Este estudo teve como objetivo identificar cepas de Vibrio parahaemolyticus isoladas de amostras de ostras e água e determinar seu perfil fenotípico (lipase, gelatinase, caseinase, fosfolipase, urease, amílases, DNase e beta-hemólise), genes de virulência (tdh, trh e ure) e de resistência antimicrobiana (blaSHV, blaTEM-1 e blaCTX-M). O potencial de virulência fenotípica de V. parahaemolyticus foi obtido, principalmente, para amilase (93,3%), gelatinase (83,3%) e fosfolipase (80%), com a presença do gene ure (23,3%) e ausência dos genes tdh e trh. V. parahaemolyticus foi resistente (96,7%) a pelo menos um antimicrobiano, com multirresistência mediada por plasmídeos em 53,3% das cepas. Apesar da ausência de enzimas β-lactamases, a presença dos genes nas cepas de V. parahaemolyticus isoladas da água [blaTEM (66,6%), blaCTX-M (91,6%)] foi maior do que nas amostras de ostras [blaTEM (33,3%), blaCTX-M (55,5%)]. Conclui-se que os dados fenotípicos e genotípicos para V. parahaemolyticus nem sempre são compatíveis, aumentando o risco de armazenamento e transmissão de genes de resistência propagados pelo consumo de frutos do mar contaminados.