A note on the distribution of genetic diversity of Anglo-Nubian goats in central-northern farms of Piauí, Brazil

Abstract

-The objective of this study was to characterize the genetic variability of Anglo-Nubian goats using microsatellite markers. The study was conducted using herds from four municipalities of Central-Northern Piauí (Teresina, José de Freitas, Campo Maior, and Angical), where technical information is scarce. Seven markers suggested by FAO were used (ILSTS11, McM527, INRA23, ETH10, OarfCB304, OarfCB48, and MAF209). The samples were genotyped using a 7% polyacrylamide gel. The average number of alleles per locus was 4.0, with observed and expected heterozygosity of 0.38 and 0.55, respectively. Few deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium were observed for each population. Only two loci deviated significantly in two localities. The coefficient of gene differentiation (G ST' ) indicated that 11.9% of the genetic variation was distributed among populations, and according to the coefficient of inbreeding (G IS = 0.23 and F IS = 0.23), there is a deficiency of heterozygotes within populations. These findings corroborate the Bayesian analyses performed with the STRUCTURE software, which revealed three distinct and moderately structured groups. The graphic analysis showed that Teresina and José de Freitas are isolated groups, while Angical and Campo Maior share most of their alleles. Despite this, the level of diversity among herds was low. Based on this genetic structure, exchange of reproducers among municipalities is recommended for the maintenance of the breed.

Diversity Analysis and Genetic Relationships among Local Brazilian Goat Breeds Using SSR Markers

“…The average heterozygosity observed in our study was higher than that reported by Silvestre et al [24] (0.385) in Nubian goats in Brazil. On the other hand, Hossam Mahmoud et al [23] obtained mean heterozygosity higher than 0.91, in the local Saudi Arabia goat breed.…”

Gestão zootécnica e genética informatizadas em pequenos ruminantes: uma revisão

“…Porém, nesta região predomina o sistema extensivo de criação, com baixa tecnificação e baixos resultados zootécnicos. Silvestre et al (2015) relataram que muitos produtores vêm buscando melhores índices produtivos e reprodutivos nos seus rebanhos. Para isto utilizam meios de seleção dentro da raça ou recorrem à utilização de mais de uma raça através de cruzamentos, que é uma opção de alterar a produção e produtividade do plantel de forma mais rápida.…”

Marcadores Microssatélites Para Caracterização Genética De Caprinos Da Raça Saanen Na Região Sul Do Estado Do Espírito Santo - Brasil

“…It is concluded that the protocol used for extracting was efficient of DNA for the species in question, necessitating further of new studies with markers microsatellite. KEYWORDS: Capra hircus, genetic diversity, molecular marker, genetic variability INTRODUÇÃO A caprinocultura é uma atividade de grande importância econômica e social no Brasil (SILVESTRE et al, 2015) e no mundo, devido a produção de leite e de corte, tornando os caprinos um dos principais animais de produção (SILVA et al, 2014a), havendo um crescente aumento quanto ao número de rebanhos e produtividade dos mesmos .…”

“…Os microssatélites são ainda utilizados para evidenciação de relações muito próximas entre populações, como os testes de paternidade (KALIA et al, 2011;SILVESTRE et al, 2015), os estudos de variabilidade genética (FERREIRA; GRATAPAGLIA, 1998), mapeamento genômico (SANTANA et al, 2012;TEIXEIRA, 2014) conservação das espécies (VIANNA, 2015).…”

“…Estudos de diversidade genética caprina por meio do uso de marcadores microssatélites têm sido realizados nos últimos anos no Brasil (MENEZES et al, 2006;ARAÚJO et al, 2010;MACIEL, 2011;LOPES, 2012;SILVESTRE, 2012;SILVESTRE et al, 2015). Contudo, a maioria das pesquisas ainda é realizada com ecótipos nordestinos, o que torna escassas as informações referentes aos rebanhos em outras regiões brasileiras.…”