We describe the polymerase chain reaction (PCR) amplification of an 805 base pair fragment of 24S rRNA from the toxic dinoflagellate Dinophysis acuminata and the sequence of this fragment. We also describe a PCR-based assay for the specific detection of D. acuminata in seawater samples. Conserved primers, starting at positions 711 and 1489 of the 24S rRNA from the dinoflagellate Prorocentrum micans, were used for the PCR. The PCR product was cloned and sequenced. The fragment was aligned with rRNA sequences from other protists. Two oligonucleotides in variable domains of the sequence from D. acuminata were chosen and a protocol was defined for PCR-based detection of D. acuminata (30 cycles, 50°C). Experiments conducted with seawater samples led to the detection of D. acuminata in naturally contaminated samples. The PCR enabled us to detect down to 30 cells/L seawater. The problem of interference from large concentrations of other phytoplankton species may be solved using nested PCR.Résumé : Nous décrivons l'amplification d'un fragment de 805 paires de bases (pb) de l'ARN ribosomique 24S du dinoflagellé toxique Dinophysis acuminata. Nous décrivons également une méthode de détection par réaction de polymérisation en chaîne (PCR) de Dinophysis acuminata dans l'eau de mer. Les amorces conservées au cours de l'évolution, débutant en position 711 et 1489 sur l'ARN ribosomique 24S du dinoflagellé Prorocentrum micans, ont été utilisées pour la PCR. Le produit de la réaction a été cloné et séquencé. Un fragment de 805 pb a été obtenu puis aligné avec les séquences d'ARN ribosomique 24S d'autres espèces de protistes. Deux oligonucléotides ont été choisis dans les domaines variables de la séquence et un protocole a été mis au point afin de détecter l'espèce D. acuminata (30 cycles, 50°C). Les expérimentations réalisées avec l'eau de mer nous ont permis de détecter D. acuminata dans des échantillons naturellement contaminés. La PCR nous permet de détecter des concentrations aussi faibles que 30 cellules/L d'eau de mer. Les interférences avec la présence d'un nombre important d'autres espèces du phytoplancton peuvent être évitées par l'utilisation d'une PCR interne.
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