Recebido em 9/12/03; aceito em 1/9/04; publicado na web em 12/11/04 STRUCTURE AND PROPERTIES OF ELLIPTICINES. The ellipticines constitute a broad class of molecules with antitumor activity. In the present work we analyzed the structure and properties of a series of ellipticine derivatives in the gas phase and in solution using quantum mechanical and Monte Carlo methods. The results showed a good correlation between the solvation energies in water obtained with the continuum model and the Monte Carlo simulation. Molecular descriptors were considered in the development of QSAR models using the DNA association constant (log K app ) as biological data. The results showed that the DNA binding is dominated by electronic parameters, with small contributions from the molecular volume and area.Keywords: ellipticine; ab initio calculation; QSAR.
INTRODUÇÃOElipticinas (Figura 1) constituem uma ampla classe de compostos com atividade antitumoral 1 . Além da alta citotoxicidade em célu-las cancerosas, estas moléculas são especialmente interessantes do ponto de vista clínico devido aos efeitos colaterais reduzidos 2 . O modo de ação das elipticinas tem sido amplamente estudado, entretanto, conclusões definitivas sobre os aspectos moleculares relevantes para a ação biológica não foram ainda relatadas 3 . O núcleo molecular básico das elipticinas é constituído de um grupamento carbazol ligado a um anel piridina, propiciando a deslocalização eletrônica sobre toda a molécula. Esta estrutura relativamente simples tem permitido a síntese de mais de 70 análogos distintos 3 , com as principais modificações sendo a inclusão de um grupo hidroxila nas posições C 9 e C 7 , e alquilação das posições N 2 , N 6 e C 1 (ver Figura 1). Mais recentemente 4 , novas elipticinas substituídas em C 9 foram sintetizadas visando obter derivados com citotoxicidade seletiva.No presente trabalho, a estrutura e as propriedades moleculares de algumas elipticinas foram determinadas através de cálculos ab initio em fase gasosa. As energias de solvatação foram calculadas utilizando modelos contínuos de solvatação e simulação de Monte Carlo. A estrutura do solvente ao redor de alguns sítios das molécu-las foi analisada visando identificar características do processo de solvatação, específicas para os diferentes análogos. Na parte final do trabalho, modelos quantitativos de relação estrutura-atividade (QSAR) foram construídos e analisados.
METODOLOGIA DE CÁLCULOO conjunto de moléculas estudadas no presente trabalho é apresentado na Tabela 1. Estes análogos foram selecionados de acordo com a disponibilidade de parâmetros biológicos quantitativos 3 e características estruturais dissimilares dentro desta classe de moléculas. Para cada composto descrito na Tabela 1, a geometria foi completamente otimizada no nível HF/6-31G(d) e caracterizada como mínimo verdadeiro na Superfície de Energia Potencial (PES) através do cálcu-lo de freqüências harmônicas. Cargas atômicas ChelpG (Q), momento de dipolo elétrico (µ) e energias dos orbitais moleculares de fronteira (HOMO e ...
This paper presents a method for triangular surface remeshing to obtain new faces whose edge lengths are as close as possible to a target value m. The process uses as input a 2-manifold mesh with arbitrary geometry and topology. The proposed algorithm runs iteratively, automatically adjusting the necessary amount of vertices, and applies a global relaxation process using a variation of Laplace-Beltrami discrete operator. We introduce geometry constraints in order to preserve salient features of the original model. The method results on a grid with edge lengths near to m with low standard deviation, i.e. the vertices are uniformly distributed over the original surface. The dual space of the final triangular surface results in a trivalent, mostly hexagonal mesh, suitable for several applications.
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