbuhan relatif lebih lambat. Untuk mengatasi permasalahan tersebut, dilakukan kegiatan seleksi individu karakter pertumbuhan pada populasi F-0 ikan mas strain Rajadanu yang mempunyai marka MHC. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi respons seleksi individu karakter pertumbuhan pada populasi F-0 ikan mas strain Rajadanu terhadap keragaan pertumbuhan benih F-1. Benih F-1 dari induk terseleksi dan kontrol berumur tiga bulan dengan bobot individu 10-15 gdipelihara di kolam pembesaran ukuran 50 m2 dengan kepadatan 10 ekor/m2. Pakan komersial berbentuk pelet dengan kandungan protein kasar 28% diberikan sebanyak 10%; 7,5%; 5%; dan 2,5% dari total biomassa ikan per hari pada bulan pertama, kedua, ketiga, dan keempat. Pakan diberikan dua kali sehari setiap pagi dan sore. Sampling bobot rata-rata individu dilakukan setiap bulan hingga akhir bulan keempat. Selain sampling bobot, pada akhir bulan keempat juga dilakukan penghitungan jumlah individu yang hidup untuk menganalisis nilai sintasan dan biomassa panen. Hasil penelitian menunjukkan bahwa selisih bobot rata-rata individu populasi F-1 hasil seleksi dengan kontrol sebesar 17,84 g atau setara dengan respons seleksi sebesar 7,29%. Nilai heritabilitas nyata karakter pertumbuhan populasi ikan mas strain Rajadanu dalam penelitian ini termasuk kategori rendah, sebesar 0,06.

show abstract

HUBUNGAN ANTARA PERTUMBUHAN DENGAN KEBERADAAN GEN TAHAN PENYAKIT MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX (MHC) PADA IKAN MAS (Cyprinus carpio)

Cited by 3 publications

References 2 publications

Karakterisasi Molekuler Ikan Gurami Soang (Osphronemus gouramy Lac.) yang Mati pada Rentang Waktu Berbeda Menggunakan PCR-RFLP Gen Major Histocompatibility Complex Kelas II B

Karakterisasi Molekuler Ikan Gurami Soang (Osphronemus gouramy Lac.) yang Mati pada Rentang Waktu Berbeda Menggunakan PCR-RFLP Gen Major Histocompatibility Complex Kelas II B

Evaluasi Daya Tahan Ikan Mas Hasil Seleksi Berdasarkan Marka Molekuler MHC-Ii Terhadap Infeksi Koi Herpes Virus

Respons Seleksi Individu Karakter Pertumbuhan Populasi F-0 Ikan Mas Strain Rajadanu

Contact Info

Product

Resources

About