Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo

Moreira, Andreia; Gaspar, José Carlos; Camargo, Luís Eduardo Aranha; Kuniyuki, Hugo

doi:10.1590/s0100-41582004000200015

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“…A identidade de aad entre todos os isolados de GVB analisados variou de 95,4% a 100% (Tabela 2). Variabilidade entre isolados de GVA e GVB já havia sido verificada (MOREIRA et al, 2004a;MOREIRA et al, 2004b;NICkEL et al, 2002;FAJARDO et al, 2003), entretanto, sem considerar isolados provenientes do Nordeste brasileiro, identificados posteriormente.…”

Section: Resultsunclassified

“…A proteína capsidial é uma proteína estrutural, assim, fatores evolutivos poderiam restringir as variações que seriam deletérias para as três espécies virais. Alterações nas proteínas capsidiais poderiam, por exemplo, resultar na perda da capacidade de interação com vetores ou fatores da planta hospedeira e o fato do GVA, GVB e GLRaV-3 terem como única hospedeira natural a videira, poderia restringir ainda mais essas alterações (MOREIRA et al, 2004b).…”

Section: Resultsunclassified

“…'Isabel') e de países europeus, como França e Itália (principalmente cultivares de V. vinifera). Também, ao longo do tempo, ocorreu grande redistribuição de material propagativo e mudas de videiras entre regiões geográficas do Brasil, podendo isto ter contribuído para a redistribuição dos patógenos virais incidentes (MOREIRA et al, 2004b;PROTAS & CAMARGO, 2011). Assim sendo, os vírus constatados nas duas regiões amostradas no Nordeste brasileiro teriam chegado até estas regiões pelas vias mencionadas.…”

Section: Resultsunclassified

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Incidência de vírus em videiras no Nordeste brasileiro e caracterização molecular parcial de isolados virais locais

et al. 2015

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RESUMO Os objetivos deste trabalho foram identificar as espécies virais presentes em vinhedos comerciais de duas regiões do Nordeste do Brasil e realizar a caracterização molecular parcial de isolados de três espécies virais. A diagnose foi realizada por meio de RT-PCR em tempo real para a detecção de Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine leafroll-associated virus 2, 3 e 4 (GLRaV-2, -3 e -4), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine rupestris vein feathering virus (GRVFV) e Grapevine fanleaf virus (GFLV). Exceto para GFLV, os vírus avaliados estão amplamente disseminados nas áreas amostradas, frequentemente em altas incidências e em infecções múltiplas ABSTRACT The objectives of this study were to identify viral species infecting commercial vineyards in two regions of Northeastern Brazil and perform partial molecular characterization of isolates of three virus species. The diagnosis was performed by real time RT-PCR for detection of GRSPaV, GVA, GVB, GFkV, GRVFV and GFLV. Except for GFLV, the evaluated

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Section: Resultsunclassified

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Incidência de vírus em videiras no Nordeste brasileiro e caracterização molecular parcial de isolados virais locais

et al. 2015

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“…No Brasil, o GVA ocorre com incidência de 6,1% a 8,6% no Rio Grande do Sul (Fajardo et al, 2004) e em torno de 11% nos vinhedos paulistas (Kuniyuki et al 1997). O gene da proteína capsidial do isolado paulista do GVA (GVA-SP) já foi seqüenciado mostrando alta identidade com isolados da África do Sul e Itália (Moreira et al, 2004b).…”

unclassified

Detecção do Grapevine virus A e Grapevine virus B por hibridização "dot-blot" com sondas moleculares não radioativas

2005

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do Grapevine virus A e Grapevine virus B por hibridização "dot-blot" com sondas moleculares não radioativas. Fitopatologia Brasileira 30: 538-542. 2005. RESUMOO vírus A da videira (Grapevine virus A, GVA) e o vírus B da videira (Grapevirus virus B, GVB) estão associados à acanaladura do lenho de Kober ("Kober stem grooving") e ao fendilhamento cortical da videira ("grapevine corky bark"), respectivamente. Este trabalho descreve o uso de sondas moleculares de cDNA na detecção de isolados do GVA (GVA-SP) e do GVB (GVB-C-SP e GVB-I-SP) em videiras (Vitis spp.) e fumo (Nicotiana occidentalis). As sondas marcadas com digoxigenina foram produzidas por RT-PCR utilizando oligonucleotídeos específicos para os genes da proteína capsidial. Os RNA totais foram extraídos de 45 plantas de diversas variedades de videira e de 13 plantas de fumo inoculadas mecanicamente com o GVB. Os RNA extraídos das plantas infetadas, indexadas biologicamente, hibridizaram com as sondas, não se verificando reação com plantas sadias. Para confirmar os resultados de hibridização, foram também feitos testes de RT-PCR. A utilização de hibridização "dot-blot" com sondas de cDNA mostrou-se eficaz na detecção dos vírus com especificidade e sensibilidade, ressaltando-se que, preferencialmente, folhas maduras e ramos dormentes devem ser utilizados nos testes diagnósticos para o GVB e GVA, respectivamente.Palavras-chave adicionais: Vitis, Vitivirus, fendilhamento cortical da videira, "grapevine cork barky", acanaladura do lenho de Kober, "Kober stem grooving". ABSTRACT Detection of Grapevine virus A and Grapevine virus B by dot blot hybridization with non-radioactive molecular probesGrapevine virus A (GVA) and Grapevine virus B (GVB) are involved in the Kober stem grooving and grapevine corky bark diseases, respectively. This work reports the molecular detection of isolates of GVA (GVA-SP) and GVB (GVB-C-SP and GVB-I-SP) in grapevines (Vitis spp.) and tobacco (Nicotiana occidentalis) by non-radioactive molecular probes. The digoxigenin-labeled probes were generated by RT-PCR using specific primers to the coat protein genes. Total RNA was extracted from 45 plants of several grapevine varieties and from 13 plants of tobacco mechanically inoculated with GVB. The RNA extracted from infected plants, considered infected by biological indexing, reacted to the cDNA probes while there was no hybridization with healthy plants. These results were also confirmed by RT-PCR experiments. The use of the cDNA probes hybridization was proved to be efficient in detecting both GVA and GVB with high specificity and sensitivity. However, mature leaves and dormant cuttings should be preferably used in diagnostic tests of GVB and GVA, respectively.

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“…(MOREIRA et al, 2004a;MOREIRA et al, 2004b). As ORFs clonadas no vetor foram inseridas utilizando-se as enzimas de restrição BamHI e HindIII.…”

Section: Objetivo Geralunclassified

"Estudo de arboviroses em pacientes positivos para malária da região Amazônica"

Santana¹

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Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo

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Detecção do Grapevine virus A e Grapevine virus B por hibridização "dot-blot" com sondas moleculares não radioativas

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