Genetic tools: the use of biochemical and molecular markers.

Glaubitz, Jeffrey C.; Moran, G. F.; Young, Ahn Na; Boshier, D. P.; Boyle, T.

doi:10.1079/9780851995045.0039

Cited by 29 publications

(20 citation statements)

References 0 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Pada beberapa lokus dijumpai adanya null allele, yaitu alel yang tidak tampak pada suatu lokus karena aktivitas enzim yang lemah untuk mengkode polipeptida. Keberadaan null allele dalam populasi alam dapat disebabkan karena sindrom resesif atau penyakit menurun yang disebabkan karena kekurangan suatu enzim (Weeden & Wendel, 1989) atau mutasi yang menyebabkan hilangnya fungsi suatu enzim (Glaubitz & Moran, 2000). Menurut Nei (1987) paramaeter jumlah alel per lokus yang diamati sangat bergantung pada ukuran sampel, sehingga untuk membandingkan parameter ini pada sampel yang berbeda menjadi kurang akurat apabila ukuran sampel yang diambil tidak sama.…”

Section: S Leprosulaunclassified

Keragaman Genetik Meranti (Shorea leprosula Miq.) Asal Kalimantan Dengan Analisis Isozim

Hasnah¹

2014

Jur. Pen. Dip.

View full text Add to dashboard Cite

ABSTRAKShorea leprosula Miq. merupakan salah satu jenis kayu dari famili Dipterocarpaceae yang mempunyai nilai ekonomi yang tinggi. Kerusakan hutan alam karena illegal logging dan konversi lahan diduga telah mengurangi keragaman genetik dan mempersempit basis genetik jenis tersebut. Sebagai penanda genetik molekuler, isozim dapat digunakan untuk menduga tingkat keragaman genetik. Pengetahuan mengenai kergaman genetik akan memberikan peranan yang penting dalam program pemuliaan dan konservasi genetik jenis S.leprosula di Indonesia. Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah daun S. leprosula yang masih juvenile dari populasi Kalimantan pada lima pertanaman konsevai ex situ yang terletak di Carita (Banten), Semaras -Pulau Laut (Kalimantan Selatan), Gunung Kencana (Jawa Barat), Batu Ampar (Kalimantan Timur), dan Kotawaringin Timur (Kalimantan Tengah). Populasi yang digunakan dalam penelitian ini adalah Gunung Bunga (Kalimantan Barat), Kenangan (Kalimantan Timur), Melak (Kalimantan Timur), Bengalun (Kalimantan Timur), Labanan (Kalimantan Timur), Meraang (Kalimantan Timur), Sambarata (Kalimantan Timur), dan Bukit Baka (Kalimantan Tengah). Empat sistem enzim tersebut dikendalikan oleh lima lokus (6Pg, Got, Est-1, Est-2, dan Shd) dengan 22 alel. Keragaman genetik S. leprosula di Kalimantan tergolong tinggi (HT=0,329) dengan 61,2% keragaman genetik berasal dari keragaman antar populasi. Peningkatan proporsi individu homozigot dijumpai pada hampir semua lokus pada semua populasi S.leprosula di Kalimantan ditandai dengan indeks fiksasi yang bernilai poitif (F-ix = 0,312).

show abstract

Section: S Leprosulaunclassified

Keragaman Genetik Meranti (Shorea leprosula Miq.) Asal Kalimantan Dengan Analisis Isozim

Hasnah¹

2014

Jur. Pen. Dip.

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…In spite of their ecological and economic importance, the Gohilwari goats are inadequately characterized particularly at DNA level. Microsatellites in particular are useful in conservation genetics because the high degree of polymorphism makes them extremely informative and gives them very high discriminating power [12] , allowing for a thorough assessment of genetic variation and structure within and among populations [6] . Genetic diversity is essential for the long-term survival of the species and populations because it provides the raw material for adoption and evolution, especially when environmental conditions have changed [10,29] .…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Genetic Diversity Analysis of the Gohilwari Breed of Indian Goat (Capra hircus) Using Microsatellite Markers

Kumar¹,

Dixit²,

Verma³

et al. 2009

American J. of Animal and Veterinary Sciences

View full text Add to dashboard Cite

Problem statement: Gohilwari breed of goat is a multipurpose goat mainly for milk and meat purposes and best suited in its harsh climatic condition. This breed is inadequately characterized till now at DNA level. So the present study was undertaken for population genetic analysis at molecular level to exploit the breed for planning sustainable improvement, conservation and utilization, which subsequently can improve the livelihood of its stake holders.

show abstract

“…Microsatellites have high levels of polymorphism (Glaubitz and Moran 2000) and are, therefore, extremely useful for fine-scale genetic analyses. As microsatellites are a relatively recent discovery, there have been only a few eucalypt population studies using them (Byrne et al 1996;Brondani et al 1998;Steane et al 2001;McGowen et al 2001).…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Microsatellite and morphological analysis ofEucalyptus globuluspopulations

Jones¹,

Steane²,

Potts³

et al. 2002

Can. J. For. Res.

View full text Add to dashboard Cite

Eucalyptus globulus Labill. is native to southeastern Australia and is the most important temperate hardwood plantation species in the world. It consists of four subspecies that are morphologically and geographically distinct but that are linked by morphologically and geographically intermediate populations. The Jeeralang provenance, an intermediate population from southeastern Victoria, is an important source of seed for plantations and genetic material for breeding programs because of its superior growth and wood density. To determine the genetic affinities of this provenance, 154 trees from three subspecies and the Jeeralang provenance were sampled. Analysis of 12 morphological characters verified that the Jeeralang provenance is intermediate between subspecies bicostata (Maiden, Blakely, & J. Simm.) Kirkpatr., globulus and pseudoglobulus (Naudin ex Maiden) Kirkpatr., with individuals having closest affinities to either ssp. globulus or ssp. bicostata. However, eight microsatellite loci showed that the Jeeralang provenance has greater affinities to Victorian ssp. globulus to which it is geographically closest. In contrast, Tasmanian and Victorian ssp. globulus are morphologically similar yet appear to be distinct at the molecular level. This study emphasizes the importance of using traits that are unlikely to be influenced by selection when determining the origin and affinities of populations.Résumé : Eucalyptus globulus Labill. est une espèce indigène du sud-est de l'Australie. C'est la plus importante espèce feuillue en plantation au monde. L'espèce est constituée de quatre sous-espèces qui sont morphologiquement et géographiquement distinctes. Cependant, ces sous-espèces sont liées entre elles par des populations morphologiquement et géographiquement intermédiaires. La provenance Jeeralang, une population intermédiaire de la région sud-est de Victoria, représente une source importante de semences pour l'établissement de plantations, en plus de fournir du maté-riel génétique pour les programmes d'amélioration, en raison de sa supériorité pour la croissance et la densité du bois. Afin de déterminer les affinités génétiques de cette provenance, 154 arbres représentatifs de trois sous-espèces et de la provenance Jeeralang ont été échantillonnés. La caractérisation de 12 caractères morphologiques a permis de confirmer que la provenance Jeeralang était intermédiaire entre sous-espèces bicostata (Maiden, Blakely & J. Simm.) Kirkpatr., globulus et pseudoglobulus (Naudin ex Maiden) Kirkpatr. Les individus de cette provenance avaient plus d'affinités avec ssp. globulus et ssp. bicostata. Cependant, l'analyse de huit loci de microsatellites a révélé que la provenance Jeeralang avait le plus d'affinités avec la sous-espèce globulus de la région de Victoria, dont elle est géographiquement la plus rapprochée. À l'opposé, les individus de la sous-espèce globulus des régions de Tasmanie et de Victoria étaient morphologiquement similaires même s'ils étaient distincts à l'échelle moléculaire. Cette étude souligne ...

show abstract

Genetic tools: the use of biochemical and molecular markers.

Cited by 29 publications

References 0 publications

Keragaman Genetik Meranti (Shorea leprosula Miq.) Asal Kalimantan Dengan Analisis Isozim

Keragaman Genetik Meranti (Shorea leprosula Miq.) Asal Kalimantan Dengan Analisis Isozim

Genetic Diversity Analysis of the Gohilwari Breed of Indian Goat (Capra hircus) Using Microsatellite Markers

Microsatellite and morphological analysis ofEucalyptus globuluspopulations

Contact Info

Product

Resources

About