The present study was designed to examine whether sex hormone polymorphisms proven by GWAS are associated with endometriosis risk. Unrelated female participants totaling 1376 in number (395 endometriosis patients and 981 controls) were recruited into the study. Nine single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which GWAS correlated with circulating levels of sex hormones were genotyped using a TaqMan allelic discrimination assay. FSH-lowering, and LH- and testosterone-heightening polymorphisms of the FSHB promoter (allelic variants A rs11031002 and C rs11031005) exhibit a protective effect for endometriosis (OR = 0.60–0.68). By contrast, the TT haplotype loci that were GWAS correlated with higher FSH levels and lower LH and testosterone concentrations determined an increased risk for endometriosis (OR = 2.03). Endometriosis-involved epistatic interactions were found between eight loci of sex hormone genes (without rs148982377 ZNF789) within twelve genetic simulation models. In silico examination established that 8 disorder-related loci and 80 proxy SNPs are genome variants affecting the expression, splicing, epigenetic and amino acid conformation of the 34 genes which enrich the organic anion transport and secondary carrier transporter pathways. In conclusion, the present study showed that sex hormone polymorphisms proven by GWAS are associated with endometriosis risk and involved in the molecular pathophysiology of the disease due to their functionality.
В работе приведены современные данные о генетических факторах развития эндометриоза, полученные в результате полногеномных исследований (genome-wide association study -GWAS). В настоящее время в литературе представлены результаты 15 GWAS-исследований, выполненных на выборках общим числом 44 612 больных и 247 145 включенных в контрольную группу, согласно которым подверженность этому заболеванию определяется примерно 30 генами-кандидатами. Ряд генов (WNT4, CDC42, GREB1, SYNE1, ESR1, IL1A, ETAA1, ID4, CDKN2B-AS1, VEZT) продемонстрировали значимую ассоциацию с эндометриозом в нескольких полногеномных исследованиях. При этом согласно данным исследований близнецов вклад наследственных факторов в формирование заболевания составляет около 50%, а GWAS-значимые гены-кандидаты объясняют лишь нескольким более 5% наследственности эндометриоза. Таким образом, проблема «недостающей наследственности» при эндометриозе (90% наследственных факторов остаются неизвестными) продолжает оставаться актуальной, что диктует необходимость продолжения активных исследований генетических основ заболевания в различных популяциях мира с последующим подтверждением полученных данных в репликативных исследованиях с использованием современных подходов функциональной геномики.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.