Background/aim: The association between polymorphisms of xenobiotic/drug metabolizing enzymes and TP53 and response to chemotherapy and survival of patients with nonsmall cell lung cancer (NSCLC) are limited and inconclusive. In this study, CYP2E1*5B, CYP2E1*6, CYP2E1*7B, GSTO1 (A140D), and TP53 (Arg72Pro) polymorphisms and response to platinum-based chemotherapy and survival in 137 advanced stage NSCLC patients were investigated.Materials and methods: Genetic polymorphism analyses were determined by polymerase chain reaction (PCR) coupled with restriction fragment length polymorphism (RFLP). Results:The patients with TP53 Pro/Pro variant were more likely to be resistant to chemotherapy than those with Arg/Arg variants with marginal significance (P = 0.066). We also analyzed these gene variants in combination with CYP1A1 (Ile462Val), CYP1B1 (Asn453Ser), GSTM1, GSTP1 exon 5 (Ile105Val), and GSTP1 exon 6 (Ala114Val) and GSTT1 polymorphic genes that we have previously genotyped in the same patients (Ada et al., Neoplasma, 57, 512-527, 2010). The multivariate analysis revealed that adjusted hazard ratio (HR) of death of the combined variant genotypes of TP53 (Arg72Pro, Pro72Pro) and CYP1A1 (Ile462Val, Val462Val) increased significantly as compared to wild-type genotypes (HR,

No abstract

No abstract

G protein eşlikli reseptör (GPER) ailesinden olan Kemokin reseptörlerinin birçok ilaç için hedef bölgesi teşkil ettikleri ve farklı hücre tiplerini aktive ederek çeşitli hastalıkların oluşmasında ve tedavisinde önemli roller oynadıkları bilinmektedir. Bu reseptörlerden biri olan CXCR3 kemokin reseptörünün kristalografik yapısının elde edilmiş olmaması CXCR3-ligand etkileşimlerinin açıklanmasını ve bu reseptöre yönelik ilaçların geliştirilmesini zorlaştırmaktadır. Yapılan çalışmalar, bu reseptörlerin özellikle hücre dışında bulunan N-terminal bölgesinin, bağlanma afinitesi ve reseptör seçiciliğinin belirlenmesinin yanı sıra sinyalleme faaliyetlerinin düzenlenmesinde de kritik roller oynadığını göstermiştir. Bu bölgenin doğal ligandlarıyla etkileşimi hakkında birçok çalışma olmasına rağmen, oldukça esnek bir yapıya sahip olan CXCR3’ün N-terminal bölgesinin katlanma mekanizması ve yapısal özellikleri henüz tam olarak analiz edilmemiştir. Bu nedenle, farklı konformasyonlar gösterebilen bu esnek yapının dinamik davranışlarını incelemek için bölgenin aminoasit sekanslarından yola çıkarak bilgisayarlı yöntemler ile modellenmesi büyük önem taşımaktadır. Bu amaçla çalışmamızda Moleküler Dinamik simülasyon yöntemiyle CXCR3’ün N-terminal bölgesinin aminoasit kompozisyonu modellenerek yapının 300 K sıcaklıkta sulu çözelti içindeki kararlılığı ve dinamik davranışları incelenmiştir. Sonuç olarak modellenen yapının iyi bir şekilde katlanarak kompakt bir form oluşturduğu ve bu yapısal oluşumda hidrojen bağlarının önemli rol oynadığı görülmüştür. Elde edilen bulguların gelecekteki muhtemel ilaç tasarım ve hedefleme çalışmalarına rehberlik etmesi beklenmektedir.