INovas características para diferenciação de cultivares de soja pela análise discriminante New traits for differentiation of soybeans using discriminant analysis
INovas características para diferenciação de cultivares de soja pela análise discriminante New traits for differentiation of soybeans using discriminant analysis
ABSTRACT:The domestic dog (Canis familiaris) is the species of greatest morphological diversity among mammals. Seventy-four Labrador Retriever dogs-27 males and 47 females -were used in this experiment. Thirty quantitative biometric characteristics, related to morphology were measured. The objective of this study was to evaluate the morphometric traits of the Labrador Retriever breed to establish descriptive biometric attributes that may show sexual dimorphism through principal component analysis (PCA) and discriminant analysis (DA). The PCA was processed using all the variables and performing a pre-selection of the most correlated variables. The DA was performed for the 30 variables and also for the five most correlated variables with the first component (CP1), in order to classify new individuals. The PCA was able to identify sexual dimorphism in size, with both the 30 original variables as with the preselected variables, the latter optimized the reduction to two principal components. The DA was able to discriminate the two populations, both for 30 variables as for the five variables most correlated with the CP1. The functions with five variables can be used to classify other purebred dogs for sex, with an error of about 6.75%.
RESUMO -Utilizaram-se diferentes níveis de significância genômica na seleção assistida por marcadores para estimar o valor fenotípico, o número de marcadores usados na seleção e a porcentagem de alelos favoráveis e desfavoráveis fixados em uma característica quantitativa. Uma comparação entre os níveis de 0,5; 1; 2; 4; 6; 8; 10; 12; 14; 16; 18 e 20% foi realizada por meio do sistema computacional de simulação genética (GENESYS), utilizado na simulação de um genoma constituído de um caráter quantitativo de herdabilidade igual a 0,20. A partir da população inicial, procederam-se à avaliação dos doze níveis de significância, via seleção assistida por marcadores, por meio dos valores fenotípicos obtidos durante dez gerações. Aplicou-se o método de agrupamento por ligação composta adotando a distância Euclideana média como medida de dissimilaridade entre as significâncias genômicas. Há similaridade nos valores fenotípicos obtidos com os níveis de significância de 4 e 16%, que são superiores aos altamente significativos (0,5 a 2%) e aos extremamente sugestivos (18 e 20%), em razão dos ganhos fenotípicos obtidos ao longo das gerações sob seleção.Palavras-chave: análise multivariada, seleção assistida por marcadores, significância genômica, simulação Levels of significance on the identification of molecular markers in genomic mappingABSTRACT -Different levels of genomic significance were used in assisted selection by markers to estimate the phenotypic value, the number of markers used in the selection and the percentage of favorable and unfavorable alleles fixed in a quantitative characteristic. A comparison among the levels 0.5; 1; 2; 4; 6; 8; 10; 12; 14; 16; 18 and 20 was done by using the computer system of gene simulation (GENESYS), used for simulation of a genome consisted of a quantitative character with heritability equal to 0.20. From the initial population, the evaluation of the twelve levels of significance by selection assisted by markers was carried out using the phenotypic values obtained for 10 generations. The cluster method by composite link was applied by using the average Euclidean distance as dissimilarity measure among the genomic significances. There are similarities among the phenotypic values obtained with significance levels from 4 to 16%, which are superior to the highly significant (from 0.5 to 2%) and to the extremely suggestive levels (18 and 20%), because of the phenotypic gains obtained over generations under selections.Key Words: genomic significance, multivariate analysis, selection assisted by markers, simulation Revista Brasileira de Zootecnia IntroduçãoO melhoramento genético molecular visa integrar as metodologias e técnicas empregadas no melhoramento genético tradicional com as tecnologias e estratégias da biologia molecular (Dekkers & Hospital, 2002). Recentemente, passou a considerar e a utilizar diferentes ferramentas, também disponibilizadas pela ciência genômica (Borém et al., 2003).Os marcadores moleculares são sequências de DNA que podem ser identificadas e mapeadas e são uti...
RESUMO -Foram simulados diferentes tamanhos populacionais para estimar os valores fenotípicos na seleção assistida por marcadores para características quantitativas com valores de herdabilidade de 0,10; 0,40 e 0,70. Procedeu-se à análise de agrupamento com os desempenhos fenotípicos, cuja finalidade foi obter estruturas de classificação entre as amostras visando à otimização na detecção de QTL. O sistema de simulação genética (Genesys) foi utilizado para a simulação de três genomas (cada qual com uma única característica cuja distinção estava no valor da herdabilidade) e das populações base e inicial. Cada população inicial foi submetida à seleção assistida por marcadores por 20 gerações consecutivas, em que os genitores selecionados acasalavam-se seletivamente, entre os melhores e os piores. Essa estratégia seletiva de acasalamento mostrou-se eficiente na redução do número de indivíduos requeridos em uma população para mapeamento de QTL. À medida que aumenta a magnitude da herdabilidade, menores tamanhos populacionais são exigidos para manter similaridades nos incrementos
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