Seleção tradicional e associada a marcadores moleculares na avaliação genética animal

Abstract

Resumo -O objetivo deste trabalho foi comparar a seleção, utilizando valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP), BLUP marcadores (BLUPM) e pela seleção individual (SI), usando simulação com o programa Genesys. Para obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados cem marcadores moleculares do tipo microssatélite (SSR -Simple Sequence Repeat), por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclideana média para dados quantitativos. A fim de comparar os diferentes méto-dos, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Os ganhos ao longo das 20 gerações de seleção foram maiores para o BLUP em relação ao BLUPM, e este foi superior à SI. Quanto ao ganho obtido nas cinco primeiras gerações, o BLUPM apresentou ganhos semelhantes ao BLUP e superiores à SI. Diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados não revelaram diferenças em ganho genético nos métodos baseados no BLUP.Termos para indexação: BLUP, seleção fenotípica, simulação, sistemas de acasalamento. Traditional and associated selection with molecular markers in the genetic evaluation of animalsAbstract -The objective of this work was to compare selection based on breeding values predicted by classical best linear unbiased prediction (BLUP), BLUP associated with molecular markers (BLUPM) and individual selection (IS) using data simulated with the Genesys program. To obtain the genetic similarity matrix to be used in BLUPM, a hundred microsatellite markers (simple sequence repeats) were simulated using a similarity coefficient corresponding to the mean Euclidean distance between quantitative data. The different selection methods were compared using populations of an effective size of 66.66 and a mean of 30 repetitions, and mean phenotypic values were determined. Genetic gain obtained over 20 generations of selection was higher for BLUP than BLUPM, which in turn was superior to IS. Similar genetic gains were obtained for BLUPM and BLUP only when the gain for the first five generations was considered, and these gains were higher than those obtained with IS. Selected reproducers mating systems did not lead to differences in genetic gain for the BLUP-based methods.Index terms: BLUP, phenotype seletion, simulation, mating systems. IntroduçãoO objetivo do melhoramento animal é obter material genético com maior produtividade a menores custos. Dessa maneira, empresas de melhoramento conseguem manter a lucratividade e a sobrevivência num mercado cada vez mais competitivo. Para isso, é necessário conhecer a eficiência relativa de cada método de seleção e empregar o que proporciona maiores ganhos genéticos, a menores custos e no menor tempo possível.A simulação de dados tem sido muito usada pelos geneticistas, permitindo a comparação de métodos de seleção em situações nas quais a obtenção de dados reais seria impossível e com custos mais baixos, comparado a experimentos tradicionais.Ao longo dos anos, vários procediment...

Níveis de significância na identificação de marcadores moleculares no mapeamento genômico

“…Os processos de seleção favorecem a fixação de alelos (Carneiro et al, 2006). São considerados ganhos e perdas genéticas por fixação, quando loci com alelos favoráveis e alelos desfavoráveis são fixados, respectivamente, ou seja, alcançam frequência igual a 1 (Euclydes, 1996).…”

Comparação de metodologias de seleção sob oscilação genética

“…1, 2 e 3), diferenças claras com relação aos métodos de seleção, principalmente para as populações com médias de 10 repetições. De modo geral, a seleção baseada nos valores genéticos preditos pelo BLUP superou a dos valores genéticos preditos pelo BLUPM e este método, por sua vez, a SI, nos diferentes sistemas de acasalamento, confirmando os resultados obtidos por Carneiro et al (2006a). Estes indicam que, para dados de simulação, o uso de 10 ou mais repetições por geração, na comparação de metodologias, já seria aceitável, pois permitiria evidenciar diferenças entre os métodos de seleção.…”

“…A seleção foi praticada durante 20 gerações consecutivas utilizando-se seleção individual (SI) e valores genéticos preditos pelo BLUP (BLUP clássico) e pelo BLUP marcadores (BLUPM), em que se utilizou uma matriz de similaridade genética calculada por meio de marcadores moleculares (Carneiro et al, 2006a). Em todos os métodos foram consideradas 1, 10 e 30 repetições do processo de simulação (R1, R10 e R30).…”