Evaluation of Resistance Rates of Escherichia coli Isolates of Urinary Tract Infection to Various Antibiotics

Avcıoğlu, Fatma; Behçet, Mustafa

doi:10.5222/tmcd.2020.172

“…Tüm dünyada ve ülkemizde poliklinik, servis ve yoğun bakım ünitelerinde üriner sistem enfeksiyonlarına en sık neden olan etkenler Gram negatif bakterilerdir. Bu bakteriler arasında da en sık gözlenen etken E. coli'dir (2,16) . Çalışmamıza dahil edilen 23324 örneğin 13427'sinde (%57.6) E. coli üremiştir.…”

Section: Discussionunclassified

“…Çalışmamızda fosfomisin direnç oranları incelendiğinde E.coli için poliklinik hastalarında %6.4; servis hastalarında %3.2; yoğun bakım hastalarında ise %6.4 olduğu görülmüştür. Literatürde E. coli fosfomisin direnç oranı %0.3-4.2 arasında raporlanmıştır (2,11,16) . Üriner sistem enfeksiyonlarının büyük çoğunluğunu E. coli enfeksiyonlarının oluşturduğu düşünüldüğünde, fosfomisin kullanım kolaylığını da göz önüne alırsak ampirik tedavide hala iyi bir seçenek olarak öne çıkmaktadır.…”

Section: Discussionunclassified

İstanbul’da Bi̇r Şehi̇r Hastanesi̇nde İzole Edi̇len Üri̇ner Si̇stem Patojenleri̇ Ve Anti̇bi̇yoti̇k Di̇renç Profi̇lleri̇ni̇n Değerlendi̇ri̇lmesi̇*

KALYONCU

¹

,

Koçoğlu

²

,

Özekinci

³

et al. 2023

ANKEM Dergisi

3

0

View full text Add to dashboard Cite

İdrar yolu enfeksiyonları, dünyada ve ülkemizde tüm yaş gruplarında karşımıza en sık çıkan enfeksiyonlardır. Kültür sonuçlarının çıkması 24 saati geçmesi nedeniyle, komplikasyon riskini azaltmak amacı ile ampirik tedavi tercih edilmektedir. Ampirik tedavi kullanımı antimikrobiyal ilaçların uygunsuz ve sık kullanımına neden olması, bölgenin antimikrobiyal direncinin bilinmesini gerekli kılmaktadır. Bu çalışmada İstanbul Medeniyet Üniversitesi Göztepe Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’nda izole edilen üriner sistem enfeksiyonu etkenlerinin incelenmesi ve bu etkenlerin antibiyotik duyarlılıklarının retrospektif olarak belirlenmesi amaçlanmıştır. Hastanemiz laboratuvarına 01 Ocak 2017 – 31 Aralık 2021 tarihleri arasında idrar yolu enfeksiyonu şüphesiyle gönderilen örnekler çalışmaya dahil edilmiştir. Örnekler rutin mikrobiyolojik standartlara göre laboratuvarda işlenmiş, mikroorganizmaların tanımlama ve antibiyotik duyarlılıkları otomatize sistemlerde yapılmıştır. Çalışma süresince laboratuvara gönderilen 154725 idrar örneğinden 35460’ında (%22.9) üreme olmuş, 21671’i (%14.0) anlamlı olarak değerlendirilmiştir. Bakteri üreyen (n=23324) numunelerin %57.6’sında Escherichia coli üremiştir. İkinci sıklıkla %14.6 ile Klebsiella pneumoniae ve üçüncü sıklıkta %9.4 ile Enterococcus faecalis gözlenmiştir. İdrar kültürlerinden en sık izole edilen mikroorganizmalar olan E. coli en yüksek oranda poliklinik hastalarında (%61.8), K. pneumoniae yoğun bakım hastalarında (%21.2) ve E. faecalis ise servis hastalarında (%14.2) gözlenmiştir. İki önemli nonfermenter patojen olan Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii ise beklendiği gibi yoğun bakım ünitesi hastalarında (%12.8 ve %7.0) daha sık gözlenmiştir. E. coli’nin en dirençli olduğu antibiyotik ampisilin (poliklinik için %63.0, servis için %74.3 ve yoğun bakım ünitesi için %76.0), K. pneumaniae’nın en dirençli olduğu antibiyotikler sefazolin(poliklinik için %61.9, servis için 84.0 ve yoğun bakım ünitesi için 90.0) ve sefepim(poliklinik için %45.1, servis için %71.8 ve yoğun bakım ünitesi için %80.4) olarak tespit edilmiştir. P. aeruginosa’nın en dirençli olduğu antibiyotikler sırasıyla poliklinik ve servis hastalarında levofloksasin (%34.3,%28.4), yoğun bakım ünitesi hastalarında piperasilin/tazobaktamdır (%39.0). A. baumannii suşlarının poliklinik ve servis hastalarında en dirençli olduğu antibiyotik seftazidim (%41.1, %78.0) olarak bulunmuştur. Yoğun bakım ünitesi hastalarından izole edilen P.aeruginosa ve A. baumannii izolatlarında sırasıyla imipenem (A. baumannii için %100), piperasilin/tazobaktam (%39.0, %100) ve seftazidime (%19.0, %100) karşı yüksek direnç oranları saptanmıştır. Ayaktan ve yatan hastaların direnç profillerinin farklı olduğunun saptanması, hastane bazında direnç oranlarının bilinmesi kadar bölüm bazında da direnç oranlarının bilinmesinin önemini ortaya koymaktadır. Çalışmamız E. coli ve K. pneumoniae'nın idrar yolu enfeksiyonlarından izole edilen en yaygın patojenler olarak yerlerini koruduğunu ve yaygın olarak kullanılan antibiyotiklere direnç oranlarının yüksek olduğunu ortaya koymuştur.

show abstract

Evaluation of agents grown from urine culture and antibiotic susceptibility in patients followed up with the diagnosis of urinary system infection

Kılıç¹,

CESUR²,

Hatipoğlu³

et al. 2022

JTPM

0

View full text Add to dashboard Cite

Aim: In this study, it was aimed to determine the reproducing agents and the antibiotic susceptibility of the agents in a total of 89 urine samples cultured in Ankara Training and Research Hospital, Infectious Diseases and Clinical Microbiology laboratory during the 6-month period between 2021-2022. Material and Method: While growth was detected in urine culture in 68 (76%) of 89 urine samples taken in the study, no growth was found in 21 (24%) of them. Antibiotic susceptibility was studied on Mueller-Hinton agar by the disc diffusion method in isolates with growth in urine culture. Results: Reproducing factors are in order of frequency; 25 E. coli, 17 extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) positive E. coli, 10 Klebsiella pneumoniae, 3 Pseudomonas aeruginosa, 3 Proteus mirabilis, 3 Enterococcus faecalis, 1 Enterobacter cloacae, 1 Candida krusei, 1 Staphylococcus aureus, 1 patient E. coli and Proteus species were determined. Resistance rates in E. coli strains isolated from urine culture; 20% (4/20) for ciprofloxacin, 5% (1/19) for nitrofurantoin, 9.5% (2/21) for trimethoprim/ sulfamethoxazole (TMP/SMZ). No resistance was found to fosfomycin 0% (0/19) and to carbapenems (imipenem, meropenem, and ertapenem) (0/21). The resistance rates in ESBL positive E. coli strains are; 100% (13/13) for ciprofloxacin, 7% (1/14) for nitrofurantoin, 12.5% (1/8) for fosfomycin, 26.6% (4/15) for TMP-SMZ. No resistance was found to carbapenems (imipenem, meropenem and ertapenem). Conclusion: In our study, it was determined that the most common infectious agent causing urinary tract infection was E. coli. In our study, it was determined that the resistance rates for ciprofloxacin and TMP-SMZ, which are used in empirical treatment, are high, and the resistance rates for fosfomycin and nitrofurantoin are low in E. coli strains that cause urinary system infection. Due to the low rates of resistance in the empirical treatment of urinary system infections, it would be a suitable approach to prefer oral treatment options such as fosfomycin and nitrofurantoin in outpatients.

show abstract

Evaluation of agents grown from urine culture and antibiotic susceptibility in patients followed up with the diagnosis of urinary system infection

Kılıç¹,

CESUR²,

Hatipoğlu³

et al. 2022

JTPM

0

View full text Add to dashboard Cite

Aim: In this study, it was aimed to determine the reproducing agents and the antibiotic susceptibility of the agents in a total of 89 urine samples cultured in Ankara Training and Research Hospital, Infectious Diseases and Clinical Microbiology laboratory during the 6-month period between 2021-2022. Material and Method: While growth was detected in urine culture in 68 (76%) of 89 urine samples taken in the study, no growth was found in 21 (24%) of them. Antibiotic susceptibility was studied on Mueller-Hinton agar by the disc diffusion method in isolates with growth in urine culture. Results: Reproducing factors are in order of frequency; 25 E. coli, 17 extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) positive E. coli, 10 Klebsiella pneumoniae, 3 Pseudomonas aeruginosa, 3 Proteus mirabilis, 3 Enterococcus faecalis, 1 Enterobacter cloacae, 1 Candida krusei, 1 Staphylococcus aureus, 1 patient E. coli and Proteus species were determined. Resistance rates in E. coli strains isolated from urine culture; 20% (4/20) for ciprofloxacin, 5% (1/19) for nitrofurantoin, 9.5% (2/21) for trimethoprim/ sulfamethoxazole (TMP/SMZ). No resistance was found to fosfomycin 0% (0/19) and to carbapenems (imipenem, meropenem, and ertapenem) (0/21). The resistance rates in ESBL positive E. coli strains are; 100% (13/13) for ciprofloxacin, 7% (1/14) for nitrofurantoin, 12.5% (1/8) for fosfomycin, 26.6% (4/15) for TMP-SMZ. No resistance was found to carbapenems (imipenem, meropenem and ertapenem). Conclusion: In our study, it was determined that the most common infectious agent causing urinary tract infection was E. coli. In our study, it was determined that the resistance rates for ciprofloxacin and TMP-SMZ, which are used in empirical treatment, are high, and the resistance rates for fosfomycin and nitrofurantoin are low in E. coli strains that cause urinary system infection. Due to the low rates of resistance in the empirical treatment of urinary system infections, it would be a suitable approach to prefer oral treatment options such as fosfomycin and nitrofurantoin in outpatients.

show abstract

Evaluation of Resistance Rates of Escherichia coli Isolates of Urinary Tract Infection to Various Antibiotics

Cited by 3 publications

References 15 publications

İstanbul’da Bi̇r Şehi̇r Hastanesi̇nde İzole Edi̇len Üri̇ner Si̇stem Patojenleri̇ Ve Anti̇bi̇yoti̇k Di̇renç Profi̇lleri̇ni̇n Değerlendi̇ri̇lmesi̇*

İstanbul’da Bi̇r Şehi̇r Hastanesi̇nde İzole Edi̇len Üri̇ner Si̇stem Patojenleri̇ Ve Anti̇bi̇yoti̇k Di̇renç Profi̇lleri̇ni̇n Değerlendi̇ri̇lmesi̇*

Evaluation of agents grown from urine culture and antibiotic susceptibility in patients followed up with the diagnosis of urinary system infection

Evaluation of agents grown from urine culture and antibiotic susceptibility in patients followed up with the diagnosis of urinary system infection

Contact Info

Product

Resources

About