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*Autor a quien debe ser dirigida la correspondenciaRecibido May. 12, 2016; Aceptado Jun. 17, 2016; Versión final Ago. 9, 2016, Publicado Dic. 2016 Resumen Se evaluó durante liofilización y almacenamiento, el efecto de los prebióticos inulina y fructo-oligosacárido-FOS (25% p/v) sobre las propiedades fisicoquímicas de los polvos y la viabilidad de las cepas L. casei ATCC-393 y Lactobacillus rhamnosus ATCC-9469. La humedad, la actividad de agua y los recuentos de células viables no menores a 10 6 UFCg -1 fueron los criterios de estabilidad. Se evaluaron las propiedades de rehidratación (higroscopicidad, humectabilidad, solubilidad) y estructurales (tamaño de poro, área superficial). En el almacenamiento (20±2°C) se determinaron diferencias significativas en la supervivencia; para L casei fue de 70.49% a los 63 días y para L. rhamnosus fue 73.58% a los 98 días. Para ambos microorganismos la humedad y la actividad de agua se incrementaron por encima del 50%; el tamaño de poro se incrementó por la adición de los prebióticos y el área superficial (BET) reportó valores bajos. Se demostró que la inulina genera una mayor estabilidad al L. rhamnosus permitiendo su aplicación en alimentos funcionales con potencial simbiótico. Palabras clave: inulina, FOS, probiótico-prebiótico, encapsulación, liofilización Encapsulation of Probiotic by Freeze Drying in the Presence of Prebiotic AbstractDuring lyophilization and storage the effects of the prebiotics inulin and fructo-oligosaccharide-FOS (25% w/v) on the physicochemical properties of powders and the viability of the strains L. casei ATCC-393 y Lactobacillus rhamnosus ATCC-9469 were evaluated. Humidity, water activity and the viable cell counts not less than 10 6 CFUg -1 were the stability criteria. Properties of rehydration (hygroscopicity, wettability, solubility) and structural properties (pore size, surface area) were evaluated. Significant differences in survival during storage (20 ± 2 ° C) were determined. For L casei was 70.49% after 63 days and for L. rhamnosus was 73.58% after 98 days. For both microorganisms, the moisture and the water activity, increased above 50%; the pore size was increased by addition of prebiotics and the surface area (BET) reported low values. It is shown that inulin generates greater stability for L. rhamnosus, allowing its application in functional foods with symbiotic potential.