ABSTRACT. GENES is a software package used for data analysis and processing with different biometric models and is essential in genetic studies applied to plant and animal breeding. It allows parameter estimation to analyze biological phenomena and is fundamental for the decision-making process and predictions of success and viability of selection strategies. The program can be downloaded from the Internet (http://www.ufv.br/dbg/genes/genes.htm or http://www.ufv.br/dbg/biodata.htm) and is available in Portuguese, English and Spanish. Specific literature (http://www.livraria.ufv.br/) and a set of sample files are also provided, making GENES easy to use. The software is integrated into the programs MS Word, MS Excel and Paint, ensuring simplicity and effectiveness in data import and export of results, figures and data. It is also compatible with the free software R and Matlab, through the supply of useful scripts available for complementary analyses in different areas, including genome wide selection, prediction of breeding values and use of neural networks in genetic improvement.Keywords: software, statistical analysis, genetic analysis, quantitative genetics, biometry.GENES -software para análise de dados em estatística experimental e em genética quantitativa RESUMO. O programa GENES é um software destinado à análise e processamento de dados por meio de diferentes modelos biométricos. Seu uso é de grande importância em estudos genéticos aplicados ao melhoramento vegetal e animal, por permitir estimativa de parâmetros para entendimento de fenômenos biológicos e fundamentais em processo de tomada de decisão e na predição do sucesso e viabilidade da estratégia de seleção. O programa é obtido pela rede Internet (http://www.ufv.br/dbg/genes/genes.htm ou http://www.ufv.br/dbg/biodata.htm) e está disponível nos idiomas português, inglês e espanhol. Conta com literatura específica (http://www.livraria.ufv.br/) e um conjunto de arquivos de exemplos, tornando-o de fácil utilização. O GENES está integrado aos aplicativos MS Word, MS Excel e Paint permitindo importar dados e exportar resultados, dados e figuras de forma simples e eficiente. Está também integrado ao software livre R e ao aplicativo Matlab, por meio da disponibilização de scripts úteis para análises complementares em áreas diversas, incluindo seleção genômica ampla, predição de valores genéticos e uso de redes neurais no melhoramento genético.Palavras-chave: software, análise estatística, análise genética, genética quantitativa, biometria.
The main purpose of the GENES software is to help people working with genetic analysis and data processing in breeding programs, using several biometrics models. This software has several help windows that are very friendly to the user. More information about this program is available in the book" Programa GENES - Aplicativo Computacional em Genética e Estatística, 442. 1997". Purchase orders are welcome at the following address: editora@mail.ufv.br. Shareware copies of the GENES software are available at http://www.genetica.dbg.ufv.br.
RESUMO O programa GENES é um software destinado à análise e processamento de dados por meio de diferentes modelos biométricos. Seu uso é de grande importância em estudos genéticos aplicados ao melhoramento vegetal e animal, por permitir estimativa de parâmetros para entendimento de fenômenos biológicos e fundamentais em processo de tomada de decisão e na predição do sucesso e viabilidade da estratégia de seleção. O programa pode ser obtido pela rede Internet (http://www.genetica.dbg.ufv.br) ou por solicitação pelo endereço: Departamento de Biologia Geral, Universidade Federal de Viçosa, 36571-000 Viçosa, MG, Brasil. O programa conta com telas de ajuda, tornando-o de fácil utilização. Informações adicionais sobre seu uso estão disponíveis no livro" Programa GENES - Aplicativo Computacional em Genética e Estatística, 442, 1997" adquirido por E-mail enviado para editora@mail.ufv.br
ABSTRACT. The Genes Software is useful for analyzing and processing phenotypic and molecular data using different biometric models. In the current version we dispose routines to integrate it with three other softwares: the R, Matlab and Selegen. This version allows in plant and animal breeding complementary analyzes in several breeding research fields as genomic selection, prediction of genetic values, use of neural networks and Fuzzy logic. The Genes is important to estimate parameters for understanding biological phenomena necessary to make decisions and predict the success and viability of strategic selection. The original programme can be downloaded in Portuguese, English or Spanish with the specific literature from (http://www.livraria.ufv.br/) and the user guide from (http://www.ufv.br/dbg/genes/genes.htm and http://www.ufv.br/dbg/biodata.htm). The user has also support in the address www.facebook.com/ GenesNews. The Genes is also integrated in the application softwares MS Word, MS Excel and Paint to efficiently import data and export results as numbers and figures.Keywords: software, statistical analyses, genetic analyses, quantitative genetic, biometry.Programa Genes -Ampliado e integrado aos aplicativos R, Matlab e Selegen RESUMO. O programa GENES é um software destinado à análise e processamento de dados fenotípicos e moleculares por meio de diferentes modelos biométricos. Na versão atual estão disponibilizadas rotinas de integração com o software livre R e com os aplicativos Selegen e Matlab. Esta integração possibilita análises complementares em áreas diversas do melhoramento genético incluindo a seleção genômica ampla, predição de valores genéticos, o uso de redes neurais, e a lógica Fuzzy. O uso do programa Genes é de grande importância em estudos genéticos aplicados ao melhoramento vegetal e animal, por permitir obter estimativas de parâmetros para entendimento de fenômenos biológicos e fundamentais em processo de tomada de decisão e na predição do sucesso e viabilidade da estratégia de seleção. O programa é obtido pela rede Internet (http://www.ufv.br/dbg/genes/genes.htm ou http://www.ufv.br/dbg/biodata.htm) e está disponível nos idiomas português, inglês e espanhol. Conta com literatura específica (http://www.livraria.ufv.br/) e um conjunto de arquivos de exemplos, tornando-o de fácil utilização. O apoio ao usuário é feito via rede social no endereço www.facebook.com/ GenesNews. O programa GENES também está integrado aos aplicativos MS Word, MS Excel e Paint permitindo importar dados e exportar resultados, dados e figuras de forma simples e eficiente.Palavras-chave: aplicativo computacional, análise estatística, análise genética, genética quantitativa, biometria.
A acentuada interação genótipo x ambiente presente em muitas culturas faz com que estudos de adaptabilidade a ambientes específicos sejam parte integrante dos programas de melhoramento vegetal. A resposta diferenciada dos genótipos a ambientes favoráveis e desfavoráveis pode ser estudada utilizando metodologias baseadas em três estratégias principais: análise de variância, regressão linear e em estatísticas não-paramétricas. Este trabalho apresenta uma nova metodologia para estudo de interação genótipo x ambiente que se baseia na comparação de valores de distância cartesiana entre os genótipos e quatro referências ideais em uma dispersão de componentes principais, visando a facilitar a recomendação de genótipos. Esse método, chamado de método centróide, difere em relação aos métodos baseados em análise de variância por permitir o direcionamento dos cultivares em relação à variação ambiental e pela facilidade de identificação dos genótipos, dispensando a análise simultânea de vários parâmetros como nos métodos baseados em regressão. Para exemplificar sua aplicação, foram avaliados 25 genótipos provenientes de testes clonais de Eucalyptus grandis aos 74 meses de idade plantados em quatro ambientes em modelo fatorial e delineamento em blocos ao acaso com seis repetições, sendo que os efeitos de genótipos foram considerados fixos e os efeitos de blocos e ambientes aleatórios. Foram identificados quatro clones de boa adaptabilidade geral além de outros de adaptação específica a grupo de ambientes que também podem ser recomendados visando a capitalizar o efeito da interação. Os resultados foram comparados com os obtidos pela metodologia de regressão proposta por Eberhart e Russel (1966) e pelo método proposto por Lin e Binns (1988) e permitem concluir que o método centróide foi eficiente na identificação dos clones de Eucalyptus grandis avaliados de comportamento diferenciado entre os ambientes; associado à facilidade de recomendação e ordenamento dos genótipos a grupos de adaptabilidade específicos.
The aim of this work was to estimate the general and specific combining ability of peppers by measuring fruit quality and yield traits. This experiment was carried out on the garden field from Universidade Federal de Viçosa (UFV), Minas Gerais State-Brazil. Eight lines of Capsicum baccatum belonging to the UFV Horticultural Germplasm Bank were chosen based on their broad genetic and phenotypical background variation and then they were crossed in a complete diallel way. The F 1 seeds of the 56 hybrids and eight parents were planted in the field in a randomized complete block design. The data were submitted to ANOVA and the means were grouped by Scott-Knott test (P B 0.01). Significant variation for fruit quality and yield components was observed among parents and F 1 generation. Analysis of variance for the combining ability showed that GCA effects exhibited significant difference and SCA effects of the crosses were significant, except for the height of first bifurcation. For almost all characters both additive and non-additive effects influenced the performance of hybrids.
The hot peppers belonging to the species C. baccatum are completely restricted to Latin America and comprise the most popular hot pepper consumed as fresh or as processed paprika in Andean countries. The objective of this study was to characterize the phenotypic diversity among 40 landrace accessions of C. baccatum based on morphological fruit quality traits and yield components, and to determine the correlation between these characters and their contribution for the genetic variability. The accessions were analyzed for 14 fruit and plant descriptors. Plants were arranged as randomized complete block with three replicates. Collected data were initially subjected to analysis of variance and if the F-test was significant at P B 0.01, the averages were grouped by Scott-Knott criteria. The heritability in a broad sense and phenotypic correlation were calculated. The phenotypic divergence and relative importance were estimated by multivariate analysis. Significant differences for all traits were observed by F-test (P B 0.01). The range of heritability values were between 83.2 and 99.1. The landraces were grouped in seven different clusters. Major fruit width, fruit weight and fruit dry matter were the only fruit traits with positive correlation with yield. Plant width, height, first bifurcation height and fruit set were positive correlated between them and with yield. Based on the data, the most divergent accessions were 4 and 24, which could result in higher heterotic effect in eventual hybridizations between them. The results of this study showed that spice and vegetable type specific varieties can be developed from C. baccatum.
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