Análise de RAPD na identificação de cultivares: uma metodologia útil?

Abstract

Caracteres morfológicos têm sido utilizados tradicionalmente como assinaturas da identidade e pureza varietal e genética. Esses descritores se constituem em uma base pobre, por ser uma medida indireta da composição genética do material. Uma vez que caracteres moleculares revelam diferenças genéticas mais rapidamente, com maior precisão e sem o obscurecimento causado pelo efeito ambiental, oferecem vantagens significantes em termos de discriminação, confiabilidade, rapidez e custo reduzido. Um método molecular relativamente novo, DNA polimórfico amplificado ao acaso (RAPD), baseado na reação em cadeia da polimerase (PCR), tem sido adotado por alguns pesquisadores envolvidos no desenvolvimento de métodos de identificação de cultivares principalmente por ser uma técnica simples que não requer nenhuma informação prévia sobre seqüências de nucleotídeos do genoma da espécie, além de ser bastante acessível e de custo relativamente baixo. Mas, infelizmente, a análise de RAPD apresenta sérios problemas, principalmente em relação à reprodutibilidade e caracterização da homologia dos produtos. Se esses problemas podem ser efetivamente resolvidos então a análise de RAPD pode se tornar um método eficiente e aplicável, mas talvez o investimento em tempo e dinheiro seja mais útil no desenvolvimento e adaptação de técnicas mais promissoras. Há um grande volume de publicações sobre a técnica de RAPD na literatura, todas evidenciando o mesmo problema: a variabilidade inerente aos produtos de amplificações com primers decâmeros limita a sua utilização na indústria e em programas de certificação. O objetivo deste trabalho foi discorrer sobre a eficiência da técnica de RAPD na identificação de cultivares, ressaltando as suas vantagens e limitações.

Diferenciação molecular de cultivares elites de bananeira

“…Em alguns casos, ela é baseada na seleção de bandas e primers (Binneck et al, 2002) que, em experimentos posteriores, podem ser utilizados para confecção de marcadores do tipo SCAR. Neste trabalho, as cultivares FHIA-18, Caipira e FHIA-21 produziram um fragmento de banda específico com o primer OPH-04.…”

“…Entretanto, embora o emprego desse método seja valioso, há limitações em casos de cultivares aparentadas (Priolli et al, 2002), especificamente no que tange a cultivares resultantes do programa de melhoramento de bananeira da Embrapa, em que se usa um pequeno número de genitores femininos, que são muito próximos geneticamente. Além disso, esses descritores são influenciados pelo ambiente, são complexos em suas interações alélicas (Lombard et al, 2005) e constituem uma base pobre para medir a identidade, por apresentarem uma medida indireta da composição genética do material (Binneck et al, 2002).…”

RAPD markers in the discrimination of genetic variability in ornamental peppers

“…This factor can generate distinct and unstable bands since each primer has a specific site of homologous recognition in the genome in which more bands shall be produced (Larekeng et al, 2019). The number of bands can also vary according to factors such as primer complementarity and secondary structures in the DNA template strand (Binneck et al, 2002).…”

Tecnologias de rastreabilidade, segurança e controle de resíduos de agrotóxicos na cadeia produtiva de alimentos de origem vegetal: um estudo de revisão

“…Métodos de rastreamento baseados em código de barras de DNA são considerados sensíveis, rápidos, baratos e confiáveis para matérias-primas e produtos derivados de commodities alimentares, e para detectar alérgenos ou componentes venenosos, potencialmente, de ocorrência em matrizes alimentares (Galimberti et al, 2013;Galimberti et al, 2015). A maioria dos problemas associados a essa técnica está relacionada com a reprodutibilidade dos experimentos em diferentes laboratórios e semelhança de estruturas de diferentes organismos (homologia) (Binneck, Nedel & Dellagostin, 2002).…”