Caracterização do gene da proteína capsidial de dois isolados, patologicamente distintos e sorologicamente semelhantes, do Grapevine virus B em videiras no Estado de São Paulo

Moreira, Andreia; Gaspar, José Carlos; Camargo, Luís Eduardo Aranha; Kuniyuk, Hugo

doi:10.1590/s0100-41582004000100011

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“…A identidade de aad entre todos os isolados de GVB analisados variou de 95,4% a 100% (Tabela 2). Variabilidade entre isolados de GVA e GVB já havia sido verificada (MOREIRA et al, 2004a;MOREIRA et al, 2004b;NICkEL et al, 2002;FAJARDO et al, 2003), entretanto, sem considerar isolados provenientes do Nordeste brasileiro, identificados posteriormente.…”

Section: Resultsunclassified

Incidência de vírus em videiras no Nordeste brasileiro e caracterização molecular parcial de isolados virais locais

et al. 2015

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RESUMO Os objetivos deste trabalho foram identificar as espécies virais presentes em vinhedos comerciais de duas regiões do Nordeste do Brasil e realizar a caracterização molecular parcial de isolados de três espécies virais. A diagnose foi realizada por meio de RT-PCR em tempo real para a detecção de Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine leafroll-associated virus 2, 3 e 4 (GLRaV-2, -3 e -4), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine rupestris vein feathering virus (GRVFV) e Grapevine fanleaf virus (GFLV). Exceto para GFLV, os vírus avaliados estão amplamente disseminados nas áreas amostradas, frequentemente em altas incidências e em infecções múltiplas ABSTRACT The objectives of this study were to identify viral species infecting commercial vineyards in two regions of Northeastern Brazil and perform partial molecular characterization of isolates of three virus species. The diagnosis was performed by real time RT-PCR for detection of GRSPaV, GVA, GVB, GFkV, GRVFV and GFLV. Except for GFLV, the evaluated

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Section: Resultsunclassified

Incidência de vírus em videiras no Nordeste brasileiro e caracterização molecular parcial de isolados virais locais

et al. 2015

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“…No Brasil, o GVB ocorre com incidência de até 20% nos vinhedos do Estado de São Paulo (Kuniyuki & Costa, 1982) e superior a 60% em algumas plantações no Rio Grande do Sul (Kuhn, 1992). Nos vinhedos de São Paulo dois isolados desse vírus foram identificados: o isolado comum (GVB-C-SP) e o isolado Itália (GVB-I-SP) que são sorologicamente relacionados, mas apresentam sintomas distintos (Kuniyuki et al, 2000), estando o gene da proteína capsidial de ambos já seqüenciado (Moreira et al, 2004a).…”

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Detecção do Grapevine virus A e Grapevine virus B por hibridização "dot-blot" com sondas moleculares não radioativas

2005

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do Grapevine virus A e Grapevine virus B por hibridização "dot-blot" com sondas moleculares não radioativas. Fitopatologia Brasileira 30: 538-542. 2005. RESUMOO vírus A da videira (Grapevine virus A, GVA) e o vírus B da videira (Grapevirus virus B, GVB) estão associados à acanaladura do lenho de Kober ("Kober stem grooving") e ao fendilhamento cortical da videira ("grapevine corky bark"), respectivamente. Este trabalho descreve o uso de sondas moleculares de cDNA na detecção de isolados do GVA (GVA-SP) e do GVB (GVB-C-SP e GVB-I-SP) em videiras (Vitis spp.) e fumo (Nicotiana occidentalis). As sondas marcadas com digoxigenina foram produzidas por RT-PCR utilizando oligonucleotídeos específicos para os genes da proteína capsidial. Os RNA totais foram extraídos de 45 plantas de diversas variedades de videira e de 13 plantas de fumo inoculadas mecanicamente com o GVB. Os RNA extraídos das plantas infetadas, indexadas biologicamente, hibridizaram com as sondas, não se verificando reação com plantas sadias. Para confirmar os resultados de hibridização, foram também feitos testes de RT-PCR. A utilização de hibridização "dot-blot" com sondas de cDNA mostrou-se eficaz na detecção dos vírus com especificidade e sensibilidade, ressaltando-se que, preferencialmente, folhas maduras e ramos dormentes devem ser utilizados nos testes diagnósticos para o GVB e GVA, respectivamente.Palavras-chave adicionais: Vitis, Vitivirus, fendilhamento cortical da videira, "grapevine cork barky", acanaladura do lenho de Kober, "Kober stem grooving". ABSTRACT Detection of Grapevine virus A and Grapevine virus B by dot blot hybridization with non-radioactive molecular probesGrapevine virus A (GVA) and Grapevine virus B (GVB) are involved in the Kober stem grooving and grapevine corky bark diseases, respectively. This work reports the molecular detection of isolates of GVA (GVA-SP) and GVB (GVB-C-SP and GVB-I-SP) in grapevines (Vitis spp.) and tobacco (Nicotiana occidentalis) by non-radioactive molecular probes. The digoxigenin-labeled probes were generated by RT-PCR using specific primers to the coat protein genes. Total RNA was extracted from 45 plants of several grapevine varieties and from 13 plants of tobacco mechanically inoculated with GVB. The RNA extracted from infected plants, considered infected by biological indexing, reacted to the cDNA probes while there was no hybridization with healthy plants. These results were also confirmed by RT-PCR experiments. The use of the cDNA probes hybridization was proved to be efficient in detecting both GVA and GVB with high specificity and sensitivity. However, mature leaves and dormant cuttings should be preferably used in diagnostic tests of GVB and GVA, respectively.

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Grapevine Virus Diseases:economic Impact and Current Advances in Viral Prospection and Management

2017

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ABSTRACT-Grapevine (Vitis spp.) is a major vegetative propagated fruit crop with high socioeconomic importance worldwide. It is susceptible to several graft-transmitted agents that cause several diseases and substantial crop losses, reducing fruit quality and plant vigor, and shorten the longevity of vines. The vegetative propagation and frequent exchanges of propagative material among countries contribute to spread these pathogens, favoring the emergence of complex diseases. Its perennial life cycle further accelerates the mixing and introduction of several viral agents into a single plant. currently, approximately 65 viruses belonging to different families have been reported infecting grapevines, but not all cause economically relevant diseases. The grapevine leafroll, rugose wood complex, leaf degeneration and fleck diseases are the four main disorders having worldwide economic importance. In addition, new viral species and strains have been identified and associated with economically important constraints to grape production. In Brazilian vineyards, eighteen viruses, three viroids and two virus-like diseases had already their occurrence reported and were molecularly characterized. Here, we review the current knowledge of these viruses, report advances in their diagnosis and prospection of new species, and give indications about the management of the associated grapevine diseases. Index terms: Vegetative propagation, plant viruses, crop losses, berry quality, next-generation sequencing. VIROSES EM VIDEIRAS: IMPACTO ECONÔMICO E RECENTES AVANÇOS NA PROSPECÇÃO DE VÍRUS E MANEJO DAS DOENÇAS DE ORIGEM VIRALRESUMO-a videira (Vitis spp.) é propagada vegetativamente e considerada uma das principais culturas frutíferas por sua importância socioeconômica mundial. ela é suscetível a vários agentes transmitidos por meio da enxertia, os quais causam diversas doenças e significativas perdas na produtividade e produção, redução na qualidade dos frutos, no vigor da planta e na longevidade dos vinhedos. A propagação vegetativa e o frequente intercâmbio de material propagativo entre países contribuem para a disseminação destes patógenos, favorecendo a emergência de doenças complexas. Seu ciclo de vida perene acelera ainda mais a mistura e a introdução de vários agentes virais em uma mesma planta. Atualmente, aproximadamente 65 vírus pertencentes a diferentes famílias foram reportados infectando videiras, embora nem todos causem doenças economicamente relevantes. as viroses do enrolamento da folha, complexo do lenho rugoso, degenerescência e mancha-das-nervuras da videira são as quatro principais desordens que têm importância econômica mundial. Além disso, novas espécies e estirpes virais foram identificadas e associadas a limitações economicamente importantes para a produção de uvas. Em vinhedos brasileiros, dezoito espécies virais, três viroides e duas doenças semelhantes a viroses já tiveram sua ocorrência reportada e foram molecularmente caracterizados. aqui, nós revisamos o conhecimento atual dessas viroses, os recentes av...

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Caracterização do gene da proteína capsidial de dois isolados, patologicamente distintos e sorologicamente semelhantes, do Grapevine virus B em videiras no Estado de São Paulo

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Incidência de vírus em videiras no Nordeste brasileiro e caracterização molecular parcial de isolados virais locais

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