The fishes of the present study were collected in the headwater streams of the Sorocaba, Paranapanema and Ribeira de Iguape river basins during the dry period in 2010. A total of 2892 fishes, grouped in 53 species, were captured. The composition of the ichthyofauna captured in the streams of Sorocaba and Paranapanema river basin was greatly similar. On the other hand, the fish fauna of the streams of Ribeira de Iguape river basin were quite different from the ones captured in the others basins, with the occurrence of endangered species (Isbrueckerichthys epakmos and I. duseni) and exotic species (Misgurnus anguillicaudatus). The previous list of fish for the Sorocaba river basin increased with the addition of seven species of Characiformes, one Gymnotiformes and four Siluriformes.

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Aphyocheirodon hemigrammus é endêmica do Brasil e ocorre em ambientes lênticos, sobretudo lagoas marginais da bacia do alto rio Paraná, com a maior parte dos registros no estado de São Paulo. Como não foram detectadas ameaças significativas que coloquem em risco a sua população no futuro próximo, Aphyocheirodon hemigrammus foi categorizada como Menos Preocupante (LC).

se a espécie é autóctone da bacia do alto rio Paraná ou se se dispersão pela bacia ocorreu após o fechamento da barragem de Itaipu. Como não foram detectadas ameaças significativas que coloquem em risco a sua população no futuro próximo, Ageneiosus militaris foi categorizada como Menos Preocupante (LC).

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