This study investigated the epidemiology of canine ehrlichiosis in Northeastern Brazil, focusing the identification of the Ehrlichia species and vectors involved. Samples were collected from 472 domestic dogs residing in the health districts of Cajazeiras and Itapuã of Salvador city. The average prevalence of antibodies reactive to E. canis by immunofluorescent antibody test (IFAT) (titer ≥ 1:80) was 35.6% (168/472). Blood samples from the E. canis-seropositive animals were tested by nested PCR in order to identify the Ehrlichia species responsible for the infection. Among the seropositives, 58 (34.5%) were found to be PCR-positive for E. canis. Ticks were found in 32 dogs. Nested-PCR analysis showed that 21.9% (7/32) of the Rhipicephalus sanguineus were infected by E. canis. In both dogs and Rhipicephalus sanguineus, nested-PCR for E. ewingii and E. chaffeensis was negative, with no amplification of DNA fragment.Keywords: Ehrlichia, PCR, epidemiology. ResumoEste estudo objetivou pesquisar a epidemiologia da erliquiose canina no Nordeste do Brasil, com especial atenção na identificação da espécie de Ehrlichia envolvida nas infecções caninas e vetoriais detectadas. Para isso foram coletadas amostras de 472 cães domiciliados nos distritos sanitários de Cajazeiras e Itapuã. A prevalência de anticorpos anti-E. canis, pela imunofluorescência indireta (título ≥ 1:80), em cães foi de 35,6% (168/472). Os animais soropositivos foram analisados por uma nested-PCR para identificação da espécie de Ehrlichia responsável pela infecção. Dentre os positivos, 58 (34,5%) cães foram PCR-positivos para E. canis. Foram coletados e classificados os carrapatos em 32 cães. A nested-PCR de Rhipicephalus sanguineus resultou em 21,9% (7/32) de infecção por E. canis. A nested-PCR de amostras de sangue de cães e Rhipicephalus sanguineus para E. chaffeensis e E. ewingii foi negativa, não havendo amplificação de fragmento de DNA.