Quantitative trait loci mapping for meat quality traits in swine chromosome 6

Abstract

The current study was carried out to perform QTL mapping on swine chromosome 6 (SSC6) associated to meat quality traits. The F2 population was produced by outbreed crossing using two native Brazilian breed Piau boars and 18 commercial sows. A total of 557 F2 animals were genotyped for 13 microsatellite markers. The traits evaluated on the F2 population were: pH measured 45 minutes and 24 hours post mortem (pH 45, pH24, respectively), drip loss (DL), cooking loss (CL), total loss (TL), intramuscular fat content (IMF), objective tenderness (OT), lightness (L), redness (A), yellowness (B), hue angle (h) and chrome (c). Data were analyzed by multiple regression developed for analysis of outbreed line crosses, using the QTL Express Software. Significant QTL were detected for pH45 and DL traits, and suggestive QTL for DL. QTL were not found for other traits. The pH45 and DL traits may be under the influence of one gene or a gene group located at about 76, 88 and 97cM. More markers should be included in the regions where F-value peaks and suggestive QTL for the DL trait were detected to ascertain whether they are real QTL.Keywords: QTL, outbreed cross, genetic, molecular marker, animal breeding RESUMO Realizou

Avaliação de características de qualidade da carne de suínos por meio de componentes principais

“…Van Oeckel et al (1999b) encontraram menor correlação negativa (P<0,001) entre pH 45 e perda de peso por gotejamento (-0,34) em relação ao valor encontrado neste trabalho (-0,66), o que pode ser resultado dos valores de pH 45 (5,86 naquele trabalho x 6,49 neste experimento), uma vez que, segundo Warris & Brown (1987) e Van Laack et al (1994), a correlação entre pH 45 e perda de peso por gotejamento é mais bem representada para valores de pH 45 superiores a 6,1. Pires et al (2005) encontraram QTLs significativos para as características pH 45 e perda de peso por gotejamento, sugerindo que os mesmos grupos gênicos podem estar atuando sobre ambas as caracterís-ticas. A existência de correlação entre pH 45 e perda de peso por gotejamento explica, em parte, o fato de a perda de peso por gotejamento ter sido sugerida para descarte.…”

Estimation models of variance components for farrowing interval in swine

“…For a genetic improvement program to be successful, the right statistical models must be used for estimating genetic parameters in the population. Thus, the models must cover both the genetic and the environment effects, which can affect the productive and reproductive traits of swine (Arouca et al, 2004;Arouca et al, 2005;Oliveira et al, 2005;Pires et al, 2005;Fraga et al, 2008;Pires et al, 2008). In the particular case of reproductive traits, there is no agreement in the literature as to which random effects should be utilized in the model for a real estimation of the genetic parameters of these traits in swine, and therefore individual evaluations have been necessary for each specific situation.…”

Progresso científico em melhoramento animal no Brasil na primeira década do século XXI

“…Segundo Band et al (2005a), esta F 2 foi produzida após cruzamento de fêmeas comerciais (Landrace x Large White e Landrace x Large White x Pietrain) com reprodutores da raça Piau e criada na Universidade Federal de Viçosa. Resultados de polimorfimos e seus efeitos são citados em Band et al (2005a) Quanto ao mapeamento de QTL em suínos, podem ser citados os achados de Silva et al (2008de Silva et al ( , 2009 no cromossomo quatro; Pires et al (2008) no cromossomo seis; Paixão et al (2008a,b) nos cromossomos 16, 17 e 18, alguns nunca antes mapeados; e Pires et al (2005Pires et al ( , 2006Pires et al ( , 2007 no cromossomo 6. Estes QTLs revelaram importante influência sobre muitas características de interesse econômico, como listado na Tabela 3.…”

“…Polimorfismo no Gene H-FABP Figueiredo et al (2008) Perdas por gotejamento, perdas por cozimento e perdas totais Polimorfismo no gene MYF5 Carmo et al (2005) Peso do coração, peso do pulmão, comprimento da carcaça, pH 24 horas Polimorfismo no gene GH Faria et al (2006) pós-abate e perdas por gotejamento Número total de tetas, peso aos 21, 63 e 77 dias de idade, consumo de ração, Polimorfismo no gene da Leptina Peixoto et al (2006) ganho médio diário de peso, conversão alimentar, profundidade do bacon e peso ao abate Peso aos 77 dias de idade QTL localizado no Cromossomo 4 Silva et al (2009) a gordura subcutânea, área do músculo longíssimus dorsi, QTL localizado no Cromossomo 4 Silva et al (2008) profundidade do lombo e peso do coração para peso de pernil limpo, peso de paleta, peso de lombo e peso do filezinho QTL localizado no Cromossomo 6 Pires et al (2008) Número de tetas, peso aos 63 e aos 77 dias de idade e peso QTL localizado no Cromossomo 16, 17 e 18 Paixão et al (2008a, b) aos 21 dias de idade e idade de abate, características de carcaça, peso de órgãos e qualidade de carne Consumo de ração, comprimento da carcaça, espessura de bacon, QTL localizado no Cromossomo 6 Pires et al (2005Pires et al ( , 2006Pires et al ( , 2007 peso do rim, pH45 e perdas por gotejamento…”