Inoculation of soil with cadmium-resistant bacterium Delftia sp. B9 reduces cadmium accumulation in rice (Oryza sativa L.) grains

Liu, Yuling; Tie, Boqing; Li, Yuanxinglu; Lei, Ming; Wei, Xiangdong; Liu, Xiaoli; Du, Huihui

doi:10.1016/j.ecoenv.2018.07.081

Cited by 79 publications

(26 citation statements)

References 45 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Taxonomically, this genus belongs to the Comamonadaceae family within the Burkholderiales order of the Betaproteobacteria class. Currently, it comprises five species: D. acidovorans, D. tsuruhatensis, D. lacustris, D. litopenaei, and D. deserti [37]. Delftia sp.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

“…In addition, the Delftia sp. genome sequencing (6-6.7 Mb, GC content of approximately 66%) proved that particular genetic elements are involved in diverse biodegradation pathways and resistance to heavy metals [37,40], production of phytohormones and siderophores [33], and production of antimicrobial compounds [41]. In 2013, Johnston et al [42] reported that D. acidovorans exhibited resistance against gold by producing a secondary metabolite allowing biomineralization of the metal from liquid.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

See 1 more Smart Citation

The Study on the Cultivable Microbiome of the Aquatic Fern Azolla Filiculoides L. as New Source of Beneficial Microorganisms

et al. 2019

View full text Add to dashboard Cite

The aim of the study was to determine the still not completely described microbiome associated with the aquatic fern Azolla filiculoides. During the experiment, 58 microbial isolates (43 epiphytes and 15 endophytes) with different morphologies were obtained. We successfully identified 85% of microorganisms and assigned them to 9 bacterial genera: Achromobacter, Bacillus, Microbacterium, Delftia, Agrobacterium, and Alcaligenes (epiphytes) as well as Bacillus, Staphylococcus, Micrococcus, and Acinetobacter (endophytes). We also studied an A. filiculoides cyanobiont originally classified as Anabaena azollae; however, the analysis of its morphological traits suggests that this should be renamed as Trichormus azollae. Finally, the potential of the representatives of the identified microbial genera to synthesize plant growth-promoting substances such as indole-3-acetic acid (IAA), cellulase and protease enzymes, siderophores and phosphorus (P) and their potential of utilization thereof were checked. Delftia sp. AzoEpi7 was the only one from all the identified genera exhibiting the ability to synthesize all the studied growth promoters; thus, it was recommended as the most beneficial bacteria in the studied microbiome. The other three potentially advantageous isolates (Micrococcus sp. AzoEndo14, Agrobacterium sp. AzoEpi25 and Bacillus sp. AzoEndo3) displayed 5 parameters: IAA (excluding Bacillus sp. AzoEndo3), cellulase, protease, siderophores (excluding Micrococcus sp. AzoEndo14), as well as mineralization and solubilization of P (excluding Agrobacterium sp. AzoEpi25).

show abstract

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

The Study on the Cultivable Microbiome of the Aquatic Fern Azolla Filiculoides L. as New Source of Beneficial Microorganisms

et al. 2019

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Further studies on factors influencing the Hg remediation efficiency and corresponding optimization are required. Biochar amendment or bacterial inoculation has reduced plant uptake of heavy metals such as Cd, Cu and Cr (Arshad et al ., ; Li et al ., , ; Liu et al ., ), but to the best of our knowledge, this report is the first concerning the feasibility of remediating Hg‐contaminated soil from the view of Hg volatilization and reduction in Hg bioavailability.…”

Section: Resultsmentioning

confidence: 90%

Reduction in Hg phytoavailability in soil using Hg‐volatilizing bacteria and biochar and the response of the native bacterial community

Chang

Qinye

Dong

et al. 2019

Microbial Biotechnology

View full text Add to dashboard Cite

Summary Biological approaches are considered promising and eco‐friendly strategies to remediate Hg contamination in soil. This study investigated the potential of two ‘green’ additives, Hg‐volatilizing bacteria (Pseudomonas sp. DC‐B1 and Bacillus sp. DC‐B2) and sawdust biochar, and their combination to reduce Hg(II) phytoavailability in soil and the effect of the additives on the soil bacterial community. The results showed that the Hg(II) contents in soils and lettuce shoots and roots were all reduced with these additives, achieving more declines of 12.3–27.4%, 24.8–57.8% and 2.0–48.6%, respectively, within 56 days of incubation compared to the control with no additive. The combination of DC‐B2 and 4% biochar performed best in reducing Hg(II) contents in lettuce shoots, achieving a decrease of 57.8% compared with the control. Pyrosequencing analysis showed that the overall bacterial community compositions in the soil samples were similar under different treatments, despite the fact that the relative abundance of dominant genera altered with the additives, suggesting a relatively weak impact of the additives on the soil microbial ecosystem. The low relative abundances of Pseudomonas and Bacillus, close to the background levels, at the end of the experiment indicated a small biological disturbance of the local microbial niche by the exogenous bacteria.

show abstract

“…Род Delftia, напротив, чаще находили в более молодых реплантоземах участков ¹ 2 и ¹ 3. Его наличие связывают с активными процессами биоремедиации в почвах (46,47). Второй по численности представителей ОТЕ была фила Actinobacteria (классы Actinobacteria, Thermoleophillia и MB-A2-108).…”

Section: индексыunclassified

Микробиом Почв Кингисеппского Месторождения Фосфоритов При Разных Типах Горнотехнической И Биологической Рекультивации

Kimeklis¹,

Дмитракова²,

Pershina³

et al. 2020

S-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

Микробный состав нарушенных почвенных покровов после рекультивации может указывать на степень восстановления и характер протекающих в них процессов, а также на пригодность таких почв для дальнейшего использования в сельскохозяйственном обороте. Кингисеппский карьер по добыче фосфоритов разрабатывался в 1960-е годы, а в конце 1970-х была проведена его горнотехническая рекультивация. Уникальность этого объекта в том, что мониторинг почвенных показателей здесь ведется уже на протяжении 29 лет, а при рекультивации использовались три разные древесные породы-ель, лиственница и сосна, причем на участке с елью глыбистую массу разравнивали с внесением торфяно-минеральной смеси, тогда как при высаживании лиственницы и сосны использовали минеральный субстрат без торфа. Однако анализ микробного состава почвенного покрова на рекультивационных площадках до сих пор не проводился. В представленном исследовании мы показали, что структура изученного почвенного микробиома не зависела от физико-химических параметров почв, разнообразие почвенного микробиома не коррелировало с основными минеральными элементами питания, а доминирующая растительная порода существенно не повлияла на структуру микробиома. Целью работы было изучение почвенного микробиома на рекультивационных площадках Кингисеппского карьера с использованием методов высокопроизводительного секвенирования ампликонных библиотек гена 16S рРНК, а также поиск связи состава микробиома с типом рекультивации и физико-химическими параметрами почв. На трех участках провели описание растительного покрова и почвенных разрезов и отобрали пробы для определения физико-химических параметров почвы и выделения ДНК. Учитывали гранулометрический состав образцов, pH, величину субстрат-индуцированного и базального дыхания, содержание органического углерода, подвижных соединений фосфора и калия, обменного аммония и нитратов. Количественное содержание бактерий, архей и грибов определяли методом ПЦР в реальном времени (qPCR). При анализе микробных сообществ оценивали и -разнообразие, таксономическую структуру, а также взаимосвязь этих показателей с биохимическими параметрами почвы и растительным покровом. По результатам проведенных исследований, почвенные параметры были схожи для всех участков, а показатели базального и субстратиндуцированного дыхания оказались очень низкими-в пределах 0,02-0,05 мкг СО 2 /(гŁч). Участок под посадками ели показал более кислую реакцию почвенной вытяжки (pH 6,5), чем участки под лиственницей и сосной (соответственно pH 7,6 и 7,2). Тип растительности не оказался достаточно сильным экологическим фактором, и структура почвенных микробных сообществ на трех изученных участках мало различалась. Количественный состав микроорганизмов достоверно не различался между тремя опытными участками (за исключением более низкой численности архей в посадках ели). -Разнообразие сообщества прокариот на всех трех участках было также сходно, но почва под елями характеризовалась более высоким разнообразием актинобактерий. Во всех образцах доминировали филы Proteobacteria, Actinobacteria и ...

show abstract

Inoculation of soil with cadmium-resistant bacterium Delftia sp. B9 reduces cadmium accumulation in rice (Oryza sativa L.) grains

Cited by 79 publications

References 45 publications

The Study on the Cultivable Microbiome of the Aquatic Fern Azolla Filiculoides L. as New Source of Beneficial Microorganisms

The Study on the Cultivable Microbiome of the Aquatic Fern Azolla Filiculoides L. as New Source of Beneficial Microorganisms

Reduction in Hg phytoavailability in soil using Hg‐volatilizing bacteria and biochar and the response of the native bacterial community

Микробиом Почв Кингисеппского Месторождения Фосфоритов При Разных Типах Горнотехнической И Биологической Рекультивации

Contact Info

Product

Resources

About