BackgroundMycoplasma hyopneumoniae, Mycoplasma flocculare and Mycoplasma hyorhinis live in swine respiratory tracts. M. flocculare, a commensal bacterium, is genetically closely related to M. hyopneumoniae, the causative agent of enzootic porcine pneumonia. M. hyorhinis is also pathogenic, causing polyserositis and arthritis. In this work, we present the genome sequences of M. flocculare and M. hyopneumoniae strain 7422, and we compare these genomes with the genomes of other M. hyoponeumoniae strain and to the a M. hyorhinis genome. These analyses were performed to identify possible characteristics that may help to explain the different behaviors of these species in swine respiratory tracts.ResultsThe overall genome organization of three species was analyzed, revealing that the ORF clusters (OCs) differ considerably and that inversions and rearrangements are common. Although M. flocculare and M. hyopneumoniae display a high degree of similarity with respect to the gene content, only some genomic regions display considerable synteny. Genes encoding proteins that may be involved in host-cell adhesion in M. hyopneumoniae and M. flocculare display differences in genomic structure and organization. Some genes encoding adhesins of the P97 family are absent in M. flocculare and some contain sequence differences or lack of domains that are considered to be important for adhesion to host cells. The phylogenetic relationship of the three species was confirmed by a phylogenomic approach. The set of genes involved in metabolism, especially in the uptake of precursors for nucleic acids synthesis and nucleotide metabolism, display some differences in copy number and the presence/absence in the three species.ConclusionsThe comparative analyses of three mycoplasma species that inhabit the swine respiratory tract facilitated the identification of some characteristics that may be related to their different behaviors. M. hyopneumoniae and M. flocculare display many differences that may help to explain why one species is pathogenic and the other is considered to be commensal. However, it was not possible to identify specific virulence determinant factors that could explain the differences in the pathogenicity of the analyzed species. The M. hyorhinis genome contains differences in some components involved in metabolism and evasion of the host’s immune system that may contribute to its growth aggressiveness. Several horizontal gene transfer events were identified. The phylogenomic analysis places M. hyopneumoniae, M. flocculare and M. hyorhinis in the hyopneumoniae clade.
A alface é a hortaliça folhosa mais comercializada no Brasil, é boa fonte de vitaminas e sais minerais, destacando-se seu elevado teor de vitamina A. É adaptada a clima ameno, sendo própria para cultivo no inverno quando atinge as maiores produções. A limitação do cultivo no verão é a baixa qualidade do produto que eleva o preço nesse período (Delistoianov, 1997 UFV, Depto. Fitotecnia, Para o cultivo hidropônico, têm sido encontradas boas alternativas comerciais, mesmo em mercados tradicionais, como as CEASAS. Com isso, enfatizou-se a qualidade associada à mercadoria. A alface cultivada em hidroponia, principal produto dessa linha, consegue preços superiores, mesmo quando comercializada na CEAGESP em engradados comuns. Seu preço fica entre 35 e 50% acima dos alcançados pelas cultivadas em sistemas tradicionais (Junqueira, 1999).Em cultivo hidropônico sob ambiente protegido, a alface não corre os riscos dos fatores adversos do meio ambiente, fica protegida de geadas, chuvas intensas, granizo e ventos fortes, com ganho na produtividade e qualidade, fatores que contribuem para o fornecimen- RESUMOForam avaliados a produtividade, acúmulo de nitrato e estado nutricional das cultivares de alface Regina, Babá de Verão e Grandes Lagos em cultivo hidropônico. O experimento foi conduzido no outono, de 25/03 a 20/05/99 em estufa da UFV. Foram avaliados dois conjuntos de fontes de nutrientes para compor as soluções nutritivas de crescimento vegetativo, que continham: 13,6; 1,0; 7,0; 4,48; e 2,5 mmol L para Fe, Mn, B, Zn, Cu e Mo, respectivamente. A solução 1 forneceu 21,9% de N na forma amoniacal, e a solução 2, 100% de N na forma de nitrato. As fontes de P empregadas foram fosfato monoamônico e fosfato monopotássico para as soluções 1 e 2 respectivamente, sendo que esta variação implicou no uso de diferentes quantidades de KCl nas soluções, o que proporcionou concentrações diferentes de Cl, apresentando-se 6,76 e 2,18 mmol L -1 para as soluções 1 e 2, respectivamente. O cultivo foi feito em recipiente plástico com 8L de capacidade, contendo três plantas. Os recipientes foram arranjados de modo que se obtivesse espaçamento de 0,22 m entre plantas. O delineamento experimental utilizado foi blocos ao acaso com seis repetições, em arranjo fatorial 2 x 3 (soluções x cultivares). Cada parcela foi constituída por três plantas. Foram avaliados o peso da matéria fresca da parte aérea, folhas, raízes e caule, número de folhas, comprimento do caule, porcentagem de matéria seca das folhas e estado nutricional da planta. A cv. Regina produziu 233 g planta . Os resultados obtidos para a cultivar Grandes Lagos não foram satisfatórios nas condições do experimento. A solução 1 proporcionou menores concentrações de nitrato para as cultivares Grandes Lagos (1082 mg kg -1 de matéria fresca) e Regina (1092 mg kg -1 de matéria fresca). As plantas apresentaram altas concentrações de Mn, mas sem sintomas de toxidez. Em geral, a nutrição das plantas foi adequada para os dois conjuntos de fontes de nutrientes testados. Palavras-chave:Lactuca sativ...
Glycolytic enzymes, such as fructose-bisphosphate aldolase (FBA) and enolase, have been described as complex multifunctional proteins that may perform non-glycolytic moonlighting functions, but little is known about such functions, especially in parasites. We have carried out in silico genomic searches in order to identify FBA and enolase coding sequences in Echinococcus granulosus, the causative agent of cystic hydatid disease. Four FBA genes and 3 enolase genes were found, and their sequences and exon-intron structures were characterized and compared to those of their orthologs in Echinococcus multilocularis, the causative agent of alveolar hydatid disease. To gather evidence of possible non-glycolytic functions, the expression profile of FBA and enolase isoforms detected in the E. granulosus pathogenic larval form (hydatid cyst) (EgFBA1 and EgEno1) was assessed. Using specific antibodies, EgFBA1 and EgEno1 were detected in protoscolex and germinal layer cells, as expected, but they were also found in the hydatid fluid, which contains parasite's excretory-secretory (ES) products. Besides, both proteins were found in protoscolex tegument and in vitro ES products, further suggesting possible non-glycolytic functions in the host-parasite interface. EgFBA1 modeled 3D structure predicted a F-actin binding site, and the ability of EgFBA1 to bind actin was confirmed experimentally, which was taken as an additional evidence of FBA multifunctionality in E. granulosus. Overall, our results represent the first experimental evidences of alternative functions performed by glycolytic enzymes in E. granulosus and provide relevant information for the understanding of their roles in host-parasite interplay.
Cancer/testis (CT) genes are excellent candidates for cancer immunotherapies because of their restrict expression in normal tissues and the capacity to elicit an immune response when expressed in tumor cells. In this study, we provide a genome-wide screen for CT genes with the identification of 745 putative CT genes. Comparison with a set of known CT genes shows that 201 new CT genes were identified. Integration of gene expression and clinical data led us to identify dozens of CT genes associated with either good or poor prognosis. For the CT genes related to good prognosis, we show that there is a direct relationship between CT gene expression and a signal for CD8+ cells infiltration for some tumor types, especially melanoma.
Além do valor como recurso terapêutico, plantas medicinais também possuem potencial para serem utilizadas como fonte de princípios ativos contra fitopatógenos. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de óleos essenciais das espécies medicinais Baccharis dracunculifolia (alecrim-do-campo), Schinus terebinthifolius (aroeirinha) e Porophyllum ruderale (arnica-brasileira) sobre o crescimento dos fungos fitopatogênicos Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli (Fop), F. solani f. sp. phaseoli (Fsp), Sclerotinia sclerotiorum (Ss), S. minor (Sm), Rhizoctonia solani (Rs), Sclerotium rolfsii (Sr) e Macrophomina phaseolina (Mp). Avaliou-se em placas de Petri o crescimento radial desses fungos em meio batata-dextrose-ágar (BDA) com cinco concentrações (0, 250, 500, 1000 e 3000 mg L-1) dos óleos essenciais. Discos de micélio (5 mm de diâmetro) de cada fungo em crescimento foram transferidos para placas de Petri que foram mantidas a 23°C no escuro por 48 horas. O óleo essencial de alecrim-do-campo foi o mais eficiente na redução do crescimento micelial de todos os fungos, com inibição completa quando se utilizou a concentração de 3000 mg L-1. A redução de crescimento variou de 29% (Fs) a 80% (Rs) a 250 mg L-1 do óleo essencial de alecrim-do-campo; a 500 mg L-1, variou de 29% (Fs) a 98% (Sr); e a 1000 mg L-1, de 41% (Fs) a 100% (Sr). A redução do crescimento dos fungos pelo óleo de aroeirinha na concentração de 3000 mg L-1 variou de 27% (Fsp) a 74% (Rs). Nessa concentração, o óleo de arnica-brasileira reduziu o crecimento micelial de Ss em 72%, o de Rs em 80% e o de Mp em 82%, sem efeitos significativos sobre o crescimento micelial de Fsp e Fop. Conclui-se que os óleos essenciais de alecrim-do-campo, aroeirinha e arnica-brasileira possuem potencial para o controle dos fungos fitopatogênicos estudados, com destaque para o óleo de alecrim-do-campo.
RESUMO: A adubação orgânica é uma alternativa para o cultivo de hortaliças como a alface, pois fornece nutriente e matéria orgânica ao solo. Assim, objetivou-se avaliar a produtividade e a exportação de nutrientes pela alface americana ‘Kaiser’ cultivada em solo adubado com fertilizantes orgânicos. A pesquisa foi realizada na Fazenda Experimental da EPAMIG, em Oratórios - MG, entre os meses de setembro e novembro de 2012. Utilizou-se o delineamento experimental em blocos ao acaso, com quatro repetições e 10 tratamentos, sendo estes: seis tipos de compostos orgânicos, esterco bovino, húmus de minhoca, lodo de águas residuárias da suinocultura e o controle (sem adubação). A aplicação dos fertilizantes orgânicos aumentou em 42% a produtividade da alface comparada ao controle. As maiores produtividades e massa fresca da parte aérea foram alcançadas com os seguintes fertilizantes orgânicos: bagaço de cana-de-açúcar + casca de café + esterco bovino + dejeto de suíno; bagaço de cana-de-açúcar + pseudocaule de bananeira + dejeto de suíno; pseudocaule de bananeira + casca de café + esterco bovino; e com o esterco bovino. Na exportação de nutrientes observou-se a seguinte ordem: N>K>Ca>P>Mg>S e Fe>Mn>Zn>Cu e as quantidades exportadas foram: 108,9; 104,9; 27,5; 23,6; 10,8; 6,9 kg ha-1 e 23,2; 3,0; 2,6; 0,4 g ha-1, respectivamente. A aplicação de fertilizantes orgânicos para o cultivo da alface americana ‘Kaiser’ aumenta a produtividade da cultura e reduz os impactos gerados pelo descarte indevido de resíduos orgânicos no ambiente.Palavras-chave: Lactuca sativa L., cultivo orgânico, compostos orgânicos, sustentabilidade, concentração de nutrientes.
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