Polymorphisms rs1333049 and rs10757278 are associated with SCD in men and rs499818 in the women aged over 50 years.

Цель. Оценить использование комплексной оценки информативности в Рос-сийской популяции генетических маркеров инфаркта миокарда, идентифици-рованных в полногеномных ассоциативных исследованиях. Материал и методы. Группа больных ИМ (200 человек) и контрольная группа (420 человек) были сформированы на основе популяционной выборки 45-69 летних жителей г. Новосибирска (9400 человек), которая была собрана в ходе работы по международному проекту HAPIee. Пациенты с инфарктом мио-карда, поступившие в блок интенсивной терапии ГКБ № 1 (160 человек). Лица, умершие внезапной сердечной смертью, подвергнутые судебно-медицин-скому исследованию (n=285). Группа долгожителей собиралась в ходе домаш-них визитов и среди пациентов домов престарелых г. Новосибирска (85 чело-век). Геномную ДНК выделяли из венозной крови и ткани миокарда методом фенол-хлороформной экстракции. Полиморфизм генов тестировали с по-мощью ПЦР в реальном времени в соответствии с протоколом фирмы произ-водителя (зонды taqMan, Applied Biosystems, UsA) на приборе ABI 7900Ht. В исследование были взяты следующие ОНП: rs499818, rs619203, rs10757278 и rs1333049 (хр. 9), rs1376251, rs2549513, rs4804611, rs17465637. Результаты. ОНП, которые на этапе отбора для исследования не имели суще-ственных различий, показали на нашей популяции очень разнородные резуль-таты. Два ОНП оказались тесно сцепленными rs10757278 и rs1333049 (хр. 9) и для дальнейшего анализа был оставлен rs1333049. Из семи других, только пять ОНП показали ассоциацию с ИМ разной степени надежности. Такие, как rs1333049 показали ассоциацию с ИМ на всех группах и подгруппах, другие только в отдельных группах, с ограничениями по полу и возрасту. rs2549513 и rs17465637 вообще оказались не ассоциированными с ИБс. Но при этом rs2549513 показал ассоциацию с показателями липидного и углеводного обмена, а также с выраженностью коронарного атеросклероза и неблагопри-ятным прогнозом в течение года после ИМ. Тогда как rs17465637 оказался только слабо ассоциированным с ИМТ. Заключение. Комплексный подход к изучению роли полиморфизма весьма трудоемок, но он дает достаточную уверенность в значимости полученных результатов, в их неслучайном характере, позволяет отобрать наиболее на-дежные, показавшие ассоциацию не только с основным патологическим фенотипом, но и его факторами риска.

Aim. To search for causal mutations in candidate genes responsible for the development of sudden cardiac death (SCD) in men who died under the age of 45.Material and methods. The SCD group (n=37) was formed using the criteria the World Health Organization and the European Society of Cardiology. Autopsy material was collected from men who died suddenly outside medical institutions and underwent forensic medical examination according to the standard protocol. Autopsy revealed no morphological changes that could explain sudden death. The mean age was 32,4±6,4 years. Genomic DNA was isolated from myocardial tissue using phenol-chloroform extraction. Clinical exome sequencing was performed. At first, we analyzed the results of sequencing of 24 genes, mutations in which lead to cardiovascular diseases associated with an increased risk of SCD: KCNQ1, KCNH2, SCN5A, AKAP9, ANK2, CACNA1C, CALM1, CALM2, CAV3, KCNE1, KNCJNE2, KCNE2, SCN4B, SNTA1, MYH2, APOB, KCNA5, TGFB3, NEB, PDX1, FLNC, PLEC, KCND3.Results. Of 37 samples, we revealed 13 probable pathogenic missense mutations in 9 samples (24,3%). Of 13 probable pathogenic variants, 5 were new.Conclusion. This pilot study provides following conclusions: it is necessary to continue molecular autopsy research in Russia; to increase the effectiveness of detecting causal mutations, it is necessary to reduce the age of patients with SCD included in the study; studying the families of deceased; cooperation of experienced specialists — forensic pathologist, laboratory geneticist, cardiologist.

We studied association of single-nucleotide SCN5A (rs1805124), GJA5 (rs35594137), and KCNN3 (rs13376333) polymorphisms and sudden cardiac death. Humans died suddenly from cardiac causes (N=379) and unrelated sex- and age-matched control subjects were genotyped. No significant intergroup differences were found in the frequency of rs1805124 and rs13376333 genotypes and alleles. In women under 50 years, enhanced risk of sudden cardiac death was associated with rs35594137 GG genotype (OR=3.6; 95%CI=1.2-10.4; p=0.022), while in older women it was associated with rs35594137 AA genotype (OR=3.0; 95%CI=2.3-3.9; p=0.041). In women under 50 years, GA rs35594137 genotype was associated with a protective effect against sudden cardiac death (OR=0.3; 95%CI=0.1-0.8; p=0.036). Thus, GJA5 gene rs35594137 polymorphism is significantly associated with sudden cardiac death in the examined group.